Beginnend irgendwann im [[20. Jahrhundert]] brach ein Bürgerkrieg unter den Xindi aus. Über ein Jahrhundert war gekennzeinchnet gekennzeichnet von blutigen Konflikten und wechselnden Bündnissen. Solange, bis man sogar den Anlass für den Krieg vergass.

Schließlich zündeten die allierten alliierten Xindi-Insektoiden und -Reptilianer in den [[2030er]]n in einer vermeindlichen Verzweiflugstat Sprengsätze an den tektonisch instabilen Bruchstellen von Xindus und zerstörten den Planet völlig (''[[ENT]]: "[[Die Ladung]]"'').

Angehörige von fünf Xindi-Spezies konnten der Katastrophe entkommen. Nur die auf Xindus verbliebenen Avianer gelten heute als ausgestorben. So begann die Zeit der [[Große Diaspora|großen Diaspora]], in der die einzelnen Spezies innerhalb der Delphischen Ausdehnung umher reisten umherreisten und auf verschiedenen Planeten siedelten.Der Xindi-Philosoph [[Enarchis]] schrieb in den [[2100er]] Jahren zur Diasphora: "Ohne eine eigene Welt sind wir nichts weiter als Kinder, die sich in der Wildniss Wildnis verirrt haben" (''[[ENT]]: "[[Azati Prime]]"'').

Dies war auch die Zeit, als ihnen die Sphärenbauer, die von den Xindi "Beschützer " genannt werden, erschienen. Sie zeigten ihnen den Standort besiedelbarer Planeten und wertvoller Ressourcen. Sie forcierten die Einigung der verbliebenen Xindi und hatten maßgeblichen Anteil an der Gründung des [[Xindi-Rat]]es, einer Art Regierung mit Vertretern aller fünf Rassen. Obwohl es gerade zur Gründungszeit recht schwierige Sitzungen gab, hatte der Rat bis [[2154]] bestandBestand. Die Beschützer wurden von allen Xindi verehrt.