Der Nachfolger der zerstörten [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise''-D]] wird im Jahr [[2372]] gebaut und in Dienst gestellt. Das [[Kommandant|Kommando ]] übernimmt wieder [[Jean-Luc Picard|Captain ]] [[Jean-Luc Picard]]. Da sich viele Dinge in der Vergangenheit verändert haben, hat die neue ''Enterprise'' wesentlich mehr Erfolge im militärischen Bereich vorzuweisen, als die unmittelbare Vorgängerin.

Die USS ''Enterprise''-E ist das zweite Schiff der neuen [[Sovereign-Klasse|''Sovereign''-Klasse]] und wird als Ersatz für die zerstörte [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise''-D]] konstruiert und in Dienst gestellt. Sie wurde wie der [[Prototyp]] dieser Klasse, die [[USS Sovereign|USS ''Sovereign'']], auf der [[San Francisco Flottenwerft]] gebaut, die sich im [[Orbit ]] des [[Planet]]en [[Erde]] befindet. Auch diese neue ''Enterprise '' steht wieder unter dem [[Kommandant|Kommando ]] von [[Captain]] [[Jean-Luc Picard|Picard]] und verläßt [[2372]] die Werft, mit einem Großteil der alten [[Crew|Besatzung ]] an Bord.

Da sich die [[Föderation]] im späten [[24. Jahrhundert]] in einer dunkleren Zeitepoche befunden hat, weist die neue USS ''Enterprise'' massive Unterschiede im Vergleich zum Vorgänger auf. Dazu gehört beispielsweise die Tatsache, dass sie wesentlich mehr Erfolge im militärischen Bereich vorweisen kann, als in ihrer eigentlichen Aufgabe, der nämlich die Erforschung des Unbekannten.

* weitere [[Militärtechnologie|Waffensysteme ]] werden in das Schiff integriert

* neue [[Shuttle]]s des [[Typ 11 Shuttle|Typs 11]] werden auf der Enterprise dem Schiff stationiert

Im Jahr [[2373]] versucht ein weiterer [[Borg-Kubus]] die gesamte [[Mensch]]heit zu [[Assimilation|assimilieren]]. Während [[Admiral]] [[Hayes (Admiral)|Hayes]] eine Flotte im [[Typhon-Sektor]] mobilisiert, wird die neue USS ''Enterprise'' jedoch zur [[Romulaner|romulanischen]] [[Neutrale Zone|neutralen Zone]] abkommandiert. Das [[Sternenflottenkommando|Oberkommado ]] äußert nämlich Bedenken gegenüber [[Captain]] [[Jean-Luc Picard|Picard]], da er schon einmal von den [[Borg]] assimiliert worden ist.

Nach einer Diskussion mit seinen [[Führungsoffizier]]en auf der [[Brücke]] beschließt die [[Crew|Mannschaft]], den Befehl der [[Sternenflotte]] zu ignorieren und nimmt Kurs auf die [[Erde]]. Dort angekommen verläuft die der [[Schlacht von Sektor 001|SchlachtKampf]] schlecht für die Streitmacht Schiffe der [[Sternenflotte]]. Erst als Picard das [[Kommandant|Kommando ]] über die gesamte Flotte übernimmt, gelingt es allen Beteiligten, den Kubus durch gezielten Beschuß an einer bestimmten Schwachstelle vollständig zu zerstören. Jedoch kann sich kurz vor der Explosion eine kleinere [[Borg-Sphäre]] in Sicherheit bringen und setzt anschließend einen [[Zeitwirbel]] ein, um in die Vergangenheit zu reisen.

Die ''Enterprise'' nimmt daraufhin die Verfolgung auf und gelangt so in das Jahr [[2063]], dem Jahr, als die [[Phoenix|''Phoenix'']] ihren ersten erfolgreichen [[Warp]]flug unternehmen soll. Die Sphäre feuert wenig später auf eine alte Raketenbasis, die sich im Bundesstaat [[Montana]] in den [[USA]] befindet. Dadurch will das [[Borg-Kollektiv]] erreichen, dass der erste offizielle Kontakt zu den [[Vulkanier]]n nicht stattfinden kann. Durch Einsatz der neuen [[Quantentorpedo]]s kann die Sphäre durch gezielte Schüsse zerstört werden. Nach diesem Vorfall entscheidet sich Picard, auf der Erde nach dem Rechten zu sehen und sicherzustellen, dass der Flug der ''Phoenix '' unter allen Umständen stattfindetstattfinden muß. Als der Captain später zu seinem Schiff zurückkehrt, muss er feststellen, dass einige Borgdrohnen [[Borg-Drohne]]n die Zerstörung überlebt haben und nun dabei sind, die ''Enterprise '' sowie deren Crew vollständig zu assimilieren.

