Gehirn
Das Gehirn ist ein Organ eines Lebewesen. Es ist der verarbeitende Teil des Nervensystems. In ihm werden Sinneseindrücke ausgewertet und das Verhalten koordiniert. Gewöhnlich befindet es sich im Kopf der Spezies.
Vulkanier können mittels einer Gedankenverschmelzung eine Verbindung zum Gehirn einer anderen Person aufbauen, wodurch Gedanken und Erinnerungen übertragen werden. Telepathen können ebenfalls Informationen aus Gehirnen anderer Personen gewinnen.
Die Gehirne der Borg, Kohl und der Bynare sind untereinander verbunden.
Die Kobali besitzen ein sechs-lappiges Gehirn (VOY: Asche zu Asche).
Geordi La Forges Visor ist durch Implantate direkt mit seinem Gehirn verbunden (TNG: Angriff der Borg, Teil II).
Hirnstamm
Der Hirnstamm ist der untere Teil des Gehirns bei Humanoiden lebensformen.
2369 entdeckt Dr. Bashir bei der Autopsie des Klingonen Hon'Tihl, dass sein Hirnstamm durch die telepatische Matrix aus dem Archiev der Saltah'na verändert wurde. Der Hirnstamm von befallenen Patienten weist säulenartige Zellen auf. Die Veränderung wirkt sich auch auf die Besatzung von Deep Space 9 aus und so führen nun Commander Sisko und Major Nerys den Machtkampf, der zur Vernichtung der Spezies der Saltah'na geführt hat aus.
Dem Doktor, der auch befallen ist, selbst aber keine Veränderung merkt, gelingt es, ein Gegenmittel zu entwickeln. Er entwickelt ein ionisches Interferenzsignal, dass so kalibriert ist, dass es sich auf die Resonanzfrequenzen des telepathischen Feldes setzt und es bei den befallenen vertreibt. Odo wendet das die Datei, die dieses Signal erzeugt, im Frachtraum 4 an und nachdem die Matrix aus den Betroffenen Crewmitgliedern entfernt ist, öffnet der Constable das Tor, woraufhin die Matrix in den Weltraum gesaugt wird und sich auflöst. (DS9: Meuterei)