Die Sacajawea ist ein Shuttle vom Typ 6 der Föderation, welches auf der USS Voyager stationiert ist. Das Shuttle trägt die Nummer 05.
2373 nutzen Captain Kathryn Janeway und Neelix die Sacajawea, um eine mehrtägige Handelsreise zu den Tak Tak zu unternehmen. Auf den Rückflug finden die beiden die Voyager treibend in Sektor 38 vor. Die Crew wurde dort mit einem Makrovirus infiziert. Janeway und der Doktor finden einen Weg den Virus zu vernichten. Allerdings wird der Doktor von den Makroviren angegriffen und diese drohen seinen mobilen Emitter zu zerstören. Der Doktor bringt sich darauf in dem Shuttle in Sicherheit. Janeway gelingt es wenig später das Heimittel an Bord zu verteilen und kann so den Virus auslöschen. (VOY: Makrokosmos)
Wenig später benutzen Captain Janeway und Commander Chakotay die Sacajawea, um auf einem Planeten in einem binären System Nitrogenasemasse zu sammeln. Die Sacajawea stürzt dabei auf dem Planeten wegen eines Magnetsturmes in der Atmosphäre ab, Hydrazingas füllt den Innenraum und Janeway wird lebensgefährlich verletzt (VOY: Der Wille)
Ebenfalls 2373 bringt die Sacajawea Crewmitglieder der Voyager in eine Kolonie der Nezu und landet dort (VOY: Die Asteroiden).