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Chakotay
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Chakotay leitet ein Außenteam, dass auf einem Planeten Polyferranitablagerungen untersucht. Diese werden zur Wartung der Warpgondeln benötigt. Jedoch erweisen sich die Vorkommen als unbrauchbar, da sie mit [[Acelyt]]en verunreinigt sind. Daraufhin lässt Chakotay die Ausrüstung zusammenpacken. Allerdings entdeckt Tuvok in diesem Moment etwas ungewöhnliches. Chakotay erkennt in der Zeichnung, die Tuvok gefunden hat, etwas wieder, dass er bei einer Expedition mit seinem Vater auf der Erde gesehen hat. Er berichtet daraufhin Janeway von der Expedition und dem Mythos von den "[[Geister des Himmels|Geistern des Himmels]]". Da von diesem Planeten eine Warpspur in ein anderes Sonnensystem führt, folgt man dieser. Dort entdeckt man auch Ferranit. Chakotay soll mit einem Außenteam runterbeamen und das Ferranit abbauen. Da ein Beamen nicht möglich ist, fliegt man mit einem Shuttle runter. Während des Fluges sieht Chakotay im Fenster eine Reflektion, die wie ein Vogel aussieht. Nachdem sie auf dem Planeten gelandet sind, suchen sie das Ferranitvorkommen. Nachdem sie es entdeckt haben, wird Neelix von einem [[Vogel]] angegriffen und schwer am Auge verletzt. Daher lässt Chakotay ihn direkt auf die Krankenstation beamen. Mit dem Außenteam entdeckt er inzwischen eine scheinbar verlassene Siedlung. Dort suchen sie nach den Bewohnern. Diese finden sie zunächst nicht und da ein Sturm losbricht, fliehen sie zurück zum Shuttle. Chakotay wird jedoch von einem umstürzenden Baum begraben und bleibt liegen. Als er wieder zu sich kommt, bemerkt er das Fehlen seines Kommunikators und scannt die Umgebung. Er entdeckt eine Höhle und betritt sie. Dort trifft er auf mehrere Fremde. Einer der Fremden, fragt ihn woher er seine [[Tätowierung]] habe. Chakotay erklärt ihnen, dass er es zu Ehren seiner Vorfahren trägt. Er ist ein Nachfahre der Erben. Der Andere berichtet von den Reisen seines Volkes zur Erde. Chakotay berichtet, dass sie ihre Handlungsweisen seit ihrem letzten Besuch verändert haben. Er kann den Fremden überzeugen, den [[Zyklon]], welcher zwischenzeitlich die Voyager umschlossen hat, aufzulösen. Dann unterhält er sich mit dem Fremden, über seinen Vater. ({{VOY|Tattoo}})
[[Datei:Chakotay mahnt zur Vorsicht.jpg|thumb|Chakotay mahnt zur Vorsicht.]]Nachdem die ''Voyager'' die Phalanx des zweiten Fürsorgers entdeckt hat, wird sie von dieser angegriffen. Chakotay lässt daher die Schilde aktivieren. Nachdem Tanis die Kommunikation abgebrochen hat, fragt er Kes, ob es Berichte über Ocampa gibt, die die Heimatwelt verlassen haben oder verschleppt wurden. DIes Dies verneint sie jedoch. Er ist bei den Verhandlungen mit Tanis anwesend und verlässt mit Janeway den Raum, als dieser mit Kes allein sprechen möchte. Dieses Gespräch führt zu einem gemeinsamen Essen von Tanis mit den Führungsoffizieren. Dabei erkundigt er sich, ob sich Suspiria in ihrem Raum-Zeit-Kontinuum aufhält. Diese Frage, kann Tanis jedoch nicht beantworten. Nachdem Suspiria die Maschinenraumcrew, Tuvoks Sicherheitsteam und Janeway angegriffen und handlungsunfähig gemacht hat, destabilisiert sie die Molkeularstruktur des Schiffes. Chakotay gibt daraufhin Roten Alarm und ruft den Captain, der nicht antwortet. Ferner lässt er Energie zur strukturellen Integrität umleiten. ({{VOY|Suspiria}})
[[Datei:Chakotay wird gefoltert.jpg|thumb|left|Chakotay wird von Teirna gefoltert.]]
