[[2380]], in den letzten Monaten bevor die ''Voyager'' auf ihre lange Mission aufgebrochen ist ist, setzen Torres und Paris ihre Pläne in die Tat um, ihre Tochter vor den Kriegern von Gre'thor zu schützen. Beide lassen es so aussehen als währe ihre Ehe gescheitert und es kommt zur Trennung Torres taucht darauf unter und besorgt sich ein Schiff, welches mit einem Quantenslipstreamantrieb ausgestattet ist. Mit diesem Schiff will Torres mit ihrer Tochter den Quadranten verlassen und Richtung Delta-Quadranten fliegen und sobald die Zeit reif ist, will Paris den beiden folgen. Beide sind der Meinung, dass ihre Tochter nur im Delta-Quadranten vor den Krieger sicher ist. Allerdings führt die scheinbare Trennung wieder zu einem Streit zwischen Paris und seinem Vater. Der Admiral wirft seinem Sohn vor als Ehemann und Vater versagt zu haben und will mit seinem Sohn nichts mehr zu tun haben. Als die ''Voyager'' endlich von der Mission zurückkehrt will sich Chakotay endlich mit Janeway in Venedig treffen. Er wartet auf sie, doch diese erscheint nicht. Wenig später erfährt Chakotay von [[Mark Johnson]], dass Janeway einen riesigen [[Borg-Kubus ]] erkundet hat und dort assimiliert und zur neuen [[Borg-Königin ]] transformiert wurde. Als der Kubus die Erde angreift, kann dieser vernichtet werden, allerdings kommt dabei Janeway ums Leben. Für Chakotay ist dies ein Schock und er kann nur schwer den Tod von Janeway verkraften.  Auch in den nächsten Wochen geht es Chakotay nicht besser den Verlust von Janeway zu verarbeiten. Chakotay ist verbittert über den Verlust und dies zeigt sich auch an seiner Kommandofähigkeit. So reagiert Chakotay aggresiv gegenüber seine Kollegen und schreit diese auch wegen harmlosen Kleinigkeiten an. Kurz darauf vernichtet Chakotay ein Schiff vom [[Orion-Syndikat]], obwohl dieser der ''Voyager'' unterlegen gewesen sind. Paris ist von dem Verhalten seines Captains geschockt und will den Angriff abrechen lassen, doch Chakotay verweist ihn von der Brücke und zeigt kein Mitleid. Paris meldet diesen Vorfall sofort Camebrige, damit sich dieser um Chakotay kümmert, doch dieser will keine Hilfe annehmen.  [[2381]], Chakotay wirkt nur noch erschöpft und ist kaum noch in der Lage das Kommando über die ''Voyager'' zu führen. Doktor Kaz führt häufig Gespräche mit ihm, doch das bringt auch nicht viel. Zu dieser Zeit kommt es zu Angriffen der [[Borg]] in das Territorium der Föderation und greifen einem Planeten nach dem anderen an. Zusammen mit seiner Crew bekämpft Chakotay die angreifenden Kuben. Es gelingt der Crew einige Kuben zu vernichten. In dieser Zeit erfährt Paris vom Tod seines Vaters, welcher bei einem Borgangriff auf [[Sternenbasis 234]], ums Leben gekommen ist. Bevor dieser gestorben ist, schickt er noch eine Nachricht an seinen Sohn wo er sich für alles entschuldigt. Obwohl beide im Streit auseinander gegangen sind, trifft Paris dieser Verlust sehr. Inzwischen bekommt Chakotay neue Befehle, aufgrund gesammelter Daten der [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E)]] und der ''Aventine'' soll sich die ''Voyager'' mit einer Flotte im [[Azur-Nebel]] versammeln, um dort die eine Borg-Flotte aufzuhalten.

| Institutionen = [[Akademie der Sternenflotte]], [[Dominion]], [[Föderationsbehörde für temporale Ermittlungen]], [[Geheimdienst der Sternenflotte]], [[Klingonischer Hoher Rat]], [[Maquis]], [[Medizinisches Corps der Sternenflotte]], [[Orion-Syndikat]], [[Sternenflotte]], [[Vereinigte Föderation der Planeten]]| Spezies = [[Betazoid]], [[Borg]], [[Deltaner]], [[Elasianer]], [[Ferengi]], [[Gründer]], [[Hirogen]], [[Ilari]], [[Jem'Hadar]], [[Kazon]], [[Klingone]], [[Mari]], [[Mensch]], [[Mikhal-Traveler]], [[Schwarm (Spezies)|Schwarm]], [[Spezies 8472]], [[Trill]], [[Ullianer]], [[Vidiianer]], [[Voth]], [[Vulkanier]]

