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Der Warpkern besteht aus mehreren Teilen: die eigentliche Reaktorkammer, in der die [[Materie-Antimaterie Reaktion]] stattfindet, den Zuleitungen und den Primären [[EPS]]-Leitungen. Die Reaktorkammer befindet sich auf dem meisten Schiffen im [[Maschinenraum]]. Die Lagertanks für das Deuterium befinden sich mehrere Decks darüber. Das Antideuterium befindet sich in stark abgeschirmten und gut gesicherten Tanks auf dem untersten Deck, sodass sie im Notfall abgeworfen werden können. Zugeführt werden die Stoffe der Reaktorkammer über lange Röhren, die mit magnetischen Querschnittsverengersegmenten versehen sind. An den Enden befinden sich der [[Materie-Injektor|Materie]]- bzw der [[Antimaterie-Injektor]] mit denen die zugeleitete Menge dosiert wird. Diese fokussieren mit Hilfe von Magnetfeldern das Deuterium und das Antideuterium auf den [[Dilithium]]kristall und verhindern, dass die Antimaterie mit der Leitung in Berührung kommt. Im Dilithiumkristall findet dann eine kontrollierte Reaktion statt und hochenergetisches [[Plasma]] entsteht, sogenanntes Elektro-Plasma. Durch die Form des Kristall wird das Plasma in zwei Ströme aufgeteilt, die über die Primären EPS-Leitungen direkt zu den [[Warpgondel]]n geleitet werden. Ein Teil des Plasmas wird über Verteiler in das [[Elektroplasma-Verteilernetzwerk|EPS-Netzwerk]] eingespeist, welches sich durch das ganze Schiff erstreckt. Dadurch werden alle Systeme mit Energie versorgt.
Obwohl das System theoretisch funktioniert, ist es zumindestens im Moment nicht möglich, damit solche Energiemassen zu erzeugen, da das Herrstellen von Antimaterie exakt genausoviel Energie verbraucht, wie bei deren Zusammenführung mit Materie.
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