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Einige Wochen später, als die ''Voyager'' durch das Gebiet der [[Vidiianer]] fliegt, durchfliegt [[Tom Paris]] eine Plasmawolke, damit die Viddianer sie nicht orten können. Dabei fliegt die ''Voyager'' durch ein [[Subraumdivergenzfeld]] und das Schiff wird mit seiner ganzen [[Materie]] verdoppelt. Allerdings wird die [[Antimaterie]] nicht verdoppelt und der Antrieb fällt aus. Um den entstehenden Energieausfall zu stoppen, empfiehlt Torres den Antrieb mit [[Proton (Partikel)|Proton]]enausstößen zu aktivieren, als plötzlich die ''Voyager'' von Protonenausstößen getroffen und schwer beschädigt wird. Diese Beschädigungen stammen von Protonenausstößen der anderen ''Voyager'' und dadurch wird die eine ''Voyager'' schwer beschädigt. Als man erkennt, dass beide Schiffe verdoppelt wurden, versucht man beide wieder zu vereinigen, doch der Versuch scheitert. Die Janeway der beschädigten ''Voyager'' schlägt vor, die Selbstzerstörung zu aktivieren, um so die andere ''Voyager'' zu retten. Doch dies will die andere Janeway nicht zu lassen. Plötzlich greifen die tauchen die Vidiianer auf und greifen die ''Voyager'' an. Allerdings befinden sich diese nur auf der intakten ''Voyager''. Da ein Großteil der Crew tot ist, aktiviert Janeway die Selbstzerstörung um so die Vidiianer zu vernichten und die andere ''Voyager'' zu retten. Durch die Selbstzerstörung werden die Vidiianer vernichtet und die andere ''Voyager'' wird gerettet. ({{VOY|Die Verdoppelung}})
Ende des Jahres versucht die Crew der ''Voyager'' den angeblichen Sohn von [[Chakotay]] aus der Gewalt der [[Kazon]] zu retten. Bei dieser Mission wird die ''Voyager'' mehrfach von Kazon-Schiffen angegriffen und diese beschädigen die [[Steuerbord]]seite des Schiffes. Dabei werden die sekundären Kommandoprozessoren des Schiffes beschädigt. Aber die Kazon ziehen sich schnell wieder zurück. Als es zu einem Großangriff der Kazon kommt und diese ins Schiff eindringen, will Janeway die Selbstzerstörung aktivieren. Doch da die sekundären Kommandoprozessoren nicht funktionsfähig sind, lässt sich die Selbstzerstörung nicht aktivieren. Somit gelingt es [[Seska]] mit den Kazon die ''Voyager'' zu übernehmen. ({{VOY|Der Kampf ums Dasein, Teil I}})
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