Aber die NBC wollte die Serie aus ihrem Programm haben. Um der Serie den Todesstoß zu geben wurde die Serie auf Freitag abend um 22.00 Uhr verlegt womit ein weiterer Zuschauerschwund vorprogramiert war. Aufgrund der Entscheidung von NBC zog sich Roddenberry als leitender Produzent zurück und übergab die Verantwortung an [[Fred Freiberger]]. Mitten in der dritten Staffel gab es einen Skandal in Star Trek. In der Folge "[[Platos Stiefkinder]]" [[Kuss|küßten]] sich Kirk und Uhura. Dies war der erste Kuss zwischen einem Weißen und einer Farbigen , der im amerikanischen Fernsehen ausgestrahlt wurde. Einge Bundesstaaten strahlten diese Folge aus Protest nicht aus. In einigen Regionalsendern in den Südstaaten der USA wurde die Folge bis heute nicht ausgestrahlt. Nach der Ausstrahlung von "[[Gefährlicher Tausch]]" wurde die Serie trotz vieler Fanproteste aus dem Programm genommen.