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Die [[Liste der Crew der USS Enterprise (NCC-1701)|Mannschaft]] der ''Enterprise'' freut sich auf ihren wohlverdienten [[Landurlaub|Urlaub]], als sie plötzlich vom [[Hauptquartier der Sternenflotte|Sternenflottenhauptquartier]] beauftragt wird, nach dem Raumschiff [[USS Intrepid|''Intrepid'']] zu suchen, zu welchem der Kontakt vollständig abgebrochen ist. [[Spock]] spürt auf einmal telepathisch, dass dieses Schiff, dass ausschließlich mit [[Vulkanier]]n besetzt ist, zerstört worden ist. Da dies nach außen hin wie eine Schmerzattacke wirkt, ordnet Cpt. Kirk an, Spock solle sich bei Dr. McCoy auf der Krankensation melden und sich untersuchen lassen. Spock versichert, dass alles mit ihm in Ordnung sei; doch Kirk besteht darauf, dass Spock das Lazarett aufsucht.

Während sie dem Kurs der ''Intrepid'' folgt, stößt die ''Enterprise'' auf ein schwarzes, lochähnliches Gebilde im [[Weltraum]] und fliegt hineinDr. McCoy ist bereits informiert. Schon bald machen Eher widerwillig legt Spock sich erste Schwächeanfälle in der Besatzung bemerkbar und auch das Schiff verliert zusehends Energieauf die Untersuchungsliege. Es wird bald klarDie Untersuchung bestätigt, dass sich Spocks Gesundheit in dieser Dunkelzone etwas befinden musskeiner Weise beeinträchtigt ist. Stattdessen entbrennt zwischen dem Schiffsarzt und dem Ersten Offizier eine Diskussion über Telepathie, das sowohl biologische als auch mechanische Energie absorbiertin welcher Dr. Wenig später ist dieses Etwas McCoy zu sehen: Es handelt sich um eine gigantische [[Amöbe]]verstehen gibt, dass er an einem solchen Weg der Nachrichtenübermittlung Zweifel hegt. Doch Spock weiß genau, die kurz vorher bereits die ''Intrepid'' vertilgt hatwovon er spricht.

Damit die Die ''Enterprise'' nicht das gleiche Schicksal erleidet wie ihr Schwesterschiff, fliegt Spock mit einem folgt dem Kurs der ''ShuttleIntrepid'' in das Innere der Amöbe. Obschon bislang nichts zu entdecken ist, um Daten zu sammelnentsteht eine gewisse Spannung. Dabei begibt er sich selbst in große Gefahr; aber die Mission gelingtDie Besatzung spürt, dass irgendetwas geschehen wird. Dank Spocks Mission stellt sich herausNach einiger Zeit erscheint auf dem Bildschirm ein schwarzes, dass das Wesen mit lochähnliches Gebilde im [[AntimaterieWeltraum]] vernichtet werden kann. So geschieht Niemand, auch Spock, vermag sich zu erklären, um was es sich dabei handelt. Es lässt sich auch nicht feststellen, woraus dieses besteht. Da es und sich jedoch unmittelbar auf dem Kurs der ''Intrepid'' befindet, behält die ''Enterprise-Crew kann endlich ihren wohlverdienten Urlaub antreten'' den Kurs bei und fliegt hinein. Beim Eintreten in diese Dunkelzone entsteht eine grell pfeifendes Geräusch, das auf eine Grenzschicht hinweist.

{{Unvollständige Episode|TOS}}Kurz nach dem Eintritt in die Dunkelzone meldet Scott, dass das Schiff Energie verliert. Kirk ordnet eine Untersuchung dieses Phänomens an. Wenig später bricht Uhura beinahe zusammen, kann sich aber noch halten. Dr. McCoy meldet, dass sich in der Krankenstation eine beträchtliche Anzahl an Besatzungsmitgliedern eingefunden habe, die unter Schwäche leiden. Der Doktor verabreicht ihnen ein Mittel, das ihnen wieder Kraft gibt. Kirk bittet Dr. McCoy auf die Brücke, um dafür zu sorgen, dass niemand von der Brückenbesatzung ausfällt. Schließlich erfährt er selbst einen Schwächeanfall. Es wird bald klar, dass sich in dieser Dunkelzone etwas befinden muss, das sowohl biologische als auch mechanische Energie absorbiert, und ebenso klar ist es, dass Schiff und Besatzung diesem Energieentzug nicht mehr lange standzuhalten vermögen. Das Schiff wird zudem immer schneller in die Dunkelzone hneingezogen. Als Kirk Scott deswegen später im Maschinenraum aufsucht, zündet dieser aus Versehen die Impulstriebwerke; doch bewegt sich das Schiff nicht nach vorne, was eigentlich die logische Folge gewesen wäre, sondern rückwärts. Dies bringt Spock auf den Gedanken, dass inder Dunkelzone negative Energie herrscht, welche genau gegenteilige Reaktionen hervorruft. Er empfiehlt daher, den Vorwärtsschub zu verstärken. Tatsächlich wird das Schiff dadurch langsamer. Wenig später ist die Quelle des Energieverlustes zu sehen: Es handelt sich um eine gigantische [[Amöbe]], die kurz vorher bereits die ''Intrepid'' vertilgt hat. Damit die ''Enterprise'' nicht das gleiche Schicksal erleidet wie ihr Schwesterschiff - es bleiben nur noch wenige Stunden bis zum vollständigen Energiekollaps -, müssen Mittel und Wege gefunden werden, diese riesige Amöbe unschädlich zu machen. Dr. McCoy schlägt vor, sich mit einem Shuttle zum Zellkern zu begeben, um Untersuchungen anzustellen. Er erklärt sich bereit, diese Mission durchzuführen. Kirk greift diese Idee auf, bestimmt aber Spock für diese Mission, da er, wie er meint, die bessere Qualifikation dafür besitze. Spock startet und ist bald gezwungen, den Energieverbrauch des Shuttles auf ein Minimum zu reduzieren. Er sammelt interessane Daten. Als er die Lösung des Problems an die ''Enterprise'' durchgeben will, bricht kurzzeitig die Sprechverbindung ab, so dass das Schlüsselwort nicht durchkommt. Als Dr. McCoy wie beiläufig das Wort ''Antikörper'' in den Mund nimmt, versteht Kirk plötzlich, was Spock gemeint hat: ''Antimaterie''! Spock wollte also mitteilen, dass die Amöbe mit ''Antimaterie'' vernichtet werden könne. Sogleich lässt er eine Sonde mit einer Antimaterieladung starten. Es gestaltet sich indes schwierig, Spock vorher zurück an Bord zu holen. Kirk befiehlt den Einsatz des Transporters; doch dazu reicht die Energie nicht mehr aus. Die Antimaterieexplosion vernichtet die Amöbe und bringt die ''Enterprise'' in den normalen Weltraum zurück. Da Spocks Shuttle sich nahe genug am Rumpf der ''Enterprise'' befunden hat, wurde es mit hinausbefördert. Es kann wohlbehalten an Bord zurückkehren und die Besatzung kann endlich ihren wohlverdienten Urlaub antreten.