Janeway meint, dass sie eindeutig in einer Zeitschleife befinden. Chakotay schlägt vor in den Teil des Weltrausm Weltraums zurückzukehren, in dem sie sich zu Anfang befanden. Janeway stimmt zu. Sie meint, dass wenn es sich um ein temporales Feld handelt, dieses mit einem Tachyonausstoß aufgelöst werden könnte. Sie wollen den Kurs ändern, entdecken aber auf den Sensoren bereits zwei vidiianische Schiffe in 20 Millionen Kilometern Entfernung mit Kurs auf sie. Daraufhin ruft Chakotay die ''Voyager''. Chakotay meldet Tuvok, dass sie von zwei vidiianischen Schiffen verfolgt werden. Tuvok setzt einen Abfangkurs und scannt nach temporalen Anomalien. Chakotay und Janeway stoßen einen [[Tachyon]]impuls aus. Die zwei sich nähernden vidiianischen Schiffe lösen sich auf, ehe sie in Waffenreichweite gelangen. Janeway ortet Reste einer temporalen Signatur. Sie schlussfolgern daraus, dass die Schiffe zur Zeitschleife gehörten. Tuvok teilt ihnen mit, dass sie in vier Minuten landen werden. Sie kehren auf die ''Voyager'' zurück. Captain Janeway betritt die Brücke und möchte die [[Zeit]]schleife, oder was immer es war, genauer untersuchen. Sie ordnet die Durchführung eines temporalen Ebene-2-Scans an. B'Elanna Torres meldet sich zu Wort, sie weiß nicht was Captain Janeway meint, auch Chakotays Erinnerungen weichen ab. Er berichtet, dass die Vidiianer sie angriffen, aber sie unversehrt aufs Schiff zurückkehren konnten. Tuvok erklärt, dass sie beide vom Doktor untersucht wurden und ihre Verletzungen behandelt wurden. Dann kamen sie hierher, aber Chakotay kann sich nicht an die Zeitschleife erinnern. Janeway erkennt, dass sie die einzige ist, die andere Erinnerungen hat. Sie will sich deshalb vom [[Der Doktor|Doktor]] untersuchen lassen und geht auf die [[Krankenstation]]. Inzwischen sollen sie dennoch die temporalen Scans durchführen.

Doch bald sieht man die ersten Spuren der Krankheit an Janeways Gesicht und Händen und der Doktor hat immer noch keinen Behandlungsmöglichkeit. Als Janeway nach 40 Stunden aufwacht, meint der Doktor das diese Abart der Fresszelle besonders ansteckend sei und sich schnell ausbreite. Der Doktor bedauert, dass seine Suche nach einer Heilungsmethode erfolglos war. Er meint, dass sie einen langen, schmerzhaften Tod erwarten muss, der von immer größeren Perioden geistiger Umnachtung gekennzeichnet sein wird. Er meint daher die humanste Methode ist Sterbehilfe. Da ein dermaßen langer und schmerzhafter Tod unzumutbar sei und nachteilige Auswirkungen auf die Crew hätte, schlägt er dies vor. Janeway schlägt vor, die DNA von Torres zu nutzen, doch der Doktor meint, dass dies nur ein Linderungs-, aber kein Heilmittel hervorbringen könne. Mit einem gasförmigen [[Nervengift]] bringt er sie um und bittet sie tief einzuatmen, da sie so schneller sterben werde. Sie versucht noch mithilfe des Schiffscomputers das MHN zu löschen, aber ihr Sicherheitscode [[Janeway Lambda Drei]] ist nicht in der Datenbank ist und der Befehl kann daher nicht ausgeführt werden. Während sie zu Boden sinkt, fleht sie den Doktor an, diese Entscheidung zurückzunehmen. Jedoch lässt er sie sterben.

Sie erlebt, wie auch der Doktor auf der Krankenstation keinen Erfolg bei der Wiederbelebung hat. Dieser verabreicht 10 mg [[Cordrazin]] in Verbindung mit einem Kortikalstimulator. Kes stellt fest, dass Janeway keinen Puls, keinen Blutdruck und nur minimale elektrische Aktivität im Mittelhirn hat. In der Großhirnrinde gibt es keine messbare Reaktion. Nach einer erneuten Stimulation, zeigt sich eine schwache [[Gehirnwelle|Hirnwelle]] und der Doktor lässt 75 mg [[Inoprovalin]] verabreichen. Allerdings wird der Puls wieder schwächer und der Doktor lässt die Kortikalstimulatoren aktivieren. Jedoch zeigt der Captain keine Lebenszeichen oder Gehirnaktivität. Auch zwei weitere Impulse zeigen keine Wirkung, weshalb der Doktor im Computerlogbuch den Tod um 3:20 mit der Todesursache [[cerebrovaskulärer Kollaps]] eintragen lässt. Chakotay verlässt bestürzt die Krankenstation.

