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[[Datei:Dax_Energiezelle_Phaserphalanx.jpg|thumb|Dax als neue Kommandantin der ''Defiant''.]]
Die ersten drei Monate im [[Dominion-Krieg]] verlaufen schlecht für die Föderation und die Klingonen. Die Sternenflotte verliert eine Schlacht nach der anderen und die gesamte Crew ist müde, erschöpft und verzweifelt. Schließlich wird die ''Defiant'' zur [[Sternenbasis 375]] beordert. Dort angekommen, wird Sisko das Kommando über die ''Defiant'' entzogen. Captain Sisko bekommt von Admiral [[William Ross]] den Auftrag mit einem erbeuteten Jem'Hadar-Angriffsjäger ein Ketracel-White Lager des Dominions zu vernichten und die Mission ist schließlich erfolgreich. ({{DS9|Zeit des Widerstands}})
Während Sisko seine Mission durchführt, ist die ''Defiant'' bei Sternenbasis 375 stationiert. ({{DS9|Söhne und Töchter}})
Einige In der nächsten Zeit später gelingen der wieder vollzähligen Crew es derCrew der ''Defiant'' zahlreiche Vorstöße in das [[Territorium]] des Dominion. Sisko erhält schließlich von vollzieht für seine Crew in dieser Zeit ein [[Ritual]]. Dabei wird die leere [[AdmiralEnergiezelle]] aus der Phaserphalanx an den Captain übergeben und der stellt sie als Erinnerung an die erbrachten Leistungen im Kampf in der [[William Ross|Offiziersmesse]] aus. Zu dieser Zeit beauftragt RossSisko die [[Argolis-Mission]] vorzubereiten. Das Dominion hat eine [[Sensorenphalanx]] im [[Argolis-Cluster]] den Auftrag, mit welche die Flottenbewegungen der Sternenflotte ortet. Die ''Defiant'' einen Sensorposten des Dominion im bekommt den Auftrag diese Phalanx zu vernichten. Zu dieser Zeit bekommt Ross [[Adjutant]]in Captain [[Bennet (Captain)|Bennet]] das [[Siebentes Taktisches Geschwader|Siebente Taktische Geschwader]] unterstellt. Aufgrund seiner sehr guten Leistung in den letzten Wochen, ernennt Ross Sisko zu seinen neuen Adjutanten und dieser unterstützt nun Ross bei der Einsatzplanung von weiteren Missionen. Für Sisko bedeutet dies allerdings, dass er nicht an der Argolis-Mission teilnehmen kann. Dax bekommt für diese Mission das Kommando und bricht zu dieser Mission auf. Sisko macht sich Gedanken um seine Crew. Als Ross dies mitbekommt, macht er Sisko verständlich, dass er sich nun um viele Schiffe und Crews kümmern muss und er nicht mehr den Luxus hat, sich nur um ein Schiff zu kümmern. Darauf kümmert sich Sisko weiter um seine Arbeit. Während der Mission im Argolis-Clusterübernimmt Bashir die Conn für den erkrankten [[Haj (24. Jahrhundert)|Haj]] aufzuspüren und zu . Dax ist erstaunt, dass Bashir ein so guter Pilot ist. Schließlich kann die ''Defiant'' die Sensorenphalanx vernichten. Nach dem Erfolg der ''Defiant'', belobigt Ross Siskos Crew für ihre gute Arbeit. Allerdings muss auch Sisko mit ansehen wie Dax sein Ritual übernimmt. ({{DS9|Hinter der Linie}})
[[Datei:Klingoneneskorte.jpg|thumb|Mehrere Klingonen eskortieren die Defiant]]