Während Chakotay mit B'Elanna auf dem Holodeck Hoverball spielt, empfängt das Schiff ein Sternenflottensignal. Als man diesem folgt, wird das Schiff von den Kazon-Nistrim angegriffen und ein Transportermodul gestohlen. Chakotay erkennt, dass Seska eine weitere Falle für sie vorbereitet hat. Daraufhin versucht er eine Schwachstelle bei Seska zu entdecken. Gemeinsam mit Torres plant er den Gegenschlag. Vor der nächsten Einsatzbesprechung der Führungsoffiziere, entwendet er jedoch ein Shuttle und versucht eigenmächtig das Transportermodul zu zerstören. Ihm gelingt es das Kazon-Schiff zu erreichen. Er beamt sich an Bord und zersört den Transporter mit seinem Handphaser. Anschließend wird er von den Kazon gefangen genommen. Er wird von Seska verhört, die die Kommandocodes der ''Voyager'' haben will. Er weigert sich jedoch die Codes herauszugeben. Nachdem er gegen drei gefangen genommene Majes der Kazon ausgetauscht werden kann, wird er von Janeway befragt. Er meint, dass es ein persönlicher Rachefeldzug war und dass es das Richtige war. Janeway weist darauf hin, dass sie die Disziplin aufrecht erhalten muss und er ihr damit die Arbeit erschwert hat. ({{VOY|Das Signal}})
[[Datei:Voyager-Crew sucht nach einem Weg ins Gefängnis der Mokra eindringen zu können.jpg|thumb|Die Offiziere suchen einen Weg durch das Schildgitter der Mokra.]]Als Janeway mit einem Außenteam auf einem Planeten dringend benötigtes Tellerium erwerben möchte, hat er das Kommando auf dem Schiff. Nachdem nur Neelix zurückkehrt und die anderen gefangen genommen werden, beschließt er in einen Orbit um den Planeten einzutreten. Er nimmt Kontakt mit den Mokra auf, welche erstaunlicherweise versprechen, bei der Suche nach den Vermissten zu helfen. Chakotay lässt daraufhin trotzdem den gesamten Planeten permanent scannen. Wenig später verhandelt er mit Augris, dem dritten Magistrat der Mokra, der meint, dass sich die ''Voyager'' einen schlechten Ruf erworben hat. Zwar verspricht Augris, nach ihren Leuten suchen zu lassen, aber Chakotay traut ihm nicht und lässt Neelix, nochmals seine Kontaktleute aufsuchen. Anschließend berät er sich mit den Offizieren, wie sie das Außenteam aus dem Gefängnis der Mokra befreien können. Harry Kim präsentiert ihm einen Plan. Es gelingt ihnen die Schilde der Mokra zu durchdringen. Ehe sie jedoch das Rettungsteam beamen können, werden sie von der Oberfläche aus angegriffen. Als es Captain Janeway gelingt einen Riss in den Schilden der Mokra zu erzeugen, beamt Chakotay das Rettungsteam durch diesen Riss auf den Planeten. Nachdem die Mokra das Schiff angreifen, lässt er die Schilde verstärken. Da das Schiff immer schwerere Schäden erleidet, lässt er Kim nochmals nach dem Außenteam scannen. Anschließend versteckt er das Schiff über dem Nordpol des Planeten und wenig später gelingt es die Vermissten an Bord zu beamen. ({{VOY|Die Resistance}})