Währenddessen bereiten [[Commander]] [[William T. Riker|Riker]] und [[Chefingenieur]] [[Geordi La Forge|La Forge]] den Start der ''Phoenix '' vor. Zur gleichen [[Zeit ]] gelingt es Picard, den Vormarsch der Borg zu stoppen, wobei er allmählich seine Selbstbeherrschung verliert und der Besatzung befiehlt, unnötige Risiken einzugehen. [[Lily Sloane]] überzeugt ihn schließlich davon, diesen Weg nicht weiter zu verfolgen. Somit entschließt er sich, das Schiff zu evakuieren. Die ''Phoenix '' startet schließlich ihren [[Warpantrieb]] und erregt damit die Aufmerksamkeit eines [[Vulkanier|vulkanischen]] [[Forschungsschiff]]es. Captain Picard, der sich nun alleine auf dem Schiff befindet, steht kurze Zeit später der [[Borg-Königin]] im [[Maschinenraum]] gegenüber. Als [[Data]] absichtlich eine [[Plasmaleitung]] beschädigt, wird die Borg-Königin und all ihre Drohnen durch das ausströmende [[Plasmakühlmittel]] getötet und alle Borg an Bord verlieren ihr Leben. Der [[Erstkontakt ]] zu den Vulkaniern kann nun erfolgreich etabliert werden und die ''Enterprise '' kehrt wenig später durch einen künstlich erzeugten Zeitwirbel in das [[24. Jahrhundert]] zurück. (''"[[Star Trek: Der erste Kontakt]]"'').

Im Jahr [[2375]] wird die ''Enterprise '' während eines diplomatischen Treffens darüber informiert, dass [[Data]] auf dem [[Planet]]en [[Ba'ku (Planet)|Ba'ku]] außer Kontrolle geraten ist. Dabei hat er unter anderem den geheimen [[Ethnologischer Beobachtungsposten|ethnologischen Beobachtungsposten]] enttarnt.

Obwohl die ''Enterprise '' für diese sonderbare Region genannt [[Briar Patch]] nicht ausgerüstet ist, entscheidet sich Picard auf diesem Planeten nach dem Rechten zu sehen. Dort angekommen , gelingt es ihnen nach einer wilden Verfolgungsjagd mit einem [[Shuttle]] Commander Data festzusetzen. Nachdem er repariert worden ist, stellen sie einige Nachforschungen an, durch die sie unter anderem ein [[Tarnvorrichtung|getarntes]] [[Holoschiff]] in einem See Gebirgssee finden. Nach und nach beginnt das Puzzle sich zusammenzufügen und Picard erkennt das eigentliche Ausmaß dieser anfangs routinemäßig aussehenden verlaufenden Mission. Sie finden schließlich heraus, dass die [[Son'a]] mit [[Admiral]] [[Matthew Dougherty|Dougherty]] den Plan verfolgen, die [[Ba'ku]] heimlich mit dem gefundenen Holoschiff umzusiedeln. Der Grund dafür liegt an den geheimnisvollen Ringen, die den Planeten umgeben. Sie geben eine ungewöhnliche Strahlung ab, die den Alterungsprozeß immens verlangsamen kann.

