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Scott wird kurz darauf von einem [[Vendorianer]] angegriffen, welcher für die Romulaner arbeitet. Später merkt der Vendorianer, dass sein Verhalten falsch ist und er hilft die ''Enterprise'' vor den Romulanern zu schützen. ({{TAS|Der Überlebende}})
Scott übernimmt im Orbit von [[Phylos]] das Kommando über die ''Enterprise'', während Kirk, McCoy und Sulu auf der Oberfläche nach dem entführten Spock suchen. ({{TAS|Das Superhirn}})
Kurz darauf fliegt die ''Enterprise'' in das Zentrum unserer Galaxie um nach neu erschaffener Materie zu forschen. Plötzlich wird das Schiff unaufhörlich von einer geheimnisvollen Wirbelenergie angezogen. Als die ''Enterprise'' ins "Auge" des Wirbels gelangt, herrscht "Windstille" und ein fremdes Wesen namens [[Lucien]] taucht plötzlich auf. Er lädt die Crew auf den Planeten [[Megas-Tu]] ein. Aber einige [[Megasier]] trauen den Menschen nicht, da sie aus ihr Verhalten aus der Vergangenheit kennen. Es kommt zu einen Prozess gegen die Menschen, auch Scott wird gefangen genommen und muß sich für das Verhalten der Menschen mitverantworten. Kirk kann aber den Megasier beweisen, dass die Menschen sich inwischen geändert haben. ({{TAS|Das Geheimnis von Megas-Tu}})
Kirk beamt mit einem Außenteam auf den [[Landurlaubs-Planet]]en, während Scott das Kommando über die ''Enterprise'' übernimmt. Aber in der Zwischenzeit ist der [[Verwalter]] des Planeten, den Kirk 2267 bei seinen letzten Besuch getroffen hat, gestorben und der Computer des Planeten hat die Steuerung über die Phantasiewesen übernommen. Der Computer duldet keine Besucher auf dem Planeten und er greift das Außenteam der ''Enterprise'' an. Auch das Schiff wird vom Computer angegriffen. Der Computer schaltet die Schwerkraftkontrollen ab und Scott und die übrige Besatzung schwebt an Bord. Als Scott versucht die Schwerkraft wieder einzuschalten, wird dieser vom Computer angegriffen. Erst als Kirk es gelingt eine friedliche Co-existenz mit dem Computer des Planeten auszuhandeln wird die normale Schwerkraft wieder hergestellt. ({{TAS|Phantasie oder Wirklichkeit}})
[[Bild:Scott auf Argo.jpg|thumb|Montgomery Scott auf dem Planeten Argo.]]
Einige Wochen später verliebt sich Lieutenant [[M'ress]], welche unter Wirkung von Mudds [[Liebeskristall]] steht, in Scott. Er versucht sie von sich fernzuhalten, aber mit wenig Erfolg. Nachdem die Wirkung des Kristalls nachlässt, kommt es immer zum Streit zwischen den ehemaligen verliebten, darunter auch M'ress und Scott. ({{TAS|Der Liebeskristall}})
Durch Strahlen welche von den [[Terraziner]] geschickt werden, schrumpft die Crew der ''Enterprise'' darunter auch Scott. Scott und seine Leute sind die ersten die merken, dass die Werkzeuge immer größer werden. Später muss der mikroskopisch kleine Scott Kirk auf den Planeten beamen. Durch den Transporter bekommt die Crew kurz darauf ihre normale Größe zurück. ({{TAS|Die Rettungsmission}})