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[[Sektion 31]] ist eine geheime Organisation, die die Mitgliedswelten der [[Föderation]] und deren Bewohner mit allen – also auch inhumanen – Methoden verteidigt. Die Sektion existierte existiert bereits seit der Gründung der [[Sternenflotte (Erde)|Sternenflotte der Erde]] und ist in deren [[Charta der Sternenflotte|Charta]] festgeschrieben. Ihre Existenz wird jedoch offiziell abgestritten. Sektion 31 handelt daher ohne offiziellen Auftrag und unabhängig von offiziellen Föderationsstellen. Ihr Einfluss reicht weit in die [[Kommandokette|Kommandostruktur]] der Föderation, jedoch ist dieser Einfluss einseitig. Offizielle Föderationsstellen haben keinerlei Einfluss auf die Aktionen von Sektion 31. Sektion 31 hat Da es kein Hauptquartier. Alle oder sonstige Einrichtungen gibt und auch keine offiziellen Aufzeichnungen existieren, bestehen alle Informationen bezüglich Sektion 31 bestehen ausschließlich in den [[Kopf|Köpfen]] der [[Agent]]en. ({{ENT|Die Heimsuchung|Die Abweichung}}; {{DS9|Inquisition|Extreme Maßnahmen|Unter den Waffen schweigen die Gesetze}})

{{Meta|In der deutschen Synchronisation wird die Beteiligung nicht deutlich. Zwar sagt Reed zu Harris, dass er dachte , er wäre nicht mehr Mitglied seiner ''Sektion'', aber im Original wird es deutlich, als Harris und Archer sich unterhalten. Harris zitiert dabei die [[Charta der Sternenflotte|Sternenflottencharta]], <q>Artikel 14, <strong>Sektion 31</strong></q>. (In der deutschen Synchronisation: <q>Dienstvorschrift, Artikel 14, <strong>Paragraph 31</strong></q>)}}

[[2374]] versucht Agent [[Luther Sloan]], den [[Augment|genetisch aufgebesserten]] [[Doktor]] [[Julian Bashir]] zu rekrutieren , nachdem man ihn [[Entführung|entführt]] hat und einem Test unterziehtunterzogen hat. Der Doch der Doktor lehnt ab und alarmiert stattdessen den [[Führungsoffizier|Führungsstab]] von [[Deep Space 9]]. Nach der Meldung vergleicht [[Odo]] die Organisation mit dem [[Cardassianische UnionObsidianischer Orden|cardassianischenObsidianischen Orden]] der [[Obsidianischer OrdenCardassianische Union|Obsidianischen OrdenCardassianer]] und dem Tal Shiar der [[Romulanisches Sternenimperium|Romulaner]], wobei der Vergleich insofern hinktnicht ganz richtig ist, als da diese beiden Organisationen offiziell als Geheimdienste gelten. ({{DS9|Inquisition}})

Sloan ist nach eigenen Angaben einer der Agenten aus der höchsten Führungsriege und überwacht mehrere [[Mission]]en und . Er dirigiert Bashir ebenfalls in mehreren Missionen, unter anderem auf [[Romulus]], wo [[Senator|Senatorin]] [[Kimara Cretak|Cretak]] durch den Sektion-31-Agenten, der sich als [[Koval]] vom [[Tal Shiar]] ausgibt, ersetzt werden soll. ({{DS9|Unter den Waffen schweigen die Gesetze}})

Das [[Morphogener Virus|morphogene Virus]], welches in den [[2370er]] Jahren die [[Gründer]] des [[Dominion]] befällt ist, wie sich herausstellt, eine Kreation von Sektion 31, welches . Das Virus wurde über [[Odo]] in die [[Große Verbindung]] eingeschleust worden ist, nachdem dieser bei einer Untersuchung im [[Sternenflottenhauptquartier]] damit infiziert worden istwar. Doktor Bashir und [[Chief]] [[Miles Edward O'Brien|O'Brien]] planen darauf die Gefangennahme von Sloan , um an ein [[Heilmittel]] für Odo zu gelangen. Zwar gelingt es ihnen Sloan gefangenzunehmen, jedoch kann dieser mit Hilfe einer [[Neurodepolarisationsvorrichtung]] [[Selbstmord]] begehen. Den Die beiden gelingt sind trotzdem erfolgreich und sie schaffen es allerdings trotzdeman ein Heilmittel heranzukommen, indem sie sich mittels eines [[Multitronischer engrammatischer Übersetzer|multitronischen engrammatischen Übersetzers]], bei dem der Chief auf Anweisung von Julien einige [[Energierelais]] und [[Transferspule|Teansferspulen]] umleiten muss, mit dem [[Gehirn]] des Sterbenden verbinden, das Heilmittel zu erhalten. Sie riskierten dabei selbst ihr Leben zu verlieren , als sie erwogen weitere Informationen zur Zerschlagung der Sektion mitzunehmen. Hiervon wurde aufgrund des sich rapide verschlechternden Zustand Zustands von Sloans Gehirns verzichtet. ({{DS9|Ein Unglück kommt selten allein|Kampf mit allen Mitteln|Extreme Maßnahmen}})

{{Dialogzitat||über Sektion 31|Bashir|Diese Organisation… Dieses Organisation … dieses Ding, das sich in das Herz der Föderation geschlängelt hat, muss unbedingt vernichtet werden.}} ({{DS9|Extreme Maßnahmen}})

In {{ENT|Die Abweichung}} erklärt [[Harris (Sektion 31)|Harris]], dass es in der [[Sternenflotte (Erde)|Sternenflotte der Erde]] eine Regel gäbe, die in Notsituationen die Außerkraftsetzung Außenkraftsetzung und Übertretung aller anderen Regeln erlaube. Auf sie beruft er sich auch, um die Entführung von [[Phlox]] zu rechtfertigen. Diese Regel ist „Artikel 14, ''Sektion 31''“ der Sternenflottenvorschriften. Möglicherweise stammt daher der Name der Organisation. Um den Eindruck zu verstärken, dass Harris zu Sektion 31 gehört, trägt dieser bereits in {{ENT|Die Heimsuchung}} die schwarze Lederuniform, die später auch Vizedirektor [[Luther Sloan]] in [[DS9]] (ab {{E|Inquisition}}) trägt.