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Zunächst wird ein [[Experiment|experimenteller]] [[Prototyp]], die [[USS Prometheus (Prometheus-Klasse)|USS ''Prometheus'' (NX-74913)]] konstruiert, welcher der Klasse den Namen gibt. Er wird im Jahr [[2374]], während des Dominion-Kriegs in Dienst gestellt und während ihres [[Jungfernflug]]es von einem [[Enterkommando]] der Romulaner [[Kaperung|gekapert]], mit der Absicht, diesen neuen Prototypen mit all seinen technologischen Geheimnissen und Neuentwicklungen an den [[Tal Shiar]] zu übergeben. Die Romulaner haben aber an Bord nicht mit dem [[Der Doktor|MHN]] der [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] gerechnet. Der Doktor sowie sein weiter entwickeltes Pendant MHN-II, arbeiten eine Strategie aus, um diese Entführung zu stoppen. Der Plan gelingt und der Weiterflug der ''Prometheus'' wird unterbrochen. Währenddessen aktiviert das MHN-II aus Versehen den Multi-Vektor-Angriffsmodus und versetzt den Prototypen in die Lage, seine beeindruckende Feuerkraft zu demonstrieren. Wenige [[Phaser]]schüsse genügen bereits, um einen der drei Warbirds der ''D'deridex''-Klasse vollständig zu zerstören. Schließlich wird die ''Prometheus'' durch eine herbei geeilte Streitmacht der Sternenflotte wieder übernommen. ({{VOY|Flaschenpost}})
[[2377]] öffnet sich ein Ausgang eines [[Transwarpkanal]]s im [[Alpha-Quadrant]]en, nicht weit von der [[Erde]] entfernt. Zufällig befinden sich gerade mehrere Schiffe der Sternenflotte im [[Sol-System]], durch die man in der Lage ist, ohne Zeitverlust einen [[Verteidigungsperimeter]] aufzubauen. Zu dieser [[Flotte]] gehören neben mehreren Einheiten der [[Galaxy-Klasse|''Galaxy''-Klasse]], auch [[Weitere Schiffe der Prometheus-Klasse|ein Schiff der ''Prometheus''-Klasse]]. Als eine [[Borg-Sphäre]] den Ausgang verlässt, wird sie augenblicklich unter Feuer genommen. Durch Dadurch das unerwartete Auftauchen der sich die USS ''Voyager'' innerhalb der Sphäre befindet, wird die Sphäre letztlich durch einen [[Transphasentorpedo]] nach nur kurzer Zeit zerstört. Danach begleiten einige der Verteidigungsschiffe der Sternenflotte, darunter auch das Schiff der ''Prometheus''-Klasse, die ''Voyager'' in Richtung Erde. ({{VOY|Endspiel, Teil II}})
{{alt|[[Datei:Prometheus-Klasse bei Schlacht von Procyon V.jpg|thumb|Bei der Schlacht von Procyon V.]]