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==Ursprünge im 22. Jahrhundert==
[[ImageDatei:Harris Section 31.jpg|thumb|Agent Harris]]
Vor dem [[Start]] der [[Enterprise (NX-01)|''Enterprise'']] im Jahr [[2151]] ist [[Malcolm Reed]] Mitglied von Sektion 31. Im Jahr [[2154]] tritt sein ehemaliger [[Vorgesetzter]] [[Harris (Sektion 31)|Harris]] erneut an Reed heran und fordert dessen Mitarbeit bei einer Operation. ({{ENT|Die Heimsuchung|Die Abweichung}})
In den [[2370er]] Jahren gelingt es Sektion 31, einen Agenten in das [[Kabinett]] von [[Föderationspräsident]] [[Jaresh-Inyo]] einzuschleusen. In derselben Dekade unternimmt die Sektion verdeckte Operationen auf [[Qo'noS]], dem [[Heimatwelt|Heimatplaneten]] des zu der Zeit mit der Föderation verbündeten [[Klingonisches Imperium|Klingonischen Imperiums]]. ({{DS9|Extreme Maßnahmen}})
[[ImageDatei:Section 31 operatives.jpg|thumb|Sloan und zwei weitere Agenten der Sektion 31]]
[[2374]] versucht Agent [[Luther Sloan]], den [[Augment|genetisch aufgebesserten]] [[Doktor]] [[Julian Bashir]] zu rekrutieren nachdem man ihn [[Entführung|entführt]] hat und einem Test unterzieht. Der Doktor lehnt ab und alarmiert stattdessen den [[Führungsoffizier|Führungsstab]] von [[Deep Space 9]]. Nach der Meldung vergleicht [[Odo]] die Organisation mit dem [[Cardassianische Union|cardassianischen]] [[Obsidianischer Orden|Obsidianischen Orden]] und dem Tal Shiar der [[Romulanisches Sternenimperium|Romulaner]], wobei der Vergleich insofern hinkt, als diese beiden Organisationen offiziell als Geheimdienste gelten. ({{DS9|Inquisition}})