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Die ersten drei Monate im [[Dominion-Krieg]] verlaufen schlecht für die Föderation und die Klingonen. Die Sternenflotte verliert eine Schlacht nach der anderen und die gesamte Crew ist müde, erschöpft und verzweifelt. Schließlich wird die ''Defiant'' zur [[Sternenbasis 375]] beordert. Dort angekommen, wird Sisko das Kommando über die ''Defiant'' entzogen. Captain Sisko bekommt von Admiral [[William Ross]] den Auftrag mit einem erbeuteten Jem'Hadar-Angriffsjäger ein Ketracel-White Lager des Dominions zu vernichten und die Mission ist schließlich erfolgreich. ({{DS9|Zeit des Widerstands}})

Einige Zeit später gelingen der wieder vollzähligen Crew der ''Defiant'' zahlreiche Vorstöße in das [[Territorium]] des Dominion. Sisko erhält schließlich von [[Admiral]] [[William Ross|Ross]] den Auftrag, mit der ''Defiant'' einen Sensorposten des Dominion im [[Argolis-Cluster]] aufzuspüren und zu vernichten. ({{DS9|Hinter der Linie}})