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Nachdem Crewman [[Frank Darwin]], durch [[Lon Suder]] [[Mord|ermordet]] wird, bespricht sie mit Tuvok dessen Ermittlungsergebnisse. Tuvoks Vorschlag Suder hinzurichten, lehnt sie ab und lässt ihn stattdessen für den Rest der Reise in seinem Quartier arretieren. Tuvoks geistiger Zustand verschlechtert sich infolge einer Geistesverschmelzung mit Suder zusehends. Nachdem sich Tuvok in seinem Quartier einschließt, dieses verwüstet und eine Mitteilung an Janeway schickt, dass er nicht mehr dienstfähig wäre, begibt sich diese mit einem Sicherheitsoffizier zu seinem Quartier. Der Captain spricht allein mit Tuvok und bringt ihn auf die Krankenstation. Nachdem er ausbricht und eine [[Gedankenverschmelzung]] mit Lon Suder durchführt, wird er verletzt. Suder ruft daraufhin Hilfe. Anschließend redet Janeway mit Tuvok auf der Krankenstation und verbietet ihm in Zukunft Gedankenverschmelzungen, ohne ihre Zustimmung. ({{VOY|Gewalt}})
Nachdem das Schiff auf eine cardassianische Raumsonde trifft, die eine unbekannte Sonde vernichtete, erkundigt sie sich bei Chakotay und B'Elanna, ob Seska etwas damit zu tun haben könnte. Jedoch verneint dies Torres und erklärt, dass sie beim Maquis die Sonde gestartet hat. Sie lässt die Sonde verfolgen und informiert den Premierminister von Rakosa V über die Situation. Nachdem Torres scheinbar die Sonde gestoppt hat, will Janeway diese untersuchen. Jedoch stellt sich heraus, dass Dreadnought Torres getäuscht hat. Der Versuch die Sonde mit Torpedos zu zerstören, scheitert. Da Dreadnought sich nicht überzeugen lässt, im Delta-Quadranten zu sein und die ''Voyager'' bei einem Angriff erheblich beschädigt wird, stimmt sie B'Elannas Plan zu, erneut auf die Sonde zu beamen. Als die rakosanische Flotte angreift, schließt sich die ''Voyager'' dem Angriff an. Da dieser Angriff ergebnislos verläuft, entschließt sich Janeway die ''Voyager ''zu evakuieren und Dreadnought zu rammen und so zu vernichten. Sie lässt die gesamte Besatzung evakuieren. Nur Tuvok verbleibt bei ihr auf der Brücke. B'Elanna gelingt es rechtzeitig Dreadnought zu zerstören, sodass Janeway die Selbstzerstörung abbrechen kann. Anschließend holen sie und Tuvok die Besatzung zurück auf das Schiff. ({{VOY|Der Flugkörper}})
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