| Person = [[Alynna Nechayev]], [[Asil]], [[B'Elanna Torres]], [[Beverly Crusher]], [[Borg-Königin]], [[Chakotay]], [[Crell Moset]], [[Deanna Troi]], [[der Doktor|Doktor]], [[Erster (Borg)|Erster]], [[Frank Darwin]], [[Gowron]], [[Haley]], [[Harry Kim]], [[Icheb]], [[Irene Hansen]], [[Jara]], [[Jean-Luc Picard]], [[K'Trelan]], [[Kahless]], [[Kahless (Klon)]], [[Kathryn Janeway]], [[Kes]], [[Kohlar]], [[Leonard]], [[Lewis Zimmerman]], [[Libby]], [[Lon Suder]], [[Lukara]], [[Mark Johnson]], [[Mollie]], [[Molor]], [[Naomi Wildman]], [[Neelix]], [[Noss]], [[Owen Paris]], [[Reclaw]], [[Reginald Barclay]], [[Samantha Wildman]], [[Sek]], [[Seven of Nine]], [[T'Pel (Tuvok)|T'Pel]] [[Tom Paris]], [[Tuvok]], [[Vorik]], [[Worf]]| Schiffe = [[Borg-Kubus]], [[Deep Space 5]], [[Delta Flyer II|''Delta Flyer'']], [[Intrepid-Klasse|''Intrepid''-Klasse]], [[Jupiter-Station]], [[Klasse-2-Shuttle]], [[McKinley-Station]], [[Phalanx des Fürsorgers]], [[Sternenbasis 234]], [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-D)]], [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E)]], [[USS Melbourne (Excelsior-Klasse)|USS ''Melbourne'']], [[USS Titan|USS ''Titan'']], [[USS Voyager|USS ''Voyager'']]| Ort = [[Arrestzelle]], [[Astrometrisches Labor]], [[Bereitschaftsraum]], [[Brücke]], [[England]], [[Holodeck]], [[Krankenstation]], [[Maschinenraum]], [[Quartier]], [[San Francisco]], [[Transporterraum]], [[Turbolift]], [[Zentraler Plexus]]| Astronomie = [[Acamar III]], [[Alpha-Quadrant]], [[Azur-Nebel]], [[Badlands]], [[Betazed]], [[Boreth]], [[Cestus III]], [[Davlos III]], [[Delta-Quadrant]], [[Deneva]], [[Erde]], [[Fluider Raum]], [[Gamma-Quadrant]], [[Qo'noS]], [[Risa]], [[Sol-System]], [[Vulkan]]| Technik = [[Ablativpanzerung]], [[Bat'leth]], [[Biobett]], [[Borg-Alkoven]], [[Chronometer]], [[D'k tahg]], [[Disruptor]], [[Feldgenerator]], [[Hypospray]], [[Isolinearer Chip]], [[Kemocit]], [[Kommunikator]], [[Kraftfeld]], [[Mek'leth]], [[Mobiler Emitter]], [[Nanosonde]], [[PADD]], [[Phaser]], [[Phasergewehr]], [[Photonentorpedo]], [[Quantenslipstreamantrieb]], [[Quantentorpedo]], [[Replikator]], [[Traktorstrahl]], [[Transphasentorpedo]], [[Tricorder]], [[Trikobalttorpedo]], [[Traktorstrahl]], [[Transwarpzentrum]], [[Tritanium]]

| Sonstiges = [[Admiral]], [[Baakonit]], [[Baseball]], [[Belobigung]], [[Bett]], [[Blut]], [[Botschafter]], [[Captain]], [[Commander]], [[Counselor]], [[Dienstakte]], [[Dienstplan]], [[Edelstein]], [[Ensign]], [[Erster Offizier]], [[Golf]], [[Hinrichtung]], [[Höhle]], [[Humor]], [[Irumodisches Syndrom]], [[Klingonischer Imperator|Imperator]], [[Klingonischer Kanzler]], [[Kollisionskurs]], [[Labyrinth]], [[Lava]], [[Lieutenant]], [[Lieutenant Commander]], [[Parfüm]], [[Scheidung]], [[Schreibtisch]], [[Sofa]], [[Spiegel]], [[Staub]], [[Tisch]], [[Velocity]]