Morphogene Matrix nennt man die Struktur, in der die Flüssigkeit, aus der die Wechselbälger bestehen, angeordnet ist.
2373 zeigt ein von Dr. Julian Bashir behandelter Wechselbalg noch eine Instabilität in seiner morphogenen Matrix, da er mit Tetryonstrahlung in Kontakt geriet. Diese führt später dazu, dass er zu sterben droht. Kurz zuvor, vereinigt er sich jedoch mit Odo und gibt diesem so die Fähigkeit zur Formwandlung zurück. (DS9: Das Baby)
2375 plant Doktor Julian Bashir auf Basis der morphogenen Matrix von Odo synthetische Organe wie Herz oder Leber zu erstellen. Er plant zukünftig eine Flüssigkeit in den Körper eines Patienten spritzen, die sich dann zu dem Organ formt, das benötigt wird. Dazu benötigt Bashir etwas von Odos Flüssigmasse. Das Projekt wird eingestellt, als der Doktor herausfindet, dass Odo mit dem morphogenen Virus befallen ist, der die Große Verbindung sterben lässt. (DS9: Ein Unglück kommt selten allein)