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Bei einem Angriff der Kazon erleidet die ''Voyager'' so schwere Schäden, dass Torres den Warpantrieb abschalten muss, um einen Kernbruch zu vermeiden. Sie meldet Janeway, dass auch der Impulsantrieb ausgefallen ist, und sie viele Verletzte im Maschinenraum hat. Darunter befindet sich auch [[Kurt Bendera]], ein Freund Chakotays, den sie auf die Krankenstation begleitet. Jedoch sind die Heilungsversuche des Doktors vergeblich. Sie ist auch bei der Trauerfeier für Kurt Bendera anwesend. Nach den Verhandlungen mit Seska und Maje Culluh, spricht sie mit Hogan. Er denkt, dass Janeways Haltung ein Fehler ist. Torres weist ihn energisch in die Schranken und teilt ihm mit, dass es seine einzige Aufgabe ist die Dilithiumkammer gefüllt zu halten. ({{VOY|Allianzen}})
Einige Zeit später, arbeitet sie zusammen mit Harry Kim an der Entwicklung eines Warp-10-Antriebs. Tom Paris fungiert dabei als Testpilot. Jedoch scheitern zunächst ihre Bemühungen. Neelix bringt sie auf die entscheidende Idee, sodass sie die nächste Simulation erfolgreich durchführen und ihre Ergebnisse dem Captain präsentieren können. Nach dem Testflug von Paris, begibt sie sich auf die Krankenstation und beglückwünscht Paris. Anschließend analysiert sie mit Kim und Janeway die Flugdaten. Nach der Arbeit bespricht sie mit Paris die Daten im Kasino. Als dieser eine allergische Reaktion zeigt, will Torres ihn auf die Krankenstation beamen lassen, was jedoch nicht möglich ist. Sie begleitet ihn auf die Krankenstation. Als der Doktor feststellt, das Tom Paris mutiert, besorgt ihm Torres, alle Sensordaten aus dem Shuttle. Der Doktor entwickelt einen Plan, Paris zu retten. Dafür schaltet Torres den Warpkern ab, um Paris einer Antiprotonenstrahlung aussetzen zu können. Bei der Behandlung befreit sich Paris jedoch und entkommt. ({{VOY|Die Schwelle}})
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