Als B'Elanna durch die [[Automatische Einheit 3947]] entführt wird, registriert er auf der Brücke die Aktivierung des Transporters. Anschließend versucht er das fremde Schiff zu analysieren. Seine Analyse bleibt jedoch ergebnislos, da die Sensoren der ''Voyager ''die Schilde des Raumschiffs der Androiden nicht durchdringen können. Als die ''Voyager'' durch das [[Pralor]]-Raumschiff angegriffen wird, meldet er Schäden. DIe Kämpfe werden durch die Einwilligung Torres' den Automatischen Einheiten zu helfen, unterbrochen. Während Torres arbeitet, plant er zusammen mit den anderen Führungsoffizieren die Befreiung von B'Elanna. Bei der Durchführung der erfolgreichen Rettungsaktion übernimmt er das Steuer des Schiffs. ({{VOY|Prototyp}})
[[Datei:Chakotay schlägt Janeway Verhandlungen mit den Kazon vor.jpg|thumb|left|Chakotay schlägt Janeway Verhandlungen mit den Kazon vor.]]Nachdem die USS ''Voyager '' bei einem Angriff der Kazon schwere Schäden erleidet und drei Besatzungsmitglieder getötet werden, schlägt er dem Captain vor, Verhandlungen mit den Kazon aufzunehmen. Er meint, dass sie es sich nicht leisten können, so weiterzumachen wie bisher. Wenig später hält er die Trauerrede für Kurt Bendera. Anschließend spricht er mit Janeway über eine mögliche Allianz mit den Kazon. Bei einer anschließenden Besprechung der Führungsoffiziere, ist er vom Vorschlag mit den Nistrim und Seska zu verhandeln, nicht begeistert. Daher übernimmt Janeway es selbst, Seska zu kontakten. Nachdem diese Verhandlungen vorerst scheitern und Neelix Kontakt zu den [[Trabe]] herstellt. Mit diesen, schließen sie eine Allianz, was die Kazon zu Verhandlungen auf Sobras bewegt. Während dieser Verhandlungen hat er das Kommando auf der ''Voyager'' und überwacht die Kazon-Schiffe sowie die Oberfläche des Planeten. Als ein Anschlag auf die Konferenz verübt wird, lässt er das Außenteam hochbeamen und die ''Voyager'' verlässt den Planeten schnellstmöglich. ({{VOY|Allianzen}})
[[Datei:Der Doktor informiert Chakotay und Tuvok über die Transformation von Paris und Janeway.jpg|thumb|Der Doktor informiert Chakotay und Tuvok über die Transformation von Paris und Janeway.]]
Als Paris, Kim und Torres die Entwicklung eines Warp-10-Antriebs gelingt, beglückwünscht er die drei. Beim Testflug von Paris arbeitet er auf der Brücke. Nachdem Tom Paris in eine andere Spezies transformiert wird und Janeway entführt, hat Chakotay das Kommando auf der Brücke und dirigiert Tuvoks Sicherheitsteam zur Shuttlerampe. Anschließend lässt er das Shuttle verfolgen. Nachdem dieses aufgespürt wurde, informiert ihn der Doktor über die medizinischen Hintergründe von Paris' Transformation. Wenig später leitet er das Außenteam, dass die beiden aufs Schiff zurückbringt. Dort entdecken sie auch, dass es drei Nachkommen der transformierten Janeway und Paris gibt. Daraufhin fragt er Tuvok rhetorisch, dass er nicht weiß, wie er das in das Logbuch eintragen soll. ({{VOY|Die Schwelle}})
Nachdem [[Frank Darwin]] ermordet wird, bespricht er mit Tuvok und Janeway das weitere Vorgehen. Als Torres sie informiert, dass [[Lon Suder]] zum Tatzeitpunkt der einzige im Maschinenraum war, kommt ihm der Verdacht, dass dieser der Täter sein könnte. Suder war seiner Meinung nach, beim Maquis zu gründlich beim Töten von Cardassianern. Als der an den Folgen einer Gedankenverschmelzung mit Lon Suder leidende Tuvok, diesen angreift und zu einer Gedankenverschmelzung zwingt, wird der Vulkanier bewusstlos. Suder ruft daraufhin Chakotay zu Hilfe. ({{VOY|Gewalt}})
[[Datei:Chakotay ermahnt Paris.jpg|thumb|left|Chakotay ermahnt Paris, weil er zu spät kommt.]]
