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In der [[Diplomatie]] bezeichnet ein Protokoll eine Verfahrensweise, die diplomatischen Standards entspricht. Es dient der Verhinderung von Zwischenfällen, die die Beziehung zwischen Staaten und [[Volk|Völkern]] verschlechtern würde ({{TNG|Indiskretionen}}).
In [[militär]]ischen Organisationen gibt es ebenfalls Protokolle, die zum Beispiel die [[Rang]]folge aber auch allgemein standartisierte standardisierte Verfahrensweisen kennzeichnen. Die Mitglieder dieser Organisationen müssen die Protokolle kennen und nach ihnen handeln, damit die gesamte Organisation überhaupt funktionieren kann. ({{VOY|Die Parallaxe}}) Auch Zivilisten, die enger mit dem Militär zusammenarbeiten oder längere Zeit bei ihm verbringen , müssen sich an die Protokolle halten um die Handlungsabläufe nicht zu behindern. ({{ENT|Die Verbindung}})
Zur Überwachung der Einhaltung von Protokollen gibt es [[Protokolloffizier]]e. Unter bestimmten Umständen kann es aber auch möglich sein, gegen das Protokoll zu handeln. So sieht das Protokoll der [[Sternenflotte]] im [[24. Jahrhundert]] vor, dass alle vorgesetzen [[Offizier]]e mit <q>[[Sir]]</q> angesprochen werden, auch wenn sie [[Geschlecht|weiblich]] sind, während im [[23. Jahrhundert]] noch <q>Madam</q> für weibliche Offiziere vorgeschrieben ist ({{Film|6}}). Da [[Captain]] [[Kathryn Janeway|Janeway]] die Anrede mit <q>Sir</q> jedoch nicht mag und auch die im 24. Jahrhundert angebotene Alternative <q>[[Ma'am]]</q> ungern hört gilt an Bord der [[USS Voyager|USS ''Voyager'']], seit sie das [[Kommando]] hat, ein geändertes Protokoll, sie direkt mit <q>Captain</q> anzusprechen. ({{VOY|Der Fürsorger, Teil I}})