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[[Datei:Doktor wird aktiviert.jpg|thumb|left|Der erste Einsatz des Doktors.]]
Wenige Wochen später verletzt [[B'Elanna Torres]] [[Joseph Joe Carey]] bei einem Streit im [[Maschinenraum]] und der Doktor muss seine gebrochene [[Nase]] behandeln. Zu der Zeit teilt Captain Janeway den [[Steuermann]] [[Tom Paris]] als Sanitäter ein, der den Doktor bei seiner Arbeit unterstützen soll. Wenig später besucht Kes den Doktor, um einige Bodenproben von ihm zu bekommen. Kes stellt dabei fest, dass der Doktor kleiner wird. Der Doktor meldet diesen Vorfall der [[Brücke]]. Doch zu der Zeit befindet sich die ''Voyager'' im [[Ereignishorizont]] einer [[Quantensingularität]] und dadurch werden auch die Holoprojektoren auf der Krankenstation gestört. Durch die Singularität erleiden die Crewmitglieder [[Kopfschmerz]]en und Schwindelgefühle. Obwohl der Doktor immer kleiner wird, behandelt er die Crew. Nachdem die ''Voyager'' die Singularität verlassen hat, kümmern sich die Techniker darum, dass der Doktor wieder seine normale Größe erhält. ({{VOY|Die Parallaxe}})
Einige Zeit später werden Neelix von den [[Vidiianer]]n seine [[Lunge]]n entfernt. Der Doktor behandelt Neelix darauf und kann ihn kurzzeitig am Leben halten. Bei seiner Arbeit ist Tom Paris allerdings für den Doktor keine große Hilfe, da er sehr unzuverlässig ist. Der Doktor erzeugt für Neelix eine holografische Lunge. Damit überlebt Neelix zwar, aber er darf sich nicht mehr bewegen und kann auch die Krankenstation für den Rest seines Lebens nicht mehr verlassen. Mit der Zeit fängt Neelix an den Doktor zu nerven, er wünscht, dass der Doktor die Krankenstation neu dekoriert oder auch solche Kleinigkeiten wie an der Nase gekratzt zu werden. Janeway gelingt es inzwischen die Vidiianer, die das Neelix angetan haben, gefangen zu nehmen. Sie erklären sich bereit Neelix zu helfen. Kes meldet sich freiwillig eine ihrer Lungen für Neelix zu spenden. Mit der Hilfe der Vidiianer kann der Doktor die Lunge in Neelix transplantieren. Zu der Zeit bemerkt der Doktor das medizinische Talent von Kes und er bittet Captain Janeway Kes als seine neue Assistentin ausbilden zu dürfen, damit sie Tom Paris ersetzen kann. ({{VOY|Transplantationen}})