[[2364]] befindet sich die ''Melbourne'' in der [[Sternenbasis 74]] zur [[Reparatur]]. Zu dieser Zeit wird die [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-D)]] von den [[Bynar|Bynaren]] entführt. Die ''Melbourne'' kann der ''Enterprise '' aber nicht folgen, da sich das Raumschiff noch in der Reparatur befindet. Später gelingt es [[Captain]] [[Jean-Luc Picard]] die ''Enterprise'' zur Sternenbasis zurück zu bringen. ({{TNG|11001001}})

Sie wird Ende [[2366]] in bietet [[Admiral]] [[J.P. Hanson]] [[Commander]] [[William T. Riker]] das Kommando über die ''Melbourne'' an. Hanson ist der Meinung, dass es seiner Karriere schadet, wenn Riker nicht die [[Beförderung]] zum [[Captain]] annimmt. Auch Captain Picard versucht Riker zu überzeugen, den Posten als Captain an Bord der ''Melbourne'' anzunehmen. Doch Riker will lieber an Bord der ''Enterprise'' bleiben. ({{TNG|In den Händen der Borg}}) Kurz darauf kämpft die ''Melbourne'' bei der [[Schlacht von Wolf 359]] zerstörtgegen die [[Borg]]. [[Lieutenant]] [[Gregory Bergan]] ist zu dieser Zeit an Bord stationiert. Gemeinsam mit den anderen Schiffen greift die ''Melbourne'' den [[Borgkubus]] an. Doch deren [[Phaser]] richten keinen großen Schaden an. Anders sieht es jedoch bei den Borg aus. Deren Phaser haben mehr Durchschlagskraft und der erste Schuss zerstört die Untertassensektion der ''Melbourne''. In Folge des Kampfes wird die ''Melbourne'' vollständig zerstört. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil I}}; {{VOY|Das Vinculum}}) Als einige Zeit darauf die ''Enterprise'' [[Wolf 359]] erreicht, nennt Commander [[Elizabeth Shelby]] die ''Melbourne'' als eins der zerstörten Schiffe von der Schlacht gegen die Borg. ({{TNG|Angriffsziel Erde}})