Trotz der Gefahr durch das Dominion führt die Föderation weitere Forschungsmissionen im Gamma-Quadranten durch. Im [[Trialus-System]] taucht plötzlich ein Planet aus dem Nichts heraus auf. Die Bewohner des Planeten rufen die ''Defiant'' und laden die Offiziere auf ihren Planeten [[Meridian]] ein. Die Bewohner erklären Sisko, dass ihr Planet immer für 60 Jahre in eine andere Dimension springt und sie dort als reine Gedanken leben, doch nun bleibt der Planet vorerst für die nächsten 12 Tage an diesem Ort. Darauf beamt ein Außenteam auf den Planeten. Bashir gefällt der Planet sehr und er nimmt an dem Essen mit den Bewohnern teil. In dieser Zeit verliebt sich Dax auf dem Planeten in [[Deral]]. Um auf Meridian bleiben zu können, nachdem der Planet in die andere Dimension wechselt, muss Bashir die [[Molekül]]e von Dax ändern. Aber dies funktioniert nicht und durch Dax Anwesenheit wird der Übergang in die andere Dimension gestört und sie droht dabei zu sterben. Im letzten Moment kann Dax auf die ''Defiant'' gebeamt werden und der Planet verschwindet ohne sie. ({{DS9|Meridian}})

[[Datei:Kira und Bashir küssen sich.jpg|thumb|left|Bashir und Kira küssen sich.]]

[[Datei:Sisko und Bashir in der Vergangenheit.jpg|thumb|Sisko und Bashir sitzen in der Vergangenheit fest.]]

Wenig später ist Bashir begeistert von den [[Zaubern|Zaubertricks]] von Dax. Er beobachtet sie gern dabei und er lernt auch von ihr einige Tricks um Quark zu ärgern. Später als [[Lenara Kahn]] an Bord der Station kommt, bittet Dax Bashir zu einer gemeinsamen Verabredung mit ihr und Kahn. Khan und Dax sind in einem früheren Leben verheiratet gewesen. Damit es nicht so aussieht, dass die beiden eine romantische Verabredung haben, begleitet Bashir sie, obwohl er zu Beginn nicht will. Dax und Khan unterhalten sich bei der Verabredung über ihre früheren Leben und Bashir beginnt sich sehr schnell zu langweilen. Erst als er wegen eines medizinischen Notruf gerufen wird, kann dieser endlich zu seiner Erleichterung gehen. Khan und Dax scherzen daraufhin, dass Bashir Dax diesen langweiligen Abend nie verzeihen wird. ({{DS9|Wiedervereinigt}})

[[Datei:Bashir und Dax gefangen.jpg|thumb|left|Bashir und Dax gefangen.]]

Einige Zeit später befindet sich die ''Defiant'' im Gamma-Quadranten, um mit den Karemma zu [[Verhandlung|verhandeln]]. Plötzlich wird die ''Defiant'' von den Jem'Hadar angegriffen. Sisko lässt das Schiff in einen [[Gasriese]]n fliegen, um den Jem'Hadar-Abfangjägern zu entkommen. Doch die Jem'Hadar folgen der ''Defiant'' in die Atmosphäre und es kommt zu schweren Gefechten, dabei wird die ''Defiant'' schwer beschädigt. Als sich ein Riss in der Hülle bildet, muss die Krankenstation evakuiert werden. Während Bashir die Evakuierung leitet, kommt es zu einer Explosion und dabei wird Dax verletzt. Bashir kann Dax noch rechtzeitig in eine Jefferies-Röhre bringen, bevor das schützende [[Kraftfeld]] um die [[Schiffshülle]] nachlässt. Die beiden sitzen in der Röhre fest, doch der [[Sauerstoff]] reicht nur für wenige Stunden und es wird immer kälter. Dax lehnt sich an Bashir an, damit die beiden sich gegenseitig wärmen. Für Bashir geht damit indirekt ein Wunsch in Erfüllung, er hat sich immer gewünscht mit Dax in eine Notsituation zu kommen, bei der sie dann zusammen kommen. Worf gelingt es in der Zwischenzeit die Dominionschiffe zu vernichten. Ein paar Stunden später können Dax und Bashir gerettet zu werden. ({{DS9|Das Wagnis}})

