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Die [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] traf [[2375]] im [[Delta-Quadrant]]en erneut auf die Königin. Sie versuchte, [[Seven of Nine]] zurück in das Kollektiv zu integrieren, es gelang Seven jedoch mit Hilfe der Crew der ''Voyager'' zu fliehen. ''([[VOY]]: "[[Das ungewisse Dunkel, Teil I]]" und "[[Das ungewisse Dunkel, Teil II|Teil II]]")''
Das jüngste Zusammentreffen der Borg-Königin mit der ''Voyager'' fand [[2378]] statt, als das [[Raumschiff]] einen ein [[Transwarpzentrum]] der Borg entdeckte. Die Crew plante, einen der [[Transwarpkanal|Transwarpkanäle]] zu verwenden, um zur [[Erde]] zurückzukehren. Sie erhielten Hilfe von [[Admiral]] [[Kathryn Janeway|Janeway]] aus einer [[Alternative Zeitlinie|alternativen Zeitlinie]]. Der Admiral lies sich von den Borg gefangen nehmen und wurde von der Königin persönlich assimiliert, doch hatte sie sich mit einem Krankheitserreger infiziert, der sich nun im Kollektiv ausbreitete. Die Königin verlor allmählich die Kontrolle.
In der Hoffnung, das Töten der nun heimkehrenden Janeway würde die stattfindenden Ereignisse rückgängig machen, ließ die Königin die ''Voyager'' von einer Sphäre abfangen. Die Sphäre, die durch den Krankheitserreger bereits geschwächt war, hatte das [[Raumschiff|Schiff]] zwar bereits "verschlungen", doch gelang es der Crew, das Borgschiff von Innen heraus zu zerstören.