Nachdem man ein Trümmerfeld entdeckt, untersucht man die Ursache und findet heraus, dass eine cardassianische Sonde, [[ATR-4107]], aus dem Alpha-Quadranten einen Planeten zu vernichten droht. Chakotay und B'Elanna informieren daraufhin die anderen Führungsoffiziere, dass sie die Sonde im Alpha-Quadranten gestartet hatten. Er weist auch Tom Paris zurecht, als dieser verspätet erscheint. Nachdem ein erster Versuch die Sonde zu stoppen gescheitert ist, berechnet er, dass es 51 Minuten dauert bis die Sonde Rakosa erreicht. Als Janeway den Flugkörper angreifen will, weist er darauf hin, dass dies wohl wirkungslos sein wird. Janeway entgegenet, dass die Voyager mit Torpedos vom Typ 6 ausgestattet ist, die es zum Startzeitpunkt von Dreadnought nicht gab. Jedoch ist der Angriff ergebnislos. Infolgedessen leitet er auf Janeways Befehl die Evakuierung der ''Voyager''. Auch er selbst verlässt das Schiff. ({{VOY|Der Flugkörper}})
[[Datei:Q bringt alle Männer zurück.jpg|thumb|Q bringt alle Männer zurück.]]Kurze Zeit später entdeckt die ''Voyager'' einen Kometen mit einer eigenartigen Flugbahn. Chakotay vermag es nicht zu analysieren. Dieser stellt sich als Gefängnis des Qs [[Quinn]] heraus. Dieser flieht vor dem Kontinuum, daer da er Selbstmord begehen möchte. Q versucht ihn aufzuhaltenund erscheint, kurz nachdem Quinn versehentlich alle Männer, darunter Chakotay, vom Schiff hat verschwinden lassen. Q bringt Chakotay und die anderen wieder zurück. Daraufhin teleportiert er Quinn sich und die ''Voyager '' in den Urknall. Chakotay meldet daraufhin Janeway das Vorhandensein von [[Baryonpartikel]]n. Nachdem Q sie überall aufspürt, sprechen sie sich aus. Janeway macht den Kompromissvorschlag, dass sie eine Anhörung abhält, auf der beide ihre Argumente präsentieren können. Nachdem Janeway, als Vorsitzende dieser Anhörung, zugunsten Quinns entschieden hat, wird dieser von Q in einen Menschen transformiert. Chakotay bespricht mit Janeway einen möglich Einsatzort für Quinn. Jedoch tötet dieser sich zuvor selbst. ({{VOY|Todessehnsucht}})
[[Datei:Chakotay wird von Paris zu Boden gestoßen.jpg|thumb|left|Chakotay wird von Paris zu Boden gestoßen.]]Da Tom Paris wiederholt zu spät zum Dienst erscheint, ermahnt ihn Chakotay in Zukunft pünktlich zu erscheinen. Bald nach dieser Ermahnung, trifft die ''Voyager'' auf ein vidiianisches Schiff mit einer erkrankten Person. Während diese auf der Krankenstation behandelt wird, berichtet Chakotay dem Captain, dass ihr Ziel eine entfernte vidiianische Kolonie war. Außerdem spricht er mit dem Captain über das Verhalten von Tom Paris in der letzten Zeit. Er bittet um ihren Rat, da Paris gewissermaßen, ihr persönliches Besserungsprojekt gewesen sei. Jedoch lässt ihm der Captain freie Hand in dieser Angelegenheit. Er bespricht die Situation mit Paris, und bietet ihm an über seine Probleme zu sprechen. Paris meint, dass Chakotay sein Problem ist und geht daraufhin. Nachdem Paris wieder einmal zu spät zum Dienst erscheint, suspendiert ihn Chakotay vom Dienst. Daraufhin attackiert Paris Chakotay und wird von Tuvok in den Arrest gesteckt. ({{VOY|Lebensanzeichen}})
