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Genauso wie sein Vorgänger verfügt er über eine "antike" [[Konsole|Steuerkonsole]] im [[Cockpit]], die dem Design von [[Captain Proton]]s [[Captain Protons Raketenschiff|Raketenschiff]] nachempfunden ist. ({{VOY|Das Rennen}})
Er wird [[2377]] in Dienst gestellt, nachdem sein Vorgänger von einem [[Taktischer Kubus|taktischen Kubus]] der [[Borg]] zerstört wurde wird. ({{VOY|Unimatrix Zero, Teil I}}).
Seinen ersten Einsatz hat der ''Delta-Flyer'' II, als [[Seven of Nine|Seven]]s [[Kortikalknoten]] ausfällt. In einem [[Wrack|Trümmerfeld]] verschiedener [[Liste der Raumschiffe der Borg|Raumschiffe der Borg]] will die [[Liste der Crew der USS Voyager|Crew]] der ''Voyager'' nach einem Kortikalknoten einer [[Tod|toten]] [[Borg-Drohne]] suchen. Diese [[Mission]] wird von [[Captain]] [[Kathryn Janeway]] und einem [[Außenteam]] mit dem neuen ''Delta Flyer II'' durchgeführt. Allerdings bleibt sie ohne Erfolg, der Kortikalknoten erweist sich als nutzlos. ({{VOY|Unvollkommenheit}})
[[Bild:Warpkern ausgestoßen.jpg|thumb|Der Doktor hat den Warpkern der ''Voyager'' gestohlen und fliegt davon.]]
Als [[der Doktor]] von der [[Hierarchie]] gezwungen wird, ihnen den [[Warpkern]] der ''Voyager'' zu übergeben, löst er einen [[Notfallausstoß des Warpkerns|Notfallausstoß]] aus, wodurch der Warpkern in den freien [[Weltraum|Raum]] gelangt. Hier benutzt der Doktor den [[Traktorstrahl]] des ''Delta Flyers'' und bringt den Warpkern zu der Hierarchie . ({{VOY|Renaissance Mensch}}).
Der ''Delta Flyer'' II bleibt der ''Voyager'' bis zur Rückkehr zur [[Erde]] erhalten.