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Als B'Elanna durch die [[Automatische Einheit 3947]] entführt wird, registriert er auf der Brücke die Aktivierung des Transporters. Anschließend versucht er das fremde Schiff zu analysieren. Seine Analyse bleibt jedoch ergebnislos, da die Sensoren der ''Voyager ''die Schilde des Raumschiffs der Androiden nicht durchdringen können. Als die ''Voyager'' durch das [[Pralor]]-Raumschiff angegriffen wird, meldet er Schäden. DIe Kämpfe werden durch die Einwilligung Torres' den Automatischen Einheiten zu helfen, unterbrochen. Während Torres arbeitet, plant er zusammen mit den anderen Führungsoffizieren die Befreiung von B'Elanna. Bei der Durchführung der erfolgreichen Rettungsaktion übernimmt er das Steuer des Schiffs. ({{VOY|Prototyp}})
Nachdem die USS Voyager bei einem Angriff der Kazon schwere Schäden erleidet und drei Besatzungsmitglieder getötet werden, schlägt er dem Captain vor, Verhandlungen mit den Kazon aufzunehmen. Er meint, dass sie es sich nicht leisten können, so weiterzumachen wie bisher. Wenig später hält er die Trauerrede für Kurt Bendera. Anschließend spricht er mit Janeway über eine mögliche Allianz mit den Kazon. Bei einer anschließenden Besprechung der Führungsoffiziere, ist er vom Vorschlag mit den Nistrim und Seska zu verhandeln, nicht begeistert. Daher übernimmt Janeway es selbst, Seska zu kontakten. Nachdem diese Verhandlungen vorerst scheitern und Neelix Kontakt zu den [[Trabe]] herstellt. Mit diesen, schließen sie eine Allianz, was die Kazon zu Verhandlungen auf Sobras bewegt. Während dieser Verhandlungen hat er das Kommando auf der ''Voyager'' und überwacht die Kazon-Schiffe sowie die Oberfläche des Planeten. Als ein Anschlag auf die Konferenz verübt wird, lässt er das Außenteam hochbeamen und die ''Voyager'' verlässt den Planeten schnellstmöglich. ({{VOY|Allianzen}})
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