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Irgendwann zwischen den späten [[2250er]] und den frühen [[2260er]] hat sie eine kurze [[Beziehung ]] mit [[James T. Kirk]], einem jungen [[Offizier]] der [[Sternenflotte]]. Daraus geht [[2261]] ein Sohn namens [[David Marcus|David]] hervor. Da Kirk sich jedoch meistens irgendwo in der [[Milchstraße|Galaxie]] „herumtreibt“, sieht sie keine gemeinsame Basis für eine längerfristige Beziehung. So zieht sie ihren Sohn alleine groß, während sie ihrer regelmäßigen Arbeit als [[WissenschaftWissenschaftler]]lerin in nachgeht.

Im Laufe der [[Zeit]] feiert sie einige große Erfolge und übernimmt anschließend im Jahr [[2284]] die Führung des streng geheimen [[Genesisprojekt]]es. Dieses Projekt wird vom [[Labor|Raumlabor ]] [[Regula 1]] aus geleitet und soll in drei Etappen vonstatten gehen. An Bord dieser kleinen [[Raumstation]] versammelt sie eine Gruppe von jungen, aufstrebenden [[Forschung|Forschern]], zu denen auch ihr, mittlerweile erwachsener, Sohn Doktor David Marcus gehört.

Innerhalb kurzer Zeit schafft sie und ihr Team bemerkenswerte Fortschritte, wodurch sie bereits [[2285|ein Jahr später]] für die letzte der drei Stufen bereit sind. Bevor sie jedoch einen geeigneten [[Planet]]en finden können, auf dem das geheime Projekt getestet werden soll, wird die Raumstation von [[Khan Noonien Singh]] und seinen Anhängern überfallen[[überfall]]en. Lediglich sie, ihr Sohn und ein bis zwei weitere Forscher können dem Überfall entgehen, indem sie sich auf den naheliegenden [[Planetoid]]en [[Regula]] hinunter [[Beamen|beamen]].

Ironischerweise ist es ausgerechnet [[Admiral]] James T. Kirk, der ihr mit seiner [[USS Enterprise (NCC-1701)|USS ''Enterprise'']] zu Hilfe eilt. Als er sie schließlich innerhalb einer [[Höhle ]] auf dem Planetoiden findet, trifft er auch das erste Mal auf seinen Sohn, der ihn mit einem Messer in der Hand empfängt. Schuld daran ist sein Irrglaube, dass Kirk die [[Schuld ]] an der augenblicklichen Situation tragen würde. Jedoch kann die herbeigeeilte Carol Marcus die Situation entschärfen. Nachdem es Khan jedoch gelingt, das [[Genesis-Projektil]] in seinen Besitz zu bringen, begleitet Carol Marcus Admiral Kirk auf sein Schiff, das sich auf den entscheidenen entscheidenden Kampf gegen die von Khan [[Kaperung|gekaperte ]] [[USS Reliant|USS ''Reliant'']] vorbereitet.

* Kirks Freund [[Gary Mitchell]], hat Kirk während seiner Zeit auf der [[Sternenflotten-AkademieSternenflottenakademie]] mit einer blonden Labortechnikerin bekannt gemacht. Kirk gibt zu, dass er diese Frau fast geheiratet hätte. Es wird oft Spekuliert, dass es sich hierbei um Carol Marcus handelte, offiziell wurde dies allerdings nie bestätigt.*Im Spiel ''[[Star Trek: 25th Anniversary (PC)| 25th Anniversary]]'' arbeitet Carol Marcus in der Mission ''Love's Labor Jeopardized '' in der geheimen Biologischen Forschungsstation ARK7 nahe der [[Romulaner|romulanischen ]] Grenze und begegnet Kirk bei einem Zwischenfall mit den Romulaner.