Nachdem Tom Paris die ''Voyager'' verlässt, sieht Chakotay die Sendung von Neelix über den Abschied von Tom. Nachdem Paris das Schiff verlassen hat, fragt er Janeway nach Ersatzkandidaten. Nachdem Neelix einem Verräter auf dem Schiff auf die Spur kommt, bespricht er die Situation mit Neelix, Tuvok und Janeway. Er ist enttäuscht, als sie ihm mitteilen, dass PairsParis' Verhalten nur Teil eines Planes war, einen Verräter an Bord des Schiffes zu entlarvenund Janeway ihm nicht mehr vertraut hat. Mithilfe von Neelix kann man den Verräter [[Michael Jonas]] enttarnen und Paris zurückholen. ({{VOY|Der Verräter}})
Vor den ersten Verhandlungen mit den [[Drayaner]]n, informiert er Janeway über Neelix' Informationen über die Drayaner. Anschließend empfängt er die drayanische Delegation im Transporterraum und führt sie mit dem Captain durch das Schiff. Nachdem die ''Voyager'' plötzlich zum Abflug aufgefordert wird, kann Tuvoks Shuttle nicht erreicht werden. Nachdem sich Janeway entschließt, entgegen den Forderungen der Drayaner, zu einem Mond zu fliegen, um das vermisste Shuttle zu bergen, übernimmt er das Kommando auf der ''Voyager''. ({{VOY|Unschuld}})
[[Datei:Chakotay bespricht mit Janeway und Torres die Befreiung der Kohl aus den Stasiskapseln.jpg|thumb|Chakotay bespricht mit Janeway und Torres die Befreiung der KOhl aus der Stasiskapsel.]]Nachdem die ''Voyager'' die [[Heimatwelt der Kohl]] erreicht, erkennt Chakotay, dass der gesamte Planet vereist ist. Nachdem Harry einen Notruf empfängt, fragt er erneut nach Lebenszeichen auf dem Planeten. Jedoch kann Harry immer noch keine orten und meint, dass es ein automatisches Notsignal sein muss. Nachdem man mehrere Überlebende in Stasiskapseln entdeckt, besprechen die Führungsoffiziere was zu tun ist. Chakotay schlägt vor, die Überlebenden sofort aus den Kapseln zu holen. Dem widerspricht jedoch der Doktor, da dies zu schweren Hirnschäden bei den Insassen führen würde. Er stimmt Tuvoks Vorschlag in die Kapseln zu gehen, um mit den Fremden Kontakt aufzunehmen zu. Nachdem die Boten, Harry und B'Elanna von der Illusion [[Der Clown|eines Clowns]] gefangen genommen werden, nimmt er an einer Besprechung der Führungsoffiziere teil. Schließlich können sie befreit werden. ({{VOY|Das Ultimatum}})
Als Tuvok und Neelix nach einer Außenmission auf das Schiff zurückgebeamt werden, werden ihre Muster zu einer neuen Person, [[Tuvix]], vereinigt. Anschließend suchen Torres und der Doktor nach einer Möglichkeit die beiden wieder zu trennen. Bei einer Besprechung der Führungsoffiziere empfiehlt Chakotay eine Holodecksimulation um den Unfall nachzustellen. Nachdem eine Rückverwandlung von Tuvix nicht möglich zu sein scheint, übernimmt er wieder den Dienst. Chakotay unterhält sich mit Tuvix an der Taktischen Konsole. Nach einigen Wochen spielt er mit Paris und Tuvix Pool im Chez Sandrine auf dem Holodeck. Dabei gewinnt allerdings Tuvix. ({{VOY|Tuvix}})
[[Datei:Janeway und Chakotay nähern sich an.jpg|thumb|left|Janeway und Chakotay kommen sich näher.]]
