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Das Memory Alpha Projekt hatte seinen Ursprung im September 2003, als [[:en:User:Harry Doddemma|Harry Doddema]] vorschlug, die erfolgreiche Struktur der [http://www.wikipedia.org Wikipedia] für eine offene ''Star Trek'' Datenbank zu verwenden. Zuvor waren die meisten ''Star Trek'' Datenbanken von einzelnen Leuten oder kleinen Gruppen erstellt worden, waren zu groß, zu unübersichtlich, zu veraltet oder nicht frei zugänglich (wie die Datenbank der offiziellen ''Star Trek'' Seite).
Zur selben Zeit hatte [[:en:User:MinutiaeMan|Dan Carlson]] das Problem von der anderen Seite angepackt. Dan hatte langsam über die letzten zehn Jahre eine eigene Datenbank aufgebaut, die ''Starfleet Reference Databank''. Allerdings war sie weit entfernt von der Vollständigkeit wegen anderer Einschränkungen. Dan stand vor der Erkenntnis, dass die Aufstellung einer Referenzquelle mehr Arbeit erforderte als eine Person aufwenden könnte.
Bereits am 12. Januar 2004 erreichte Memory Alpha einen Meilenstein, als der 1.000ste Artikel erstellt wurde, weniger als zwei Monate nach Start des Projektes.
Allerdings erlitt das Projekt einen Rückschlag am 23 . März 2004, als bei einem Softwareupgrade die gesamte Datenbank ''gelöscht'' wurde. Zum Glück existierte ein Backup der Datenbank, allerdings war jenes sechs Wochen alt. Das Problem hinderte die [[:en:Memory Alpha:Archivists|Archivisten]] allerdings nicht daran an der Datenbank weiter zu arbeiten, um Memory Alpha besser als zuvor zu machen!
Memory Alpha erhielt einen eigenen Domainnamen und Serveraccount dann im April 2004, zuvor war Memory Alpha über eine Subdomain von Dans [http://www.st-minutiae.com Star Trek Minutiae] zu erreichen. Der neue Account wurde von [http://www.myoo.de Erik Möller], einem der Hauptgründer von MediaWiki, bereitgestellt. Dies gab Memory Alpha die Möglichkeit größer als zuvor zu wachsen, und beseitigte auch die Probleme des alten Serversystems.
