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Aufgrund seiner Erfahrung unterrichtet Phlox einige Zeit an der Universität. ({{ENT|Freund oder Feind}})
[[2150]] ist er im [[Interstellares Austauschprogramm für Ärzte|interstellaren Austauschprogramm für Ärzte]] und kommt so zu einer Anstellung im [[Medizinisches Corps der Sternenflotte|medizinischen Corps der Sternenflotte]]. Für einige Monate arbeitet Phlox auf [[Cold Station 12]]. Darauf arbeitet dort Phlox im Flottenhospital auf der [[Erde]]. Doktor [[Jeremy Lucas]] hilft ihm sich dort einzugewöhnen. Die beiden verbindet seitdem eine enge [[Freund]]schaft. ({{ENT|Lieber Doktor|Die Schockwelle, Teil I|Cold Station 12}})
Während seines Aufenthaltes dort beschäftigt sich Phlox auch mit verschiedenen [[Religion]]en der Erde. Er nimmt an einer [[Messe (Religion)|Messe]] auf dem [[Petersplatz]] teil, besucht zwei Wochen lang ein [[Tibet|tibetanisches]] [[Kloster]] und lernt dort in einem [[Chor]] zu singen. Phlox darf sogar am [[Tal-Shanar]] im [[Vulkanier|vulkanischen]] [[Konsulat]] teilnehmen. ({{ENT|Kalter Krieg}})
Kurz darauf greift eine Gruppe genetisch verbesserte Menschen, [[Augment]]s genannt, einen klingonischen Bird-of-Prey an und erobern diesen. Die ''Enterprise'' bekommt darauf den Auftrag diese Augments aufzuhalten. Doktor [[Arik Soong]], der die Augments aufgezogen hat, kommt an Bord, um der Crew bei der Suche zu helfen. Auf der Krankenstation unterhält Phlox sich mit Soong und er fragt, welche genetischen Modifikationen Soong an den Augments vornahm. Dieser meint jedoch, dass seine Arbeit für ihn spreche. Soong spricht nun an, dass er nicht wusste, dass Phlox Genmanipulationen ablehne. Phlox argumentiert, dass die [[Eugenische Kriege|eugenischen Kriege]] auf der Erde 30 Millionen Tote forderten. Die ersten Spuren des klingonischen Schiffes führen ins [[Borderland]], einer Region, welche vom [[Orion-Syndikat]] kontrolliert wird. Die ''Enterprise'' wird kurze Zeit später von zwei [[Orion-Abfangjäger]]n angegriffen und einige Crewmitglieder, darunter auch T'Pol, werden von den [[Orioner]]n entführt. Zusammen mit den anderen wird sie nach [[Verex III]] gebracht, einer Sklavenverarbeitungsstätte. Mit Hilfe von Soong gelingt es Archer, sie und die anderen Crewmitglieder aus der Hand der Orioner zu befreien. Die ''Enterprise'' flieht von Verex III, wird aber erneut von Orion-Abfangjägern verfolgt. Diese werden jedoch von dem Bird-of-Prey, welchen die Augments übernommen haben, ausgeschaltet. Kurz darauf kommt der Augment [[Malik]] an Bord der ''Enterprise'' und fordert von Archer Soong frei zu lassen, doch Archer lehnt dies ab. Malik demonstriert seine überlegende Fähigkeiten und warnt sogar Archer und Reed vor das er Archer gleich angreifen wird, doch trotz der Warnung kann Reed nicht verhindern, dass Malik den Captain als Geisel nimmt. Mit Archer als Geisel kann Malik Soong befreien und die Augments können mit Soong entkommen. ({{ENT|Borderland}})
