Auf dem Weg dorthin trifft die ''Enterprise'' auf die [[USS Reliant(NCC-1864)|USS ''Reliant'']], welche von [[Khan Noonien Singh]] übernommen wurde, nachdem er von [[Ceti Alpha V]] entkommen ist. Die ''Reliant'' greift die ''Enterprise'' an. Khan will seine Rache an Kirk ausüben, weil dieser ihn auf dem Planeten ausgesetzt hat. Obwohl Sulu anfangs ausweichen kann, wird die ''Enterprise'' schwer beschädigt. Khan setzt sich mit Kirk in Verbindung und verlangt seine Kapitulation. Er verlangt neben der Kapitulation, dass Kirk ihn sämtliche Daten zum [[Genesis-Projekt]] gibt. Da Khan die ''Enterprise'' vernichten kann, versucht Kirk nun Zeit zu gewinnen. Mit Hilfe des [[Prefix-Code]]s gelingt es Kirk jedoch, die Kontrolle über die ''Reliant'' zu erlangen und ihre Schutzschilde zu deaktivieren. Sulu schafft es daraufhin, die ''Reliant'' mit Hilfe der Phaser schwer zu beschädigen. Khan ist gezwungen sich vorerst zurück zu ziehen.