Als Janeway, Tuvok und Torres in die Gewalt des [[Mokra-Orden]]s geraten, hilft Paris bei der Organisation einer Rettungsmission. Später können die drei Offiziere gerettet werden und sie kehren auf die ''Voyager'' zurück. ({{VOY|Die Resistance}})

Nachdem Torres von der [[Automatische Einheit 3947]] entführt worden ist, greift die ''Voyager'' das Schiff der [[Pralor]] an, um Torres zu retten. Doch die [[Automatische Personaleinheit|automatischen Personaleinheiten]] sind der ''Voyager'' überlegen und beschädigen diese schwer. Paris erklärt sich sofort bereit mit einem Shuttle zu dem Schiff zu fliegen, um Torres zu retten. Doch Chakotay hält Paris' Vorschlag für zu riskant, da er nicht möchte, dass das Shuttle bei dieser Mission beschädigt wird. Paris findet es rührend wie sich Chakotay anstatt um sein Wohl um das Wohl des Shuttles kümmert. Später greift ein Schiff der verfeindeten [[Cravic]] das Schiff der Pralor an. Da die automatischen Personaleinheiten abgelenkt sind, fliegt Paris nun mit einem Shuttle in die Nähe der beiden Schiffe und kann Torres an Bord des Shuttles beamen. Als sich beide Offiziere wieder an Bord der ''Voyager'' befinden, entfernt sich diese von den beiden Schiffen, welche noch immer in schwere Kämpfe verwickelt sind. ({{VOY|Prototyp}})

Während einer Außenmission wird eine spezielle [[Dilithium]]variante gefunden, mit der Antriebe höhere Geschwindigkeiten erreichen können. Paris, Kim und Torres versuchen mit einem verbesserten Antrieb eine höhere Geschwindigkeit zu erzielen und sogar [[die Schwelle]] von [[Warpfaktor]] 10 zu erreichen. Allerdings verlaufen die Simulationen schlecht, da beim Eintreten von Warp 10 immer die [[Warpgondel]]n abreißen. Schließlich finden die Offiziere einen Weg, wie diese Warp 10 erreichen können und Paris meldet sich für die Mission als Testpilot. Doch der Doktor empfiehlt Kim als Piloten für diese Mission, da er bei Paris festgestellt hat, dass der Flug [[Gehirnblutung]]en auslösen könnte. Doch da das Risiko sehr gering ist, bittet Paris Janeway diesen Flug durchführen zu dürfen und Janeway erlaubt dies. Mit dem Shuttle [[Cochrane (Shuttle)|''Cochrane'']] durchbricht Paris die Schwelle und ist für einen Augenblick an allen Punkten des Universums gleichzeitig. Dabei verliert Paris das Bewusstsein und als das Shuttle zur ''Voyager'' zurückkehrt, wird er auf die Krankenstation gebeamt. Der Doktor untersucht ihn, doch er kann nichts bei ihm vorfinden. Wenig später beginnt Paris zu mutieren. Dies verdeutlicht sich als er allergisch auf [[Wasser]] reagiert. Paris wird sofort zum Doktor gebracht und dieser stellt fest, dass sich seine gesamte Biochemie verändert hat. Auch Strahlenbehandlungen können die [[Mutation]]en nicht stoppen. Der Doktor kann nichts mehr für Paris tun und dieser stirbt wenig später. Doch nach ein paar Stunden erwacht Paris plötzlich wieder zum Leben, allerdings schreiten die Mutationen weiter voran und Paris wächst ein zweites [[Herz]]. Inzwischen übermittelt der Spion heimlich Daten des Warp 10 Sprungs an die Kazon. Durch die Mutationen ändert sich Paris immer mehr und auch sein Charakter ändert sich. Er wirkt nur noch wahnsinnig und verwirrt. Später versucht der Doktor Paris im Maschinenraum mit [[Antiproton]]en zu bestrahlen, doch dabei flieht dieser. Kurz darauf entführt Paris Janeway und flieht auf das Shuttle ''Cochrane'' und durchfliegt ein weiteres Mal die Schwelle. Dadurch mutiert auch Janeway und beide entwickeln sich zu fremdartigen Kreaturen und zeugen dort sogar Nachkommen. Nach drei Tagen werden die beiden von der Crew der ''Voyager'' aufgespürt und dem Doktor gelingt es die ursprüngliche [[DNS]] der beiden wiederherzustellen. Später entschuldigt sich Paris bei Janeway, doch diese erklärt, dass er nichts dafür kann. Janeway will allerdings Paris für seine Taten auszeichnen. ({{VOY|Die Schwelle}})

Wenig später entdeckt Tuvok, dass jemand heimlich mit den Kazon Kontakt aufnimmt. Er berichtet dies Janeway und auch Paris erfährt davon. Die drei Offiziere wahren Stillschweigen, um den Spion aufzudecken, während Paris beginnt sich immer schlimmer aufzuführen, damit es so aussieht als plane er die ''Voyager'' zu verlassen. ({{VOY|Der Verräter}})

[[Datei:Chakotay ermahnt Paris.jpg|thumb|Chakotay ermahnt Paris.]]

Mit der Zeit kommt Paris immer häufiger zu spät zum Dienst und seine Ausreden werden immer ausgefallener. Chakotay beschwert sich bei Janeway über Paris Verhalten, doch Janeway erklärt Chakotay er kann mit Paris handeln wie er es für richtig hält. Später unterhält sich Chakotay mit Paris und erkundigt sich, wie es ihm geht und will wissen, was mit ihm los ist. Chakotay bietet ihm seine Hilfe an, doch Paris lehnt ab und beide geraten in einen heftigen Streit. Auch dem Spion fällt das Verhalten von Paris auf und er berichtet den Kazon davon. Zur selben Zeit verliebt sich der Doktor in die Vidiianerin [[Danara Pel]], doch diese weist ihn ab. Darauf holt sich der Doktor einige Ratschläge von Paris, wie man mit Liebeskummer umgeht. Als Paris die Geschichte vom Doktor hört, bietet dieser ihm seine Hilfe an. Er gestaltet für den Doktor ein Holoprogramm, wo dieser mit Pel sein erstes Rendezvous hat und schließlich verlieben sich beide ineinander. Als Paris zu seiner nächsten Schicht wieder zu spät kommt, [[Suspendierung|suspendiert]] ihn Chakotay kurzerhand. Daraufhin kommt es zu einer Rangelei zwischen beiden auf der Brücke und Chakotay fällt dadurch zu Boden. Darauf lässt Janeway Paris verhaften und Tuvok bringt ihn in den Arrest. ({{VOY|Lebensanzeichen}})