Die Flüchtigen fliegen zur [[Cold Station 12]], um sich weitere Augment-[[Embryo]]nen zu beschaffen. Die ''Enterprise'' begibt sich inzwischen nach [[Trialas IV]], da Soong dort die Augments aufgezogen hat. Archer und sein Außenteam treffen dort auf [[Udar]], einem Augment welcher zurück gelassen worden ist. Udar kommt schließlich mit auf die ''Enterprise'' und diese fliegt darauf nach Cold Station 12. Phlox untersucht Udar und stellt fest, dass er nicht wie die anderen Augments besondere Fähigkeiten hat. Während man die Augments auf ihrem Flug nach [[Cold Station 12]] verfolgt, sorgt sich Phlox um seinen Freund Dr. Doktor Lucas, der dort stationiert ist. Daher kann er auch nicht genug essen, wie er es eigentlich in Vorbereitung auf seinen Winterschlaf tun müsste. Stattdessen unterhält er sich mit Archer über die Gentechnik. Nachdem man sich entschließt, ein Team auf die Auf Cold Station zu bringen, das 12 nehmen die Augments ausschalten sollGeiseln, begleitet Phlox dieses darunter auch Lucas. Malik und sabotiert die Sauerstoffversorgung Soong wollen Embryonen der Augemts von der Stationmitnehmen und verhören deswegen Lucas. Phlox gehört zum Außenteam, welches die Geiseln retten soll. Anschließend werden sie jedoch Doch schließlich wird das Außenteam von den Augments überwältigt und gefangen genommen und zu den anderen Geiseln gebracht. Phlox geht zu Lucas, der sich wundert, ihn hier zu sehen. Als sich die ''Enterprise'' der Station nähert, will Malik Phlox in die eine Kammer sperren, weil er die Freundschaft zwischen ihm und Lucas bemerkt hatihn mit Erregern infizieren. Kurz bevor So will Malik die Erreger freisetzt, gibt an Informationen von Lucas den Code heraus und Soong befiehlt Malikgelangen. Den Augments gelingt es darauf, Phlox aus von der Kammer Station mit den Embryonen zu holenfliehen. Die Augments verlassen wenig später die Station. Vorher Malik setzt Malik vorher jedoch noch einen Countdown in Gangtödliche Krankheitserreger frei, der alle Krankheitserreger welche die verbliebenen Leute auf der Station freisetzen wirdzu töten drohen. ({{ENT|Cold Station 12}})
Als die Führungsoffiziere [[Basketball]] in ihrer Freizeit spielen, spielt Phlox abwechselnd für eines der Teams, da er jeden Ball im Korb versenkt. Nachdem er mit Tucker und Mayweather spielt, freuen diese sich diebisch, dass sie Reed, Hoshi Sato und Archer geschlagen haben. Wenig später erfährt man von Bei einem Anschlag auf die irdische [[Botschaft der Erde ]] auf [[Vulkan]] gibt es 43 Todesopfer, darunter auch Admiral Forrest, zu beklagen. Daraufhin wird die ''Enterprise'' dorthin geschickt und führt eine Untersuchung durch. Dr. Phlox untersucht die DNA-Spur, die angeblich beweist, dass [[T'Pau]] und die [[Syrranit]]en für den Anschlag verantwortlich seien. Er informiert Tucker jedoch wenig später, dass diese DNA aus T'Paus Akte stamme und dies gegen ihre Täterschaft spricht. Man erkennt, dass Corporal [[Askwith]] den Attentäter gesehen haben muss. Da dieser im [[Koma]] bei Phlox liegt, suchen sie einen Weg, mit ihm sprechen zu können. Sie überzeugen daher Soval eine Gedankenverschmelzung mit Askwith zu machen und erfahren so, dass [[Stel]] die Bombe legte. ({{ENT|Der Anschlag}})
Nachdem der von Shran entführte und verhörte Botschafter Soval zurück auf die ''Enterprise'' gebracht wird, behandelt er ihn auf der Krankenstation. ({{ENT|Kir'Shara}})
Wenn er seinen [[Kind]]ern [[Lied]]er [[Gesang|vorsingt]], bringt sie das oft zum Weinen. ({{ENT|Sturmfront, Teil I}})
==== Feezal ====
Einige Wochen später glaubt Sato sie leide unter Halluzinationen und Phlox versucht sie zu beruhigen. Er erklärt ihr, dass es bei Denobulanern etwas besonders ist wenn diese Halluzinieren. ({{ENT|Exil}})
Nachdem die ''Enterprise'' zur Erde zurück gekehrt möchte Sato mit Phlox ins Madame Chang's gehen, doch Phlox möchte aufgrund der feindseeligen Reaktion der Menschen auf ihn sie nicht begleiten. ({{ENT|Zuhause}})
=== Liebesbeziehungen ===
