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Sie erkunden den Planeten und entdecken dort ein Raumschiff. Als sie dieses erreichen, hören sie plötzlich einen Mann rufen, derauf der auf einem Felsmassiv steht und um ihre Hilfe bittet, um jemanden aufzuhalten. Dann stürzt er herunter und das Außenteam eilt ihm zu Hilfe. Er wird auf das Schiff gebracht.

Lazarus erklärt Kirk, dass er auf der Jagd nach dem Teufelsgezücht auf den Planeten kam. Äußerlich ist es humanoid, aber innerhlich innerlich ein mordlustiges Monster. Er schwört, dass er ihn fangen wird. Er erklärt, dass es kein Mensch sondern ein Ding sei, dass alle Menschen auf seinem Planeten getötet hat. Kirk fragt, wie er selbst entkommen konnte und Lazarus antwortet, dass er die magnetischen Kommunikationssatelliten inspizierte. Kirk meint, dass sie vor seiner Ankunft einer Reihe von ungewöhnlichen Effekten begegneten. Lazarus fragt, ob er sich seiner heiligen Sache anschließt und Vergeltung und Rache an ihm zu üben. Kirk antwortet, dass er nur seine Befehle ausführt. Dann beamen sie hinunter und prüfen seine Geschichte.

Auf dem Planeten suchen Spock, Kirk und Lazarus nach der Lebensform. Spock vermutet, dass er sie belügt. Lazarus erinnert Kirk, dass er selbst angab, dass seine Geschichte plausibel sei. Der Captain stellt klar, dass sie weitere Untersuchungen durchführen müssen. Da hat Lazarus plötzlich Schmerzen und erklärt, dass sie wiederkommen und weitermachen. Sie sollen ihm folgen. Lazarus schreit, dass er ihn in den lodernden Flammen der Hölle verbrennen wird und taumelt umher. Seltsame Phänomene tauchen auf und Lazarus kämpft mit einem Mann. Schließlich kehrt er auf den Planeten zurück und taumelt umher. Kirk bemerkt ihn hinter sich und begibt sich zu ihm. Lazarus sagt, dass er das Ding wieder sah und es ihn angriff. Spock erklärt, dass das Zentrum des Effekts hier an dieser Stelle sein muss. Lazarus erklärt, dass das Wesen scharzschwarz-weiß ist und sie umbringen wird, wenn sie es nicht zuerst töten.

Spock meldet Kirk, dass er keine Erklärung für die Phänomene finden konnte. Kirk meint, dass es diesen anderen Humanoiden geben muss. Spock meitmeint, dassdies dass dies immer auftrat, wenn Lazarus ihn verbal angriff. Uhura meldet Kirk nun, dass McCoy ihn auf der Krankenstation braucht.

In einem Gang tritt das Phänomen wieder auf und Lazarus stützt sich an der Wand ab. Anschließend geht er durch das Schiff in den Maschinenraum. Dort arbeitet Masters derweil und schließt zwei Klappen. Ein Lieutenant informiert sie, dass sie die Brücke rufen soll. Kirk fragt, ob sie in zehn Minuten eine Versuchsanordnung aufbauen könne und Marsters Masters prüft dies. Inzwischen überwältigt Lazarus den anderen Ingenieur. Als sie meldet, dass die Schaltung in zehn Minuten funktioniert, betäubt Lazarus auch sie. Kirk fragt nach, doch sie antwortet nicht. In diesem Augenblick leitet Uhura die Meldung der Sicherheit weiter, dass Lazarus verschwunden sei.