[[Datei:Trauerfeier_für_JanewayTrauerfeier für Janeway.jpg|thumb|Auf der eigenen Trauerfeier]]

Auf ihrer Gedenkfeier hört sich Janeway die Berichte von ihrer Crew an. B'Elanna erzählt von ihren Erfahrungen, wie sie wütend war, dass Janeway sie hier in den Deltaquadranten brachte und war anfangs nicht bereit sich ihrer Autorität zu fügen. Als Janeway sie zur Chefingenieurin machte, dachte sie, sie hätte sie eingesetzt um sie scheitern zu sehen. Jedoch gibt Torres zu, dass sie sich geirrt hat. Janeway sah in ihr eine wertvolle Person und bringt drückt ihre Dankbarkeit über das [[Vertrauen]], das sie in sie gesetzt, aus. Sie selbst sah sich jedoch als verlorene und einsame Eigenbrötlerin. Als Janeway starb, dachte sie, dass sie keine Zukunftsperspektive mehr hätte und, dass sie ihre Stärke und Mitgefühl brauchte. Dann wurde ihr aber bewusst, dass ihr Geschenk war, das Wissen war, dass sie stärker und besser sind, als sie denken. Chakotay fragt nach dieser Ansprache, ob noch jemand ein paar Worte sagen möchte. Harry meldet sich und meint, dass Janeway wollen würde, dass sie sich an die schönen Momente erinnern. Er berichtet von einer Außenmission, wo sie Büsche voller Beeren fanden und sie aßen. Der Captain kam und setzte sich neben ihn. Sie legte ihren Arm um seine Schulter und sagte, Fähnrich, das sind die Momente, an die wir uns erinnern müssen. Dann kann er nicht weitererzählen und Paris nimmt ihn beiseite. Chakotay meint, dass es ihnen allen nicht leicht fällt und sie den Captain ein letztes Mal ehren. Anschließend lässt Chakotay die Kapsel absetzen und die Gäste sehen dieser zu, wie sie in den Weltraum treibt. Auch Janeway und ihr Vater sehen die Kapsel hinaustreiben. Chakotay meint, dass Kim Recht hatte, dass der Captain nicht wollen würde, dass sie trauern und das sie bei einem [[Imbiss]] über die schöne Zeit mit Kathryn Janeway sprechen können. Ihr "Vater" will Janeway nun mitnehmen, da es für sie hier nichts mehr zu tun gebe.

[[Datei:Das_Böse_kehrt_in_seinen_Matrix_zurückDas Böse kehrt in seinen Matrix zurück.jpg|thumb|Das Böse kehrt in seine Matrix zurück]] Janeway fragt, was sie tun muss, um diesen Ort zu verlassen. Ihr Vater meint, dass sie sich nur zum Gehen entschließen muss. Einzig ihre Weigerung zu gehen, halte sie an diesem Ort fest. Janeway hät es für möglich, dass er die Wahrheit sagt, doch ist sie noch nicht bereit zu gehen. Er meint, dass Janeway jedesmal den schwereren Weg wählte, wenn es einen leichten und einen schweren Weg gab. Er berichtet auch, dass er sich selbst die Frage stellte, ob er gehen oder bleiben soll. Er hoffte, er würde dies ihr ersparen können. Er schildert ihr das Dasein hier auf dem Schiff als grausam, es wird zu Höllenqual für sie werden, da sie nichts tun kann. Sie würde sehen, wie die Menschen, mit denen sie zusammenlebte die gleichen Dinge tun werden, aber ohne sie. Dies will sie für sie verhindern. Janeway erklärt jedoch, dass sie noch nicht bereit sei und die Crew nicht verlassen könne. Sie meint, dass sie so viel zusammen durchgestanden haben und sehen will, wie Kes eine erwachsene Frau wird und lernt oder wie Tom und B'Elanna ihren ewigen Streit beilegen und endlich eine Freundschaft entwickeln könnten. Ihr "Vater" meint, dass sie nie aktiv teilnehmen kann. Janeway meint, dass sie immer noch die Vorgänge beobachten kann und lieber geistig auf ihrem Schiff ist, als gar nicht. Langsam wird er ungeduldig und aggressiv. Er meint, dass es mit jeder Stunde für sie schwieriger wird, das Schiff zu verlassen. Janeway entscheidet sich, hier zu bleiben.