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Phlox
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Auf der Krankenstation kümmert Phlox sich um Porthos, der nach dem scheinbaren Tod seines Herrchens nichts fressen will. Phlox redet ihm gut zu und sagt, dass Hühnerleber sein Lieblingsgericht sei. Als Phlox erwägt zu singen, meint er, dass sein Gesang seine Kinder oft zum [[Weinen]] gebracht habe. Da taumelt der schwer verletzte und entstellte Daniels auf die Krankenstation. Phlox stellt fest, dass dessen Körper teilweise rapide gealtert und zum Teil sich in ein fast fötales Stadium verjüngt hat. Als Daniels wieder bei Bewusstsein ist, informiert er T'Pol und sagt ihr, dass er nicht weiß, wie lange er bei Bewusstsein sein wird. Daniels hat die ''Enterprise'' und auch Archer in das Jahr [[1944]] zurück versetzt, damit diese [[Vosk]] und die [[Na'kuhl]] aufhalten. Den Na'kuhl gelingt es die Zeitlinie vollständig zu verändern und Daniels erklärt die ''Enterprise'' in diese Zeit gebracht hat, da Vosk seinen Angriff von diesem Zeitpunkt gestartet hat und nur hier aufgehalten werden kann. Daniels kann dies auch Archer mitteilen, nachdem dieser zurück auf die ''Enterprise'' gekehrt ist. Wenig später stirbt Daniels. Kurz darauf entdeckt Phlox, dass sich Silik an Bord der ''Enterprise'' befindet. Kurz darauf greift die ''Enterprise'' die Anlage an und vernichtet den Zeitkanal der Na'kuhl. Da Archer Vosk aufhalten konnte, zeigt Daniels, welcher wieder am Leben ist, ihn wie die Zeitlinie sich wieder herstellt. Daniels bringt die ''Enterprise'' zurück ins 22. Jahrhundert und dort wird die ''Enterprise'' von einer irdischen Flotte empfangen. ({{ENT|Sturmfront, Teil I|Sturmfront, Teil II}})
[[Datei:Phlox aufgebläht.jpg|thumb|left|Phlox verschreckt die Angreifer.]]
Die ''Enterprise'' wird im Trockendock einer Reparatur und Generalüberholung unterzogen. Phlox und die gesamte Crew des Schiffes werden als [[Held]]en für die Rettung der Erde gefeiert. In einer [[Bar]] entspannen Reed, Mayweather und Phlox ein wenig. Plötzlich pöbelt ein Gast Phlox an, da dieser ein [[Außerirdischer]] ist. Er wirft auch Reed vor, dass er als Sternenflottenangehöriger an dem Angriff auf die Erde durch die Xindi mit Schuld sei, da sie jedem die Position der Erde verraten würden. Schließlich kommt es zu einer Schlägerei zwischen Reed und Mayweather mit mehreren Gästen. Als Phlox angegriffen wird, bläht er seine Kopfhaut auf, eine instinktive Abwehrreaktion der Denobulaner. Die Angreifer flüchten daraufhin verängstigt aus der Bar. Anschließend isst er eine [[Brezel]]. Später teilt Phlox Sato bei einer Untersuchung mit, dass er sie nicht auf die Erde zu [[Madame Chang's Mandarin Cafe]] begleiten wird. Sato will jedoch nicht, dass er sich von einem Großmaul einschüchtern lässt. Phlox meint jedoch, dass es einige Zeit dauern wird, bis die Wunden der Menschheit geheilt sind, bittet aber Sato, ihm etwas von dem Essen mitzubringen. ({{ENT|Zuhause}})
[[Datei:Soong und Phlox analysieren die DNA.jpg|thumb|Soong und Phlox arbeiten zusammen.]]
Kurz darauf greift eine Gruppe genetisch verbesserte Menschen, [[Augment]]s genannt, einen klingonischen Bird-of-Prey an und erobern diesen. Die ''Enterprise'' bekommt darauf den Auftrag diese Augments aufzuhalten. Doktor [[Arik Soong]], der die Augments aufgezogen hat, kommt an Bord, um der Crew bei der Suche zu helfen. Auf der Krankenstation unterhält Phlox sich mit Soong und er fragt, welche genetischen Modifikationen Soong an den Augments vornahm. Dieser meint jedoch, dass seine Arbeit für ihn spreche. Soong spricht nun an, dass er nicht wusste, dass Phlox Genmanipulationen ablehne. Phlox argumentiert, dass die [[Eugenische Kriege|eugenischen Kriege]] auf der Erde 30 Millionen Tote forderten. Die ersten Spuren des klingonischen Schiffes führen ins [[Borderland]], einer Region, welche vom [[Orion-Syndikat]] kontrolliert wird. Die ''Enterprise'' wird kurze Zeit später von zwei [[Orion-Abfangjäger]]n angegriffen und einige Crewmitglieder, darunter auch T'Pol, werden von den [[Orioner]]n entführt. Zusammen mit den anderen wird sie nach [[Verex III]] gebracht, einer Sklavenverarbeitungsstätte. Mit Hilfe von Soong gelingt es Archer, sie und die anderen Crewmitglieder aus der Hand der Orioner zu befreien. Die ''Enterprise'' flieht von Verex III, wird aber erneut von Orion-Abfangjägern verfolgt. Diese werden jedoch von dem Bird-of-Prey, welchen die Augments übernommen haben, ausgeschaltet. Kurz darauf kommt der Augment [[Malik]] an Bord der ''Enterprise'' und fordert von Archer Soong frei zu lassen, doch Archer lehnt dies ab. Malik demonstriert seine überlegende Fähigkeiten und warnt sogar Archer und Reed vor das er Archer gleich angreifen wird, doch trotz der Warnung kann Reed nicht verhindern, dass Malik den Captain als Geisel nimmt. Mit Archer als Geisel kann Malik Soong befreien und die Augments können mit Soong entkommen. ({{ENT|Borderland}})
