Wenige Wochen später erreicht die ''Voyager'' die [[Nekrit-Ausdehnung]]. Neelix ist bewusst, dass er keine Kenntnisse über den dahinter liegenden Raum besitzt. Aus diesem Grund macht er sich Sorgen, dass er für das Schiff nicht mehr wichtig ist. Neelix empfiehlt Janeway zu einer [[~/Raumstation/VOY/3x13/1|einer Raumstation]] zu fliegen, um dort Vorräte aufzunehmen. Auf dieser Station trifft Neelix [[Wixiban]] wieder, mit dem er vor einigen Jahren illegale Geschäfte abgewickelt hat. Da [[Wixiban]] deswegen einige Jahre im Gefängnis gesessen hat und er ihm eine Karte der Nekrit-Ausdehnung anbietet, lässt sich Neelix auf ein illegales Geschäft ein. Mit Wixiban verkauft Neelix [[Sutok]] Medikamente. Jedoch werden sie überfallen und Wixiban erschießt Sutok. Neelix beamt sie auf [[~/Raumschiff/VOY/3x13/1|das Shuttle]] zurück und macht Wixiban klar, dass er nichts mehr mit ihm zu tun haben will. Der Leiter der Station [[Bahrat]], entdeckt, dass Sutok mit einem Phaser der Föderation getötet wurde und er meldet die Janeway. Tuvok verhört darauf jeden, welcher zur Tatzeit auf der Station gewesen ist. Neelix wird von Tuvok insbesondere über Wixiban befragt. Anschließend soll Neelix ihn zum Verhör mit Wixiban begleiten. Nach dem Gespräch bleibt Neelix bei Wixiban und spricht mit ihm. Dieser offenbart Neelix, dass er das Geschäft nur als Vermittler für [[Kolaati]]händler eingefädelt hat, die die Angelegenheit nicht auf sich beruhen lassen werden. Sie verlangen eine Probe vom [[Warpplasma]] der ''Voyager''. Inzwischen werden Chakotay und Paris verhaftet, da er die beiden für den Mord an Sutok verdächtigt. Darauf stellen sich Neelix und Wixiban Bahrat. Sie handeln mit Bahrat aus, dass er Chakotay und Paris freilässt und sie straffrei davonkommen lässt, wenn sie ihm helfen den Drogenhändlerring auszuheben. Dazu treffen sie sich mit [[Tosin]]. Kurz bevor dieser eintrifft, öffnet Neelix den [[Sicherheitsknoten]] des Plasmabehälters, sodass sich die Sektion mit Plasma füllt. Als sie dies Tosin offenbaren, feuert einer von Tosins Männern und löst eine Explosion aus. Dabei wird Neelix leicht verletzt, während ein Kolaati stirbt. Neelix erwacht auf der Krankenstation, wo ihn der Doktor behandelt. Anschließend stellt Janeway Neelix zur Rede. Er offenbart ihr, dass es um eine Karte ging und er sich sorgte, dass er für sie nutzlos werden würde. Janeway meint, dass sie alle nicht wissen, was kommt. Sie müssen sich aber aufeinander verlassen können. Zur Strafe soll Neelix zwei Wochen bei der [[Deuteriumwartung]] die [[Abgassammler]] säubern. Die Voyager fliegt darauf in der Nekrit-Ausdehnung. ({{VOY|Das Wagnis}})
Mitte [[Datei:Inversionsnebel.jpg|thumb|Die ''Voyager'' entdeckt einen Inversionsnebel.]] Einige Wochen später erforscht die ''Voyager'' einen [[Inversionsnebel]]. Zu Janeway Erstaunen, ist dieser Nebel stabil und löst sich nicht schnell auf wie die bekannten Inversionsnebel im Alpha-Quadrant. Zu dieser Zeit verliebt sich Kim in die Holofigur [[Marayna]]. Kim bittet darauf Tuvok ihn eine vulkanische Gedankenkontrolltechnik zu lehren, damit er mit seinen Gefühlen umgehen kann. Sie begeben sich daher auf das Holodeck. Dort lernt Tuvok die Holofigur kennen und bemerkt wie nervös Kim reagiert. Kurz nachdem die beiden mit Maryana allein sind, werden sie jedoch auf die Brücke gerufen. Auf dem Weg zur Brücke empfiehlt Tuvok Kim sich von dem Hologramm fernzuhalten und zu meditieren. Zu dieser Zeit veranstaltet Neelix ein [[Lūʻau]] auf dem Holodeck. Ein großteil der Crew nimmt an dieser Veranstaltung teil. Auch Tuvok nimmt widerwillig daran teil. Dort trifft Tuvok auf Marayna, welche [[Kal-toh]] spielt. Beide kommen darauf ins Gespräch und spielen zusammen. Tuvok ist fasziniert von dieser Marayna und sie unterhalten sich eine ganze Nacht lang. Als Kim jedoch entdeckt, dass Marayna sich mit Tuvok unterhält, reagiert dieser eifersüchtig auf ihn. Darauf löscht Tuvok die Holodeckfigur. Später erscheint Marayna