Einige Zeit später bricht Rom im Quark's zusammen und wird auf die Krankenstation gebracht. Bashir entdeckt bei Rom eine Infektion des [[Trommelfell]]s, an der Rom hätte sterben können. Als Bashir von Rom von den Schrecklichen Bedingungen im Quark's erfährt, rät er Rom eine [[Gewerkschaft]] zu gründen. Als Quark wenig später seinen Angestellten den Lohn kürzt, treten Rom und die anderen Angestellten in den Streik. Die Angestellten kämpfen um ihre Forderungen nach mehr Lohn und besseren Arbeitsbedingungen. Wenig später wetten Bashir und O'Brien vor der Bar, wer den Streik unterstützt oder die Bar besucht. Als Worf unerwartet die Bar besucht, wollen die beiden ihn aufhalten. Es kommt zu einer kleinen Rangelei in der Bar und Bashir wird von Worf über den Tisch geworfen. Odo greift schließlich ein darauf werden die Drei in eine [[Arrestzelle]] gebracht. Zur Strafe für dieses Verhalten lässt Sisko die Drei über Nacht dort. Kurz darauf geht Quark auf die Forderungen seines Bruders ein und der Streik wird beendet. ({{DS9|Der Streik}})

[[Datei:OBrien Selbstmord.jpg|thumb|Bashir versucht O'Brien davon ab zu halten sich um zu bringen.]]

Nachdem Worf wegen eines Angriffs auf einen klingonischen Transporter bei einem Prozess freigesprochen wird, organisieren O'Brien und Bashir eine Party für ihn. Worf will zuerst nicht mit feiern, doch Sisko ermutigt diesen mit zu feiern. ({{DS9|Das Gefecht}})

Kurz darauf übernimmt die ''Defiant'' die [[Argolis-Mission]]. Zu der Zeit ist Sisko der [[Adjutant]] von Admiral Ross und arbeitet auf der Sternenbasis 375 und Dax wird der neue Kommandant der ''Defiant''. Die ''Defiant'' hat bei dieser Mission den Auftrag eine [[Sensorenphalanx]] des Dominions zu vernichten. Während der Mission übernimmt Bashir die [[Conn]] für den erkrankten [[Haj]]. Dax ist erstaunt, dass Bashir ein so guter Pilot ist. Die Mission ist erfolgreich und die Phalanx wird vernichtet. Nach dieser Mission feiern die Offiziere bei Sternenbasis 375 ihren Erfolg. ({{DS9|Hinter der Linie}})

[[Datei:Bashir und O'Brien leiden.jpg|thumb|left|Bashir und O'Brien leiden während der Kal'Hyah.]]

Nach der Rückeroberung der Station planen Worf und Dax ihre [[Klingonische Hochzeit|Hochzeit]]. Worf fragt seine Freunde, ob sie an dem [[Kal'Hyah]]-Ritual teilnehmen. Bashir denkt sofort an eine Junggasellenabschiedsparty und sagt sofort zu. Aber in Wirklichkeit handelt es sich um eine harte Prüfung für die Ausdauer. So muss Bashir vier Tage in der Hitze fasten und dies zerrt sehr an seinen Kräften. Während der Prüfung des Blutes schläft Bashir schließlich vor Erschöpfung ein. Worf fragt darauf wer sich als erstes freiwillig meldet, um sich seine Adern aufschneiden zu lassen. Als O'Brien bemerkt, dass Bashir schläft, treten O'Brien, Sisko und [[Alexander Rozhenko]] einen Schritt zurück. Somit ist Bashir ohne es zu ahnen der erste Freiwillige für diese Prüfung. Später müssen Bashir und O'Brien über glühende [[Kohle]]n hängen und beide schwören sich bei Worf für diese Qualen zu rächen. Doch durch einen Streit von Worf und Dax wird die Hochzeit abgesagt. Als dies Bashir und O'Brien erfahren, freuen sie sich, dass sie endlich wieder was essen dürfen. Beide begeben sich darauf in Quarks, um dort etwas zu essen. Doch als Quark den beiden das Essen vorbei bringt, hält sie Sisko vom Essen ab, da die Hochzeit nun doch statt findet. Auf der Hochzeit dürfen die Teilnehmer der Kal'Hyah darauf das Paar symbolisch verprügeln. Bashir und O'Brien können es nicht erwarten zu schlagen zu können und Bashir fragt Martok ständig wann er endlich zuschlagen darf. Als die Hochzeit abgeschlossen ist, dürfen Bashir und O'Brien endlich auf Worf einschlagen und beide stürzen sich auf Worf, um sich für das Leiden, welches die beiden während des Kal'Hyah ertragen mussten, zu rächen. ({{DS9|Klingonische Tradition}})