Nachdem Captain Janeway und Chakotay auf [[Neue Erde|einem Planeten]] mit einer tödlichen Krankheit infiziert werden, welche auf dem Planeten jedoch nicht zum Ausbruch kommt, müssen die beiden zurückgelassen werden, da es dem Doktor, trotz 17-tägiger Arbeit nicht möglich ist ein Heilmittel zu finden. Er sieht nur die Möglichkeit, mit den Vidiianern in Kontakt zu treten. Dies lehnen Janeway und Chakotay jedoch als zu riskant ab.Die beiden richten sich auf dem Planeten ein. Chakotay beginnt etwas im Wald zu bauen, von dem er Janeway zunächst nicht berichtet. Sie entdecken im Wald auch [[Neue-Erde-Primat|einen Primaten]], der sie beobachtet. Allmählich kommt er zu dem Schluss, dass sie wohl kein Heilmittel finden können. Er will das Beste aus der Situation machen. Der Captain will jedoch weitersuchen. Später baut er auch Kopfbretter für das Bett, damit Janeway im Bett lesen kann. Als ein [[Plasmasturm]] über den Planeten zieht, bringt er den Captain ins Haus zurück. Nach dem Ende des Sturms, beginnt er mit Holz das Haus auszubauen. Allmählich kommen sich Janeway und Chakotay näher. Chakotay plant bereits ein [[Schiff|Boot]] zu bauen, mit dem sie den [[Fluss]] entlang fahren könnten. Jedoch meldet sich Tuvok und informiert sie, dass sie ein Heilmittel gefunden haben und in 30 Stunden auf dem Planeten eintreffen werden. Daher packen Janeway und Chakotay ihre Ausrüstung zusammen und kehren aufs Schiff zurück. Dort macht er einen Check der Systeme und sie fliegen weiter in Richtung Erde. ({{VOY|Entscheidungen}})
[[Datei:Janeway und Chakotay besprechen die Situation um Seskas Baby.jpg|thumb|Janeway versichert Chakotay, dass die Crew hinter ihm steht, um sein Baby zu suchen.]]
Nachdem man einen Notruf von Seska auffängt, in dem sie Chakotay um Hilfe bittet, da Culluh sie versoßen habe, als er sah, dass das Baby nicht von ihm ist. Er diskutiert mit Janeway, ob sie auf den Notruf reagieren sollen oder nicht. Chakotay soll darüber nachdenken und ihr seine Entscheidung mitteilen. Daraufhin befragt Chakotay mithilfe des [[Akoonah]] seinen Vater, der ihm den Rat gibt, dass ihr Stamm die Kinder aufnahm, die durch weiße Eroberer vor Jahrhunderten gewaltsam gezeugt wurden. Eines davon war ihr Vorfahre [[Ce Acatl]]. Aufgrund dieser Erfahrung entschließt sich Chakotay dem Kind zu helfen. Die Führungsoffiziere stimmen dem Plan zu und Chakotay bedankt sich dafür. Kurze Zeit später entdeckt er ein Kazon-Shuttle. Als der Pilot auf die Krankenstation gebeamt wird, erkennt Chakotay ihn als [[Teirna]]. Er hat ihn damals gefoltert. Von ihm erfährt er, dass Seska tot ist. Er verhört ihn. Teirna behauptet, dass Seska getötet wurde und er nur knapp entkommen ist. Da Torres' und Kims Untersuchung des Shuttles diese Geschichte zu bestätigen scheint, hält er an der geplanten Mission fest. Wegen der fortgesetzten Angriffe der Kazon, stellt er Teirna zur Rede, der jedoch meint nichts zu wissen. Nachdem das Schiff den Kurs ändert wird es von acht Trägerschiffen angegriffen. Durch einen Selbstmordanschlag von Teirna, fallen die holografischen Projektoren des Schiffes aus. Nachdem Paris mit einem Shuttle startet, um Hilfe von den Talaxianern zu holen, übernimmt er das Steuer. Die ''Voyager'' wird durch die Übermacht der Kazon geentert und die Besatzung gefangen genommen. Anschließend betritt Seska die Brücke, und präsentiert ihm seinen Sohn. Chakotay meint, dass er nie die Verachtung erfahren soll, die er für seine Mutter hegt. Er wird mit dem Rest der Crew auf dem [[Hanon-Planet]]en ausgesetzt. ({{VOY|Der Kampf ums Dasein, Teil I}})
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[[Datei:Chakotay verhandelt mit den Eingeborenen auf Hanon.jpg|thumb|Chakotay verhandelt mit den Eingeborenen über die Freilassung von Kes.]]
