Wenig später dockt die ''Defiant'' zusammen mit der [[USS Farragut (Excelsior-Klasse)|USS ''Farragut'']] an Deep Space 9 an, während sich die [[USS Yeager (NCC-65674)|USS ''Yeager'']] in der Nähe befindet. ({{DS9|Erkenntnis}})
Etwa bei Sternzeit 51408Einige Zeit darauf unternimmt die ''Defiant'' erfolgreich die erste Mission im cardassianischen Raum seit dem Ausbruch des Krieges. Darauf können O'Brien,6 bricht Dax und Bashir von ihrer erfolgreichen Mission im Quark's berichten. ({{DS9|Der glorreiche Ferengi}}) Kurz darauf wird die [[USS Honshu|USS ''Honshu'']], auf der sich zu dieser Zeit Captain Sisko und der gefangene Dukat befinden, von Cardassianern angegriffen und zerstört. Die ''Defiant'' gemeinsam bekommt den Auftrag zusammen mit der ''[[USS Constellation (NXNCC-197455817)|USS ''Constellation'']]nach Überlebenden der ''Honshu''zu suchen. Die ' auf, um 'Defiant'' bekommt den Auftrag nach Überlebenden der durch eine Gruppe von Jem'Hadar-Angriffsjägern zerstörte [[USS 'Honshu|USS ''Honshuzu suchen. Worf erhält zwei Tage Zeit, um mit der ''Defiant'']] nach Überlebenden und Captain Sisko zu suchen, die ehe er umkehren muss, um einen [[Gul]] [[DukatKonvoi]] zu eskortierten. Wenig später empfängt O'Brien ein Notsignal von Deep Space 9 zur [[Sternenbasis 621]] bringen sollteSiskos Notbake. Nach einiger Zeit findet Jedoch kann Dax es nicht lokalisieren und Kira muss die Crew ''Defiant'' schließlich auch Benjamin Siskoabziehen. Als die Zeit um ist, will Worf sich zu dem Konvoi begeben, obwohl Bashir dagegen protestiert. Darauf verweist Worf Bashir von der den Transport begleiteteBrücke. In diesem Moment empfängt O'Brien ein Signal von Gul Dukat und die ''Defiant'' holt Sisko daraufhin ab. Dukat kann allerdings entkommen. Die ''Defiant'' begibt sich darauf zu dem Konvoi in die Badlands. ({{DS9|Das Gute und das Böse}})
Der erste wissenschaftliche Auftrag seit langem führt die ''Defiant'' gemeinsam mit der [[USS Rubicon|''Rubicon'']] zu einer Raumanomalie, in welcher der [[Subraum]] komprimiert ist. Hintergrund dieser Mission ist es, es der Föderation zu ermöglichen, [[Transwarpkanal|Transwarpkanäle]] zu schaffen, was gegenüber dem Dominion einen taktischen Vorteil bedeuten würde. Allerdings wird die ''Defiant'' von einem Jem'Hadar-Angriffsjäger überrascht und geentert, da die Sensoren in der Nähe der Anomalie stark eingeschränkt sind. ({{DS9|Das winzige Raumschiff}})
