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Der [[Transphasentorpedo]] ist eine [[Waffe]] aus dem [[alternative Zeitlinie|alternativen 25. Jahrhundert]], in der die [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] nach vielen Jahren und unter herben hohen Verlusten nach Hause zurückgekehrt ist. Die mittlerweile zum [[Admiral]] [[Beförderung|beförderte]] [[Kathryn Janeway]] reist mit [[Shuttle SC-4|ihrem Shuttle]] in die Vergangenheit, um den Heimweg der ''Voyager'' stark zu verkürzen und so [[Liste der Crew der USS Voyager|der Mannschaft]] das Leid zu ersparen, das sie miterlebt hat.

So wird als erstes [[Sternenflotte]]nschiff die ''Voyager'' neben einem [[Ablativgenerator]] mit Transphasentorpedos ausgestattet, um den [[Borg]] entgegenzutreten, die ihr [[Transwarpzentrum]] verteidigen und durch einen [[Transwarpkanal]] in den [[Alpha-Quadrant|Alpha-Quadranten]] zu fliehen. Die Borg sind auf den Einsatz dieser Waffe aus der Zukunft nicht vorbereitet und erleiden herbe starke Verluste. Der ''Voyager'' gelingt es unter anderem die Verbindungsknoten eines Transwarpkanals zu zerstören, wodurch dieser zusammenbricht und den Weg hinter ihnen versperrt. ({{VOY|Endspiel, Teil II}})