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Die Funktion von Naniten kann durch [[Gammastrahlung]] niedriger [[Dosis]] eingeschränkt werden. Starke Gammastrahlung vernichtet Naniten. ({{TNG|Die Macht der Naniten}})
Infolge einer Unachtsamkeit werden während eines [[Experiment]]s mit Naniten bei [[Sternzeit]] 43125 auf der [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'']] die [[Computer]]systeme des [[Raumschiff|Schiffes]] angegriffen. [[Wesley Crusher]] versucht in diesem Experiment, die Naniten weiterzuentwickeln, indem er ihnen die [[Kommunikation]] untereinander ermöglicht. Zwei Naniten entkommen dabei und beginnen daraufhin, sich selbst zu replizieren und dabei Materialien aus Computerchips zu verwertetenverwerten. Durch die [[Vermehrung]] entwickeln sich die Naniten selbstständig weiter; sie entwickeln schließlich eine [[künstliche Intelligenz]] und bedrohen Schiff und [[Besatzung]]. Es gelingt schließlich [[Lieutenant Commander]] [[Data]], die Kommunikation mit den Naniten herzustellen. Ihrer Forderung nach einer Umsiedlung wird nachgekommen, [[Kavis Alpha IV]] als ihre neue [[Heimatwelt]] gewählt. ({{TNG|Die Macht der Naniten}})
Die Idee, Naniten zur Verteidigung gegen die [[Borg]] zu züchten, kommt [[2366]] während des [[Borg-Zwischenfall]]s auf, wird aber nicht in die Realität umgesetzt, da die Entwicklung einer geeigneten Nanitenkultur mehrere Monate in Anspruch nehmen würde. ({{TNG|Angriffsziel Erde}})
