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Khan Noonien Singh war ein menschlicher Augment, ein Produkt der letzten genetischen Experimente des 20. Jahrhunderts und ein ein tyrannischer Herrscher während der Eugenischen Kriege. Nach seiner Entmachtung floh er mit einigen Gefährten auf das Schläferschiff SS Botany Bay und verschwand in den Weiten des Weltraums.

Im 23. Jahrhundert wurde das Schiff durch die USS Enterprise wiederentdeckt und die Besatzung geweckt. Captain James T. Kirk gelang es, Khan und seine Crew daran hindern, die Enterprise in ihre Gewalt zu bringen und schließlich wurden die Augments auch Ceti Alpha V ausgesetzt.

2285 gelang es Khan dann mit Hilfe der Gekaperten USS Reliant vom inzwischen verödeten Planeten zu fliehen. Sein Plan war es, grausame Rache an Kirk zu nehmen. Nach langem Kampf gelang es Kirk schließlich, seinen Widersacher zur Strecke zu bringen.