Nun muss Captain Picard sich entscheiden, ob er der Gerechtigkeit zum Sieg verhilft, oder ob er den unmoralichen Befehl seines vorgesetzten Offiziers [[Offizier]]s befolgen soll. Er entscheidet sich letztlich dafür, die wehrlosen Ba'ku zu unterstützen, während [[Commander]] [[William T. Riker|Riker]] den Befehl erhält, mit der ''Enterprise '' den [[Föderationsrat]] wegen dieser ungewöhnlichen Situation zu kontaktieren. Als die Enterprise das Schiff versucht, den Briar Patch zu verlassen, wird sie von zwei [[Kriegsschiff]]en der Son'a angegriffen, die verbotene [[Subraumwaffe]]n zum Einsatz bringen. Erst durch eine brilliante Commander Riker ausgearbeitete [[Riker-Manöver|Strategie Commander Rikers ]] kann eines der beiden [[Son'a-Schlachtkreuzer|Schiffe ]] zerstört werden, während das andere hilflos im Weltall treibt. Währenddessen zerstört Captain Picard den [[Son'a-Kollektor]], wobei die ''Enterprise '' ihn in letzter Sekunde aus der Gefahrenzone hinaus [[Beamen|hinausbeamtbeamen]]. kann (''"[[Star Trek: Der Aufstand]]"'').

Im Jahr [[2379]] wird auf dem [[Planet]]en Planeten [[Romulus]] der gesamte [[Romulaner|romulanische]] [[Romulanischer Senat |Senat]] durch die gefährliche [[Thalaronstrahlung]] ausgelöscht. Das verhilft einen Mann namens [[Shinzon]] dazu, der neue romulanische [[Praetor]] des Reiches zu werden.

Unterdessen befindet sich die USS ''Enterprise'' auf dem Weg nach [[Betazed]], um eine Hochzeitszeremonie für [[Commander]] [[William T. Riker|Riker]] und [[Counselor]] [[Deanna Troi|Troi]] zu veranstalten. Nach Abschluß dieser Feierlichkeiten erhält [[Captain]] [[Jean-Luc Picard|Picard]] von [[Admiral]] [[Kathryn Janeway]] den Auftrag, diplomatische Beziehungen zum neuen romulanischen Praetor aufzunehmen. Während des Fluges nach Romulus orten die [[SensorenSensor]] en der ''Enterprise'' [[Computer|positronische]] Signale von einem unbekannten Planeten, der sich in der Nähe der [[Neutrale Zone|neutralen Zone]] befindet.

Als sie schließlich dort eintreffen, entdecken sie nach und nach mehrere verschiedenartige Bauteile, die eindeutig einem [[Android]]en zugeordnet werden können. Nach Rückkehr auf die ''Enterprise'' beginnen sie unverzüglich damit, dem den Androiden wieder Leben einzuhauchenzusammenzusetzen. Nach erfolgreicher Aktivierung identifiziert sich dieser Android als [[B-4]], ein unmittelbarer Vorläufer von Data.

Endlich Nachdem man auf Romulus angekommenist, treffen Picard und Shinzon das erste Mal aufeinander. Dabei wird auch das dunkle Geheimnis von Shinzon offenbart, als er sich als ein jüngerer [[Klon]] von Captain Picard zu erkennen gibt. Er war ursprünglich dafür vorgesehen, eines Tages den Platz von Picard zu übernehmen, aber die Romulaner ließen dieses Projekt vor langer Zeit einstellen. Stattdessen lebte er ein Leben als Sklave auf dem Nachbarplaneten [[Remus]], wo er in dem [[Remaner]] [[Viceroy]] einen treuen Verbündeten gefunden hatte. Nun möchte er als neuer Praetor sein älteres Ebenbild genauer kennenlernen und endlich Frieden mit der [[Föderation]] schließen.

Jedoch entpuppt sich diese Annäherung als eine Falle, um Picard in die Hände zu bekommen. Schuld daran ist ein [[Genetik|genetischer Effekt]] Deffekt, der nur durch das Blut von Captain Picard korrigiert werden kann. Somit [[Beamen|beamt]] er den Captain schließlich gegen seinen Willen auf die [[Scimitar|''Scimitar'']], um mit dem [[Medizin|medizinischen ]] Eingriff zu beginnen. Da Data aber vorher den Platz von B-4 eingenommen hat, ist er dadurch in der Lage, Picard zu befreien und mit ihm durch einen Jäger der [[Scorpion-JägerKlasse|''Scorpion''-Klasse]] zu fliehen.