ausgestattet mit dem [[Mobiler Emitter|Mobilen Emitter]] des Jahres baut Doktors in Tuvoks Quartier. Tuvok jedoch alarmiert die Sicherheit, da es nicht sein könne, dass eine Holodeckfigur die Kontrolle über die Systeme hat. Marayna beginnt Tuvok zu bedrohen und verschwindet darauf. Um Marayna aufzuhalten, begeben sich Tuvok, Paris und Torres auf das Holodeck. Dort werden sie aber von den Holofiguren angegriffen. Im letzten Moment kann Paris das Programm deaktivieren. Inzwischen wird die ''Voyager'' von Energieentladungen aus dem Nebel angegriffen. Schließlich entdeckt die Crew die Quelle, wo das Signal von Marayna herkommt. Tuvok beamt auf einem eine Station, in der sich eine einsame Frau befindet, welche die Kontrolle über den Inversionsnebel hat und auch die Kontrolle über die Holofigur Marayna übernommen hat. Diese einsame Frau wollte über das Holodeck Kontakt mit der Crew und Tuvok aufnehmen, doch Tuvok gelingt es schließlich sie davon zu überzeugen die ''Voyager'' wieder frei zu geben. Nach diesen Ereignissen entschuldigt sich Tuvok bei Kim für sein Verhalten und lädt ihn auf ein Spiel [[Kal-toh]] ein. ({{VOY|Das andere Ego}}) [[Datei:Voyager im Orbit des Planeten der Sakari-Kolonie.jpg|thumb|left|Die ''Voyager'' im Orbit des Planeten der Sakari-Kolonie.]] Wenig später veranstaltet Neelix einen [[Talenteabend]] an Bord der ''Voyager''. Tuvok liest dort einige vulkanische Gedichte vor und langweilt die Crew damit. Neelix bittet Janeway darauf, dass Tuvok beim nächsten Talenteabend Dienst auf der Brücke hat. Kurz darauf stürzen Janeway und Chakotay mit [[Sacajawea|ihrem Shuttle]] auf einen [[Sakari~/Planet/VOY/3x15/1|Planeten]]. Janeway wird dabei schwer verletzt und fällt darauf ins Koma. Während sie im Koma liegt, versucht eine [[Janeway (Fremde Präsenz)|Fremde Präsenz]] Janeway in eine Art [[Jenseits]] zu locken, um sich dort von ihrer [[Seele]] zu ernähren. Währenddessen treffen der Doktor und Tuvok auf dem Planeten ein und der Doktor versucht Janeway wiederzubeleben. Doch eine Zeit lang sieht es so aus, als würde der Doktor Janeway verlieren, doch sie kämpft gegen die fremde Präsenz an und vertreibt diese Präsenz. Darauf erlangt Janeway wieder ihr Bewusstsein. ({{VOY|Der Wille}}) Einige Zeit entdeckt die ''Voyager'' [[Gallizit]] -Vorkommen auf [[~/Planet/VOY/3x16/1|einem Planeten]]. In dieser Zeit leidet Fähnrich [[Vorik]] unter dem [[Pon Farr]] und will sich mit Torres paaren. Als Vorik aufdringlich wird, wehrt Torres diesen abund schlägt Vorik nieder. Wenig später beamen Torres, Neelix und Paris auf die Planetenoberfläche, um das Gallizit abzubauen. Die Drei klettern tief in die Höhlen hinein. Doch während des Klettern stürzt Neelix und verletzt sich schwer und Paris kümmert sich um diesen. Allerdings reagiert Torres plötzlich sehr aggressiv auf Neelix und als Paris diese aufhalten will, beißt sie Paris. Darauf verschwindet Torres und Paris meldet diesen Vorfall an die Brücke. Als Paris das Verhalten von Torres beschreibt, erkennt Tuvok, dass Torres, aufgrund einer telepathischen Verbindung mit Vorik, unter dem Pon Farr leidet. Tuvok, Chakotay und Paris suchen nach Torres und schließlich finden sie diese. Doch dabei trifft das Außenteam auf die [[Sakari]] und Torres fühlt sich von diesen bedroht. Die Sakari sind vor einiger Zeit von einer unbekannten Rasse angegriffen wurden und seitdem leben diese versteckt unter der Oberfläche des Planeten. Als Torres die Sakari angreift, stürzt eine Wand ein und Paris und Torres werden von den anderen getrennt. Paris und Torres versuchen einen Weg aus den Höhlen heraus zu finden und Torres will sich aufgrund des Pon Farrs mit Paris paaren. Doch Paris will diese Situation nicht ausnutzen, da er ihre Freundschaft nicht zerstören will. Wenig später werden die beiden von Chakotay und Tuvok gefunden und gerettet. Da das Außenteam mit der ''Voyager'' keinen Kontakt aufnehmen kann, muss sich Paris mit Torres paaren, damit Torres das Pon Farr