Auf dem Planeten sucht man zunächst einen guten Lagerplatz. Bei der Suche trägt Chakotay Naomi Wildman, da Samantha Wildman sich nicht überanstrengen soll. Nachdem Hogan in einer Höhle vom [[hanonianisches Höhlenreptil|hanonianischen Höhlenreptil]] gefressen wird, baut Chakotay aus den Überresten der Uniform einen solaren Destillierapparat, mit dem sie [[Wasser]] gewinnen können. Auch versucht er ein Lagerfeuer zu entzünden, was ihm jedoch nicht gelingt. Janeway vermutet, dass es am Holz des Planeten liegt. Daher benutzt Chakotay einige abgeschnittene Haare, zum Feueranzünden. Nachdem Kes und Neelix von Eingeborenen entführt werden, begibt er sich unbewaffnet zu diesen und verhandelt über die Freilassung der beiden. Schließlich können sie das Lager der Eingeborenen verlassen, werden von diesen jedoch verfolgt. Tuvok und andere Besatzungsmitglieder geben ihnen Feuerschutz mit Pfeilen und Steinwürfen. Sie müssen vor den Eingeborenen in eine Höhle fliehen. Dort treffen sie auf das [[Hanonianisches Höhlenreptil|hanonianische Höhlenreptil]]. Dieses frisst ein Besatzungsmitglied, während die anderen fliehen können. Chakotay und Tuvok bringen mit Speeren die Höhlendecke zum Einsturz, sodass die Kreatur ihnen nicht folgen kann. Er spricht mit Janeway und Tuvok über das weitere Vorgehen gegenüber den Wilden. In diesem Moment bricht ein [[Vulkan]] aus und sie müssen fliehen. Da eine Einheimische von Lava eingeschlossen wird, begibt sich Chakotay zu ihr und trägt sie aus der Gefahrenzone. Daher verhalten sich die Eingeborenen freundlich und zeigen ihnen einen Weg. Nach der Rückkehr auf die Voyager besucht er die Krankenstation und nimmt Abschied von Seska. ({{VOY|Der Kampf ums Dasein, Teil II}})
Als Tom Paris und Harry Kim auf [[Akritiri]] nach einem Bomben[[anschlag]] vermisst werden, informiert er Janeway, dass sie von Botschafter Liria gerufen werden. Dieser berichtet, dass ihre Offiziere als [[Terrorist]]en verurteilt wurden und die ''Voyager'' beschlagnahmt wird. Kurz darauf nähern sich zwei [[Akritirianisches Patrouillenschiff|akritirianische Schiffe]]. Chakotay übernimmt die [[Conn]] und fliegt die ''Voyager'' in eine sichere Position. Dort angekommen, bespricht er zunächst mit den Führungsoffizieren die Situation. ({{VOY|Das Hochsicherheitsgefängnis}})
[[Datei:Chakotay verteidigt die Brücke gegen den Schwarm.jpg|thumb|left|Chakotay verteidigt die Brücke gegen den Schwarm.]]
Als ein Shuttle mit Paris und Torres von einer unbekannte Spezies angegriffen wird, nimmt er an einer anschließenden Lagebesprechung teil. Er meint, dass ein Umfliegen des Territoriums der Spezies etwa 15 Monate dauern würde. Als Janeway den Entschluss fasst das Territorium der Fremden zu durchfliegen, äußert er die Vermutung, dass diese nicht genügend Schiffe besitzt um die gesamte Grenze zu sichern. Nachdem Janeway entscheidet, das Territorium der Fremden zu durchfliegen entwickelt er gemeinsam mit Kim ein Verfahren um das Gitter zu überschreiten. Ihrer Analyse zufolge könnten sie innerhalb von vier Tagen das Territorium durchqueren. Dabei wird die ''Voyager'' jedoch angegriffen. Kurz darauf entern mehrere Mitglieder des Schwarms die Brücke. Jedoch können diese überwältigt werden. Chakotay erschießt dabei einen Eindringling persönlich. Unterdessen gelingt es Kim die fremden Schiffe an der Hülle mit einer bestimmten Phasermodulation zu zerstören. Daraufhin ziehen sich die übrigen zurück und die ''Voyager'' kann das Territorium des Schwarms wieder verlassen. ({{VOY|Der Schwarm}})