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McCoy kennt Kirk jetzt seit drei Jahren und ist von seiner Idee, nachdem er schon zwei Mal durch den [[Kobayashi-Maru-Test]] geflogen ist, diesen ein drittes Mal zu machen, nicht begeistert und erklärt seinem Freund, dass noch niemand diesen Test geschafft hat. Kirk ignoriert den Einwand lächelnd und meint nur, dass er jetzt noch lernen müsste, was McCoy mit einen Kommentar ab tutabtut, da er weiß, das Kirk niemals lernt.

Am nächsten Tag sitzt er zusammen mit der Übungscrew im Simulator und gibt (genervt) die Ankunft mehrer klingonischer Warbirds weiter. Als Krik Kirk erwidert, dass dies kein Problem darstellt, tauchen noch mehr Warbirds auf. Da Kirk in diesem Moment aber noch keine Befehle, weder zur Flucht, noch zum Angriff, gibt, fragt McCoy fassungslos , warum er so ruhig bleiben kann. Dann fällt plötzlich fällt der Strom aus. Danach sind die Warbirds ohne Schutzschilde und somit wehrlos.

Nach der Anhörung, die damit endet, dass sämtliche Kadetten und Offiziere zu den Schuttlerampen Shuttlerampen gerufen werden; , erfährt McCoy, dass er auf die Enterprise versetzt wurde. Auf den Weg zum Shuttle trifft er auf Kirk, der wegen der Manipulation und des noch nicht geklärten Falles zu Stubenarrest verdonnert wurde.<br/>Um ihn auf ein Schiff zu bekommen, verabreicht ihn McCoy einen Impfstoff, damit Kirk die Symptome der Krankheit aufweißt aufweist und als medizinischer Notfall zählt. Diese List funktioniert, wobei McCoy Kirk , auf der Enterprise angekommen , mit einen Beruhigungsmittel außer Gefecht setzt.

Während der schiffsweiten Übertragung mit den Parametern der Mission schreckt Kirk auf und wird von den Nebenwirkungen des Impfstoffes gequält. McCoy versucht ihn zu behandeln, da Kirk aber gleichzeitig versuch versucht das Schiff zu retten (da dieses in eine Falle fliegt), gestaltet sich dies sehr schwierig.

Wenig später greift Nero die Enterprise doch an, wodurch der eigentliche medizinische Oberoffizier des Schiffes getötet wird und McCoy diese Position erhält. Durch das allgemeine Chaos erfährt er erst spät von davon, das dass Kirk vom Schiff geworfen und auf den dem Planeten [[Delta Vega (Neue Zeitlinie)|Delta Vega]] ausgesetzt wurde. Allgemein ist er mit Spocks Einstellung unzufrieden und irritiert, da Spock seinen Planeten und seine Mutter verloren hat, aber kaum Emotionen zeigt. Er macht sich für seinen Freund stark, stößt aber auf taube Ohren, was ihn noch mehr irritiert und aufwühlt.

Nachdem man Kirk, der auf ungeklärte Weise im Maschinenraum aufgetaucht war, zusammen mit einem weiteren Offizier auf die Brücke bringt, beobachtet McCoy mit der restlichen Brückencrew, wie Kirk Spock so lange provoziert, bis dieser ausrastet und nach einer epischen Schlägerei sein Amt niederlegt. Fassungslos blickt McCoy auf seinen Freund und fährt ihn an, dass er, was auch immer er machen wollte, es geschafft hat. Die Enterprise hat nun weder einen Captain, noch einen Ersten Offizier um ihn zu ersetzen. Doch Kirk setzt sich, demoliert aber lächelnd, in den Captain's Stuhl, worauf Sulu die perplexen Leute darüber aufklärt, dass Pike ihn kurz vor dem Start des Shuttles zum Ersten Offizier gemacht hat. McCoy ist anfangs sprachlos, fängt sich aber schnell wieder.<br/>Kurz darauf werden er und Kirk von Ensign [[Pavel_Andreievich_Chekov_(Neue_Zeitlinie)|Chekov]] auf eine Möglichkeit angesprochen, wie sie unentdeckt von Nero zur Erde gelangen könnten. Er blickt auf den sehr jungen Ensign und fragt nach dessen Alter. Nachdem er es erfahren hat, fragt er Kirk, ob es eine so gute Idee ist , auf einen 17-jährigen zu hören. Er wird vom wiedergekommenen Spock unterbrochen, der Chekovs Berechnungen stützt.