Als die ''Enterprise'' versucht, mit Höchstgeschwindigkeit den [[Sektor 1045]] zu erreichen, wo bereits eine [[Omega-Kampfgruppe|Streitmacht]] der [[Sternenflotte]] die ''Enterprise '' erwartet, wird sie von der ''Scimitar '' eingeholt und beschossen. Dabei wird der [[Warpantrieb]] völlig zerstört und Picard muss sich nun im [[Bassen-Graben]] der wesentlich stärkeren Scimitar stellen. Da deren neue [[Tarnvorrichtung]] perfekt funktioniert, kann die ''Enterprise '' lediglich einige "Glückstreffer" landen.

Dann Während des [[Schlacht im Bassen-Graben|Kampfes]] erhält Captain Picard aber unerhofft Verstärkung durch zwei romulanische [[Warbird]]s des neuen [[Valdore-Typ|''Valdore''-Typs]], die unter dem Kommando von [[Commander ]] [[Donatra]] stehen. Dadurch kann ein vorübergehendes "Patt" erreicht werden, bis [[Shinzon]] durch eine List beide Warbirds kampfunfähig schießt. Da die [[Militärtechnologie|Verteidigungssysteme]] der ''Enterprise'' nicht mehr funktionsfähig sind, sieht Picard sieht keine andere Möglichkeit mehr, als durch einen "Rammangriff" die ''Scimitar '' außer Gefecht zu setzen. Das Unternehmen gelingt, wobei beide Schiffe schwerste schwere strukturelle Schäden erleiden. Shinzon aktiviert daraufhin die [[Thalaronstrahlung]], um die Enterprise das Sternenflottenschiff endgültig zu vernichten. Captain Picard beamt sich daraufhin an Bord der ''Scimitar '' und tötet schließlich Shinzon in einem Zweikampf. Anschließend erscheint Data und rettet dem Captain das Leben, indem er ihn zurück auf die ''Enterprise '' beamt. Schließlich richtet Data seinen [[Phaser Typ 2|Handphaser]] auf die Energiequelle [[Energie]]quelle und feuert, wodurch die ''Scimitar '' schließlich zerstört wird. Später wird die schwer beschädigte ''Enterprise '' geborgen und in der [[San Francisco Flottenwerft]] vollständig repariert. (''"[[Star Trek: Nemesis]]"'').

Die Diese neue ''Enterprise''-E wurde von [[John Eaves]] und [[Herman Zimmerman]] designt, während [[Rick Sternbach]] die Blueprints für diese neue Klasse [[Liste der Schiffsklassen der Föderation|Schiffsklasse]] ausgearbeitet hat.

Eaves und Zimmerman beaufsichtigten auch die Innenarchitektur der [[Brücke]], des [[Maschinenraum]]s, die Korridorsysteme, sowie auch weitere Sets aus der Serie "[[Star Trek: Voyager]]", die zeitgleich für die beiden Kinofilme [[Star Trek Filme|Filme]] "[[Star Trek: Der erste Kontakt]] " und "[[Star Trek: Der Aufstand]] " verwendet worden sind.

Für den Film "Star Trek: Der erste Kontakt " wurde noch ein großes physisches Modell verwendet, das unter der Aufsicht von [[John Goodson]] von der renomierten Firma [[Industrial Light and Magic]] gebaut wurde.

Bereits bei dem zweiten Kinofilm mit der neuen USS ''Enterprise'' wurde erstmals das alte Modell durch eine moderne [[CGI]]-Version ersetzt. In "[[Star Trek: Nemesis ]]" wurde die Brücke der ''Enterprise'' umgebaut: Viele Konsolen wurden verfinstert, um das Gesamtbild elegisch wirken zu lassen (Idee von [[Stuart Baird]]). Außerdem wurden unter dem Set Luftpolster eingebaut, die die Brücke bei "Einschlägen" von Waffenfeuer zum Beben brachten bringen sollten - bisher war dies durch das Schütteln der Filmkameras und den Imitationen von den Darstellern vorgetäuscht worden, doch die diese neuen Polster ließen alles viel realistischer wirken.

Desweiteren hat die dieses neue Enterprise Schiff in vielen Produktionen eine wichtige Hauptrolle eingenommen. Darunter befinden sich beispielsweise viele Computerspiele wie''"[[Star Trek: Armada]]''", ''"[[Star Trek: Armada II]]''", ''"[[Star Trek: Bridge Commander]]''", ''"[[Star Trek: Starfleet Command III]]'', " und ''"[[Star Trek: Elite Force II]]''".