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Bei der Begegnung des Schiffes mit einem Nebel der Klasse J, meint Kim, dass die Form des Nebels einer Fledermaus ähnelt. Nachdem die Hauptenergie auf dem ganzen Schiff abgeschalten wurde, meldet er dies dem Captain. ({{VOY|Der Spuk auf Deck Zwölf}})
Nachdem man einem Notruf zu einer Kolonie auf einem Asteroiden folgt, findet man diese nur noch zerstört vor. Kim entdeckt Waffensignaturen und identifiziert sie als Borg. Nachdem Seven of Nine in ihrem Regenerationszyklus von einer Widerstandszelle innerhalb des Borg-Kollektivs erfährt, die sich Unimatrix Zero nennt, besprechen die Führungsoffiziere die neue Situation. Kim fragt Seven dabei, woher sie weiß, dass der ganze Vorfall nicht nur ein Traum war. Der Doktor antwortet darauf, dass seine neuralen Scans Sevens Geschichte bestätigt haben. Wenig später nimmt die Borg-Königin Kontakt mit der ''Voyager'' auf, als Kim das Kommando auf der Brücke hat. Er ruft daraufhin den Captain hoch. Die Königin bietet Transwarptechnologie gegen die Nichteinmischung in [[Unimatrix Zero]], was Janeway jedoch ablehnt. Man unterstützt die Rebellen daher und plant einen Virus freizusetzen, welcher es den Drohnen erlaubt, ihre Erinnerungen zu behalten und auch in der realen Welt Widerstand zu leisten. Beim Angriff auf einen taktischen Kubus bedient Kim die taktische Station. Er meldet während des Kampfes die Schäden. ({{VOY|Unimatrix Zero, Teil I}})
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Wenig später, stellt man auf der Brücke fest, dass das [[Virus]] noch nicht freigesetzt wurde. Kim meldet, dass der Kubus seinen Kurs ändert, was Paris kompensiert. Nachdem das Virus freigesetzt wurde, geht die ''Voyager'' auf Abfangkurs, um das Außenteam zurückzubeamen. Kim meldet dabei, dass sie noch näher herangehen müssen, um das Außenteam beamen zu können. Als das Schiff den Kubus erreicht, meldet Kim, dass jemand ihre Schilde deaktiviert hat. Anschließend meldet er die Schäden. Mit Chakotay repariert er die Schiffssysteme, stellt jedoch wenig später fest, dass jemand ihre holografischen Systeme mit einem Borg-Signal anzapft. Durch diese Nachricht erfahren sie, dass Janeway einen Weg gefunden hat, die Drohnen aus Unimatrix Zero in der realen Welt zu befreien. Nachdem dies geschehen ist, greift die ''Voyager'' mit einer abtrünnigen [[Borg-Sphäre]] den taktischen Kubus an, auf dem das Außenteam gefangen gehalten wird und Kim beamt es an Bord. ({{VOY|Unimatrix Zero, Teil II}})
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