Als [[Emory Erickson]] versucht, mit dem [[Transporter]] der ''Enterprise'' seinen vor 15 Jahren bei einem [[Transporter]]test verschollenen Sohn zu rematerialisieren, stellt Phlox bei einem Scan fest, dass dieser unter massivem Zellverfall leidet und wohl nicht überleben wird. Schließlich rematerialisiert Erickson seinen Sohn [[Quinn Erickson]], der kurz darauf in den Armen seines Vaters stirbt. Später untersucht Phlox nochmal T'Pol und bestätigt, dass sie nach der Behandlung durch [[T'Pau]] keine Symptome des Pa'nar-Syndroms mehr hat. ({{ENT|Daedalus}})
Wenige Wochen später bringt die ''Enterprise'' eine Delegation der Tellariten zum Planeten [[Babel (Planet)|Babel]], damit diese an einer Handelskonferenz mit den Andorianern teilnehmen können. Auf dem Weg nach Babel erhält das Schiff einen Notruf von Shran, dessen Schiff angeblich von den Tellariten angegriffen worden ist. Auf der Krankenstation behandelt er die Überlebenden der ''Kumari'', nachdem man die Trümmer des zerstörten andorianischen Schiffes findet. Später wird er von Archer Shran beschuldigt den tellaritischen Botschafter Gral, für den Angriff verantwortlich gewesen zu sein, aber dieser streitet den Quartieren gerufenAngriff ab. Bei weiteren Untersuchungen stellt sich heraus, weil dass dieses Schiff in Wirklichkeit ein [[TalasRomulanisches Drohnenschiff|Drohnenschiff]] angeschossen wurdeund für die ganzen Angriffe auf die anderen Schiffe verantwortlich ist. Die ''Enterprise'' flieht, doch das Drohnenschiff verfolgt die ''Enterprise''. Währenddessen greifen Shran und seine Leute Gral und seine Delegation an. Bei dem Kämpfen wird Talas, Shrans Gefährtin, schwer verwundet. Zur selben Zeit stellt T'Pol fest, dass dieses Schiff von den Romulanern stammt. ({{ENT|Babel}})
Phlox behandelt Talas' Verletzung und lässt sie auf die Krankenstation bringen. Nachdem Shran einige Zeit mit ihr gesprochen hat, fordert Phlox ihn auf zu gehen, da Talas Ruhe bräuchte. Allerdings kann er sie nicht retten und muss Archer und Shran wenig später den Tod von Talas mitteilen. Shran fordert daraufhin [[Naarg]] zum [[Duell]]. Damit die Allianz nicht scheitert, nimmt Captain Archer dessen Platz ein. Vor dem Kampf rät Phlox Archer noch, dass er versuchen soll, Shran zu erschöpfen. Da der andorianische Stoffwechsel höher sei als der der Menschen, könne er Shran so erschöpfen. Beim Duell schneidet Archer Shran eine seiner Antennen ab und gewinnt so den Kampf. Phlox behandelt anschließend Shran und teilt ihm mit, dass man mit Wachstumsstimulanzien und Massagen das Wachstum der Antenne beschleunigen kann, sodass er in vier bis fünf Monaten statt der sonst üblichen neun Monate wieder der Alte sein werde. Shran schickt nach dem Kampf einige Schiffe für die [[Allianz (2154)|Allianz]] aus Menschen, Andorianern, Vulkaniern und Tellariten, um das romulanische Drohnenschiff zu finden. ({{ENT|Vereinigt}})
Die ''Enterprise'' kehrt zur Erde zurück und Phlox besucht dort mit Hoshi einen Restaurant. Als sie anschließend durch die Straßen spazieren, werden sie von drei [[Rigelianer]]n angegriffen, die Hoshi betäuben und Phlox entführen. Diese bringen ihn zu den [[Klingone]]n in der [[Qu'Vat-Kolonie]], wo er Dr. [[Antaak]] helfen soll, ein Gegenmittel gegen ein Virus zu finden, dass verschiedene Planeten des klingonischen Reichs infiziert habe. Als er nach einem Probanden fragt, wird ein Infizierter gebracht. Daraufhin sagt er, dass er eine Leiche zum Sezieren wollte, doch Antaak sagt, dass er nicht mehr lange leben würde. [[K'Vagh]] erschießt den Mann schließlich und weist Phlox an, weiterzuarbeiten. Bei seinen Untersuchungen erkennt Phlox, dass die Klingonen versuchten, Augments zu erschaffen. Jedoch war eine der Testpersonen mit der [[Levodianische Grippe|levodianischen Grippe]] infiziert, was zur Mutation des Virus führte und diesen nun wie eine Seuche über die Luft verbreitet. Dies soll Phlox stoppen. Als man erfährt, dass der Hohe Rat eine Flotte losgeschickt hat, um die infizierten Kolonien zu vernichten, wollen sie Augments erschaffen, um den Rat zu zwingen, ihnen Zeit zu geben. Als Phlox dabei seine Mithilfe verweigert, wird er eingesperrt. ({{ENT|Die Heimsuchung}})