Während der [[Zeit der Abrechnung]] zwischen den Propheten und den Pah-Geistern, bemerkt Bashir die ersten Anzeichen, als er sich mit seinen Freunden unterhält und die Station plötzlich erschüttert wird. Später findet der Kampf zwischen den Propheten und den Pah-Geist in den Körper von Kira und Jake Sisko auf dem Promenadendeck auf Deep Space 9 und Sisko lässt die Station evakuieren. Aber Kai Winn hält den Kampf auf, indem sie die Station mit [[Chronotonpartikel]]n überflutet. Bashir behandelt darauf die leicht verletzte Kira und Jake Sisko. ({{DS9|Zeit der Abrechnung}})

Bashir behandelt Quarks Mutter, nachdem sie durch einen Streit mit Quark einen Herzanfall bekommen hat. Da Quarks Mutter dadurch außer Gefecht gesetzt worden ist, muss Quark für die darauf folgende Verhandlungen ihre Rolle übernehmen. Um dies zu bewerkstelligen führt Bashir bei Quark eine [[Geschlechtsumwandlung]] durch, damit Quark eine Frau wird. Nachdem Quark als [[Lumba]] die Verhandlungen durchgeführt hat, macht Bashir die Geschlechtsumwandlung rückgängig. ({{DS9|Die Beraterin}})

Ende 2374 teilt Dax Bashir und Quark mit, dass sie und Worf sich ein Baby wünschen. Als dies Bashir und Quark erfahren deprimiert sie das sehr, da die beiden noch immer die Hoffnung haben, dass die Ehe von Worf und Dax nicht lange hält. Die beiden begeben sich ins Vics und blasen dort Trübsal. Aber Fontaine rät den beiden sich von Dax zu lösen, da es keinen Sinn macht ihr nach zu rennen. Bashir bedankt sich bei Fontaine für den Rat und nimmt diesen wahr. Als Dax später erfährt, dass sie und Worf genetisch kompatibel sind und ein Baby bekommen können, bedankt sie sich bei Bashir für alles und das er ein guter Freund ist. Kurz darauf befindet sich Dax im bajoranischen Tempel, um sich im Namen von Kira bei den Propheten zu bedanken das sie bald von Worf ein Kind bekommen wird. Plötzlich erscheint Dukat, welcher von einem Pah-Geist besessenen ist. Dieser greift darauf Dax an und verletzt sie schwer. Danach löscht der Pah-Geist den Drehkörper aus und das Wurmloch schließt sich. Bashir gelingt es zwar den Dax-Symbionten zu retten, aber Jadzia stirbt aufgrund ihrer schweren Verletzungen. nach dem Tod von Dax verlässt Sisko für unbestimmte Zeit die Station und dieser verabschiedet sich von seinen Offizieren ohne zu wissen ob er jemals zurückkehren wird. ({{DS9|Tränen der Propheten}})

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=== 2375 ===

[[Datei:Worfs Freunde sorgen sich um ihn.jpg|thumb|Bashir und seine Freunde machen sich Sorgen um Worf.]]

[[Datei:Zu Ehren von Dax.jpg|thumb|left|Bashir, O'Brien und Quark ziehen für Jadzia Dax in den Kampf.]]

[[Datei:Ausweichmartini.jpg|thumb|Bashir sorgt für Ablenkung.]]

[[Datei:Bashirs Verhör.jpg|thumb|left|Bashir wird von den Romulanern verhört.]]