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Es ist vor allem seinem technischen Sachverstand zu verdanken, dass die Station zum [[Bajoranisches Wurmloch|Bajoranischen Wurmloch]] verlegt werden kann, was der [[Föderation]] die Kontrolle über das [[Wurmloch]] sichert und einen strategischen Vorteil bedeutet. ({{DS9|Der Abgesandte, Teil I}})
Seine [[Versetzung ]] auf Deep Space 9 verursacht alsbald einen heftigen Ehestreit mit seiner Frau Keiko, die sich auf der Station als Botanikerin [[Botaniker]]in nutzlos fühlt und die gemeinsame Tochter [[Molly O'Brien|Molly ]] nicht dort aufwachsen sehen will. O'Brien bietet Keiko an, sich versetzen zu lassen. Doch sie lehnt es ab, da ihr Mann in diesem Fall auf seine [[Beförderung ]] verzichten müsse. Auch weitere seiner Vorschläge, wie die Bepflanzung des Promenadendecks [[Promenadendeck]]s oder die Errichtung eines Arboretums[[Arboretum]]s, finden nicht ihren Zuspruch. ({{DS9|Unter Verdacht}})
Auf der von den Cardassianern sabotierten Station ist er eines der wichtigsten Besatzungsmitglieder. Bei der Reparatur der [[Replikator]]en aktiviert er jedoch versehentlich eine alte Falle des [[Bajoranischer Widerstand|Bajoranischen Widerstands]], durch den ein [[Aphasie-Virus]] freigesetzt wird, an dem er fast stirbt. ({{DS9|Babel}})