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[[Datei:Kathryn Janeway 2403.jpg|thumb|Admiral Janeway in einer alternativen Zeitlinie.]]
In einer [[alternative Zeitlinie|alternativen Zeitlinie]] kehrt die ''Voyager'' erst im Jahre [[2393]] auf die [[Erde]] zurück. Janeway wird zum [[Vizeadmiral]] befördert. Sie hält Vorlesungen zusammen mit [[Reginald Barclay]] an der [[Sternenflottenakademie]]. Außerdem ist sie von [[Kaffee]] auf [[Tee]] umgestiegen. ({{VOY|Endspiel, Teil I}}){{clear}}
=== Jahr der Hölle ===
In einer alternativen Zeitlinie weiht Captain Janeway das Astrometrische Labor ein, welches eine genauerere Kursbestimmung ermöglicht und so ihre Reise um etwa zwei Jahre verkürzt. Kurz darauf wird sie auf die Brücke gerufen und entgeht so dankend der Rede des Doktors. Die ''Voyager'' wird von einem kleinen Raumschiff der Krenim angegriffen, welches jedoch keine Gefahr darstellt. Janeway ignoriert daher die Drohung und nimmt Kontakt mit den Zahl auf. Wenig später werden die Zahl jedoch durch einen temporalen Eingriff von [[Annorax]] vernichtet. Nun wird die ''Voyager'' von einem Kriegsschiff der Krenim angegriffen. Ein Kapitulationsangebot lehnt Janeway ab. In den darauffolgenden Gefechten wird die ''Voyager'' schwer beschädigt. Nachdem bei einem weiteren Angriff die Waffen ausfallen, lässt sie Tuvok die Torpedos hinausdriften lassen um sie als Minen zu verwenden. Chakotays Vorschlag das Schiff zu verlassen und mit Shuttles und Rettungskapseln das Territorium der Krenim zu passieren, lehnt sie zunächst ab, befolgt ihn aber später dennoch. Nachdem man einen temporalen Schild entwickeln kann, nimmt sie Kontakt mit den Krenim auf, und fordert sie zum Rückzug auf. Bei einem weiteren Eingriff von Annorax bemerkt sie, dass sich die Geschichte verändert hat. Sie stellt sich die Frage, wer es ausgelöst hat. Kurz darauf wird die ''Voyager'' von Annorax' Schiff angegriffen. Janeway befiehlt einen Fluchtkurs. Dadurch wird das Schiff jedoch so schwer beschädigt, dass Janeway die Evakuierung befiehlt.({{VOY|Ein Jahr Hölle, Teil I}})
===Kriegsschiff ''Voyager''===