vollständig durchlebt. Plötzlich taucht Vorik auf, greift Paris an und fordert diesen zum [[Koon-ut-kal-if-fee]] heraus. Vorik ist auch dafür verantwortlich, dass das Außenteam keinen Kontakt zur Wartung des Warpantriebs benötigt ''Voyager'' herstellen kann. Paris will den Kampf mit Vorik annehmen, allerdings will Torres selbst gegen Vorik kämpfen. Durch den Kampf der beiden wirdihr Pon Farr gelöst. Dabei stößt man Nach diesen Ereignissen bekommt die Crew das erste mal Gallizit, im Gegenzug hilft die Crew den Sakari sich besser zu verbergen. Kurz darauf entdecken Janeway und Chakotay einen [[~/Person/VOY/3x16/1|toten Angreifer]] vor welchen sich die Sakari fürchten, es sind die [[Borg]]. ({{VOY|Pon Farr}}) [[Datei:Voyager beim Kubus in der Nekrit-Ausdehnung.jpg|thumb|Die ''Voyager'' beim Kubus in der Nekrit-Ausdehnung.]] Während die ''Voyager'' weiter die Nekrit-Ausdehnung durch fliegt, erkunden Chakotay und [[Marie Kaplan]] mit [[~/Raumschiff/VOY/3x17/3|einem Shuttle]] die Region. Allerdings verirren die beiden sich und fliegen am selben [[Asteroidengürtel]] vorbei, welchen diese bereits vor kurzem angeflogen haben. Beide entdecken darauf ein [[Notsignal]] und sie glauben es stammt von der ''Voyager''. Chakotay und Kaplan landen mit dem Shuttle auf die [[~/Planet/VOY/3x17/1|einem nahegelegenen Planeten]], von welchen das Signal stammt. Dort werden beide von ehemaligen [[Borg]]angegriffen und Kaplan kommt dabei ums Leben. Chakotay wird von einer menschlichen Frau namens [[Riley Frazier]] gerettet. Chakotay ist verwundert, wie diese in Form einer toten den Delta-Quadranten gelangt, aber sie meint sie wurde zu diesem Planeten transportiert. Während die ''Voyager'' auf das Shuttle wartet, trifft das Schiff auf einem treibenden [[~/Raumschiff/VOY/3x17/2|Borg-Kubus]]. Da es keine Lebenszeichen an Bord des Kubus gibt, schickt Janeway ein Außenteam auf den Kubus. Das Außenteam findet nur [[~/Person/VOY/3x17/10|tote Drohnen]] vor und eine Drohnewird an Bord der ''Voyager'' gebracht. Der Doktor beginnt die tote Drohne zu untersuchen, doch dabei aktiviert er aus Versehen ein Energierelais des Borg und der Borg erwacht plötzlich wieder zum Leben. Der Doktor kann den Borg zwar wieder deaktivieren, doch nun wurde die ursprüngliche Programmierung des Borgs wieder hergestellt. Darauf versucht Janeway herauszufinden, was mit dem Kubus geschehen ist. Zur selben Zeit entdeckt, dass es sich bei Frazier und ihren Gefährten um ehemalige Borg-Drohnen handelt, welche auf den Planeten eine [[Kooperative]] gebildet haben. Allerdings wird diese Kooperative von anderen ehemaligen Drohnen bedroht. Wenig später entdeckt die ''Voyager'' das Signal von Chakotay. Frazier erklärt, dass sie und die anderen Borg von dem verlassenen Kubus stammen, nachdem dieser durch einen [[Elektromagnetischer Sturm|elektromagnetischen Sturm]] schwer beschädigt wurde. Sie möchte den den [[Neuroelektrischer Generator|Drohneneuroelektrischen Generator]]des Kubus zu aktivieren, um die anderen Drohnen auf den Planeten zu bringen. Doch Janeway lehnt dies ab. Später kontrolliert die Kooperative, damit dieser den neuroelektrischen Generator aktiviert. Die ehemaligen Drohnen auf den Planeten gehören nun zur Kooperative, allerdings aktivieren sich auch die Drohnen auf den Kubus. Damit diese nicht zur Gefahr werden, aktiviert die Kooperative die Selbstzerstörung des Kubus und die ''Voyager'' setzt ihre Reise fort. ({{VOY|Pon FarrDie Kooperative}})
Ende des Jahres [[2373]] begegnet die ''Voyager'' erstmals [[Spezies 8472]], als sie in das Gebiet der Borg hinein fliegt. Diese Spezies stellt sich als extrem feindselig und den Borg überlegen heraus. Um das Borg-Territorium sicher durchqueren zu können, geht die Crew eine kurze Allianz mit den Borg ein, um sie im Kampf gegen Spezies 8472 zu unterstützen. Mit Hilfe von [[Nanosonde]]n der Borg wird auf der ''Voyager'' eine wirkungsvolle Waffe gegen Spezies 8472 entwickelt. ({{VOY|Skorpion, Teil I}})