Auf der Krankenstation der ''Enterprise'' meint McCoy, dass er bald wieder zu sich kommt. Lazars meint, dass sein Kopf wehtut. Kirk bedankt sich dafür, dass er ihm das Leben gerettet hat. Der Captain will nun noch einige Fragen stellen. Er hat eine Computeranalyse der Antworten seiner ersten Vernehmung ergeben hat, dass er gelogen hat. Es gibt keinen Planeten an der Stelle, wo er ihn angegeben hat. Lazarus meint, dass er ihm die Wahrheit nicht glauebn glauben soll. Doch Kirk meint, dass er es versuchen soll. Lazarus gibt an, dass er Hilfe und nicht Misstrauen, Freiheit und nicht Gefangenschaft, wgen wegen des Verdachts verrückt zu sein. Er sagt, dass sein Planet unmittelbar unter ihnen steht. Sein Raumschiff ist ein [[Zeitraumschiff]], ein Zeitbeamer. Er selbst sei ein ewiger Zeitreisender. Kirk fragt, ob sein Verfolger auch ein Zeitreisender sei. Er antwortet, dass er von einem toten Planeten kommt, den er zerstört hat. Sie dürften ihn nicht entkommen lassen. Kirk fragt, wo die Kristalle sind. Er antwortet, dass er ihn suchen kann. McCoy fordert Kirk auf, Lazarus in Ruhe zu lassen und den Sicherheitsoffizier von der Krankenstation zu entfernen. Kirk entspricht diesem Wunsch und geht dann. McCoy geht in sein Büro. Da steht Lazarus auf und taumelt durch den Raum. Er hat wieder Schmerzen.

Kirk bespricht mit Spock derweil im Konferenzraum und rekapituliert was sie haben. Spock meint, dass die Instrumente ihres Schiffs dazu gebaut wurden jedes Phänomen, egal ob Materie oder Energie in ihrem Universum zu identifizieren. Da ihre Instrumente in perfektem Zustand sind, erklärt Kirk, dass sie nicht aus ihrem Universum stammt. Spock meint, dass sie jetzt in ihrem Universum ist, aber von außerhalb stammt. Kirk vermutet eine andere Dimension, eine Parallelwelt. Spock meint, dass diese Möglichkeit von den Wissenschaften inzwischen anerkannt wird. Kirk fragt, was passieren würde, wenn dieses Universum sich mit einem Positivuniversum verbindet. Spock meint, dass sie bereits Kontakt haben und etwas von dem anderen Universum einfließt. Kirk fragt, wie er die Mentalität von Lazarus analysiert. Er ist in einem Moment paranoid und im anderen vernünftig. Es sei, als ob er zwei Personen sei. Kirk vergleicht das Loch nun mit einem Tor, dass beide Wesen passieren können. So erklärt sich Lazarus' Veränderungen und das Erscheinen und Verschwinden seiner Wunde. Spock meint, dass Wahnsinn keine Vernunft kennt, aber ein Ziel haben kann. Spock meint, dass die Universen aus Materie und Antimaterie bestehen können. Kirk meint, dass sie sich gegenseitig in einer Explosion auslöschen, wenn identische Partikel aufeinander treffen. Kirk meitmeint, dass diese Vernichtung passiert, wenn die beiden Lazarus aufeinander treffen.

Kirk findet sich auf einem Planeten wieder und sieht ein Schiff, dass dem von Lazarus ähnelt. Er begibt sich dorthin und sieht Lazarus. Dieser heißt ihn willkommen und meint, dass er ihn nicht erwartet hat. Kirk erklärt, dass er ihn erwartet hat. Kirk fragt, ob es ein Paralleluniversum ist, was er bestätigt. Dieses hier bestehe aus Antimaterie. Wenn identische Wesen beider Welten zusammentreffen, dann wäre das die Vernichtung. Er wollte ihn davon abbringen. Dhaer Daher hat er ihm die Dilithiumkristalle abgenommen. Kirk teilt ihm mit, dass er wieder zwei hat. Lazarus meint, dass sie ihn immer noch aufhalten können, aber wenig Zeit haben. Lazarus meint, dass der zufällige Übertritt seine Kristalle entladen hat und er etwa 10 Minuten braucht, um sie wieder zu laden. Kirk fragt nun, wie er hergelangt ist. Anti-Lazarus erklärt, dass es ein magnetischer Korridor sei. Weil sein Feind durch den Korridor wollte, ist es. Wenn sie sich raushalten, sind beide Universen sicher. Andernfalls ist es, als ob Sprengstoff unter den Türen ist. Der andere Lazarus ist wahnsinnig. Als ihr Volk ihre Welt verlassen konnte und von der Existenz eines anderen Universums erkannte, machte ihn wahnsinnig. Er wurde besessen von der Vorstellung ihn vernichten zu müssen. Anti-Lazarus reaktiviert nun die Kristalle. Er meint, dass wenn er das Universum verlässt, muss Kirk ihn aufhalten und ihn zwingen in den Korridor zu zwingen. Kirk soll sein Schiff zerstören. Er erklärt, dass damit auch sein Schiff zerstört wird. Sie würden beide in dem Korridor gefangen. Anti-Lazarus fragt rhetorisch, ob das ein zu hoher Preis wäre für die Rettung zweier Universen. Kirk antwortet, dass er bereit ist. Dann versetzt er Kirk zurück in sein Universum.

Auf dem Planeten lenkt Spock Lazarus ab, während sich Kirik Kirk von hinten anschleicht und versucht ihn zu überwältigen. Kirk will keine Einmischeung Einmischung der Sicherheitswachen. Anschließend kämpfen sie und Kirk gelingt es Lazarus festzuhalten. Dann stößt er ihn in sein Raumschiff und er verschwindet, während er noch ruft, dass er nicht fertig ist. Spock lässt nun die Kristalle ausbauen, während Kirk meint, dass das Schiff zerstört werden muss.

{{HGI|Im ersten Entwurf der Episode war ursprünglich eine romantische Beziehung zwischen Lazarus und Charlene Masters eingeplant, die jedoch später nicht umgesetzt wurde. Die genauen Gründe dafür sind nicht bekannt. Dave Eversole von ''Orion Press'' spekuliert, dass es an der Besetzung der Rolle von Charlene Masters mit [[Janet MacLachlan]], einer Afro-AmerikanerinAfroamerikanerin, lag, sodass die Beziehung die Rassenschranke überschritten hätte, was wohl auf viel Protest gestoßen wäre.<ref>{{Webbeleg|Autor=Dave Eversole|Art=Artikel|URL=http://www.fastcopyinc.com/orionpress/articles/alternative_factor2.htm|Titel=Report & Analyse zum ersten Entwurf des Skripts ''The Alternative Factor''|Haupt-URL=http://www.fastcopyinc.com/orionpress|Übertitel=Orion Press|Abgerufen=2012-06-10}}</ref> Durch den Verzicht auf den romantischen Subplot entstanden im Skript große Lücken, die in der letztendlich gedrehten Episode durch Ausdehnung der Szenen mit Lazarus, insbesondere seine langen Irrungen auf dem Planeten, gefüllt wurden. Zusammen mit den Dopplungen der Handlungen des „guten“ und des „bösen“ Lazarus enthielt die Episode dadurch sehr viele Wiederholungen und re­pe­ti­tive Elemente. Ed Harris von ''Agony Booth'' bemängelt dies in seiner Kritik der Episode: <q>Very little actually happens […] [T]his is one of the most poorly constructed fifty minutes I’ve ever seen. An almost impossibly incoherent script, a damp squib of a finale, and some horrible editing make this one of the true stinkers in the Trek universe.</q><ref>{{Webbeleg|Autor=Ed Harris|Art=Rezension|URL=http://www.agonybooth.com/tv/Star_Trek/the_original_series/The_Alternative_Factor.aspx?Page=1|Titel=''The Alternative Factor'' (Teil 1 von 6)|Haupt-URL=http://www.agonybooth.com|Übertitel=Agony Booth|Datum=2011-11-23|Abgerufen=2012-06-10}}</ref>}}