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* 2268 soll Kirk durch den Computer [[M5]] als Kommandant ersetzt werden. ({{TOS|Computer M5}})
* Im Orbit von [[Gamma Trianguli VI]] wird die Enterprise von einer unbekannten Energiequelle angegriffen. Scott hat zu dieser Zeit das Kommando über die ''Enterprise''. ({{TOS|Die Stunde der Erkenntnis}}) 2268 befinden sich Kirk und sein Landetrupp auf den Planeten mit der Kennung [[892-IV]] auf der Suche nach Überlebenden von dem vor Jahren verschollenen Forschungsschiff [[SS Beagle|SS ''Beagle'']] und werden dort von der Einheimischen Bevölkerung gefangen genommen. Scott hat zu der Zeit wieder das Kommando über die ''Enterprise''. ({{TOS|Brot und Spiele}}) 2268 transportiert die ''Enterprise'' einige der wichtigsten Diplomaten nach [[Babel (Planet)|Babel]] zur [[Babel-Konferenz]]. Dabei wird Captain Kirk angegriffen und schwer verletzt, so dass [[Spock]] das Kommando über das Schiff übernimmt. ({{TOS|Reise nach Babel}}) Einige Wochen später übergibt Kirk Scott das Kommando über die Enterprise, als dieser seinen Freund Tyree besucht. ({{TOS|Der erste Krieg}})
* Nach einem Zeitsprung aus dem jahr 2268 ins Jahr 1968 kann [[Gary Seven]] auf die Erde entkommen. Kirk und Spock folgen ihn auf die Erde, während Scott das Kommando über die ''Enterprise'' übernimmt. ({{TOS|Ein Planet , genannt Erde}}) Ebenfalls im Jahr 2268 wirkt Captain Kirk aggressiv und durchquert mit der Enterprise die neutrale Zone und fliegt in den romulanischen Raum. Kurz darauf beamen Kirk und Spock zu einem Romulanischen Schiff, während Scott das Kommando über die Enterprise übernimmt. ({{TOS|Die unsichtbare Falle}}) Scott übernimmt das Kommando über die Enterprise, als Kirk mit einem Außenteam auf den Planeten Minara II beamt. ({{TOS|Der Plan der Vianer}})
* 2269 übernimmt kurzzeitig [[Uhura]] das Kommando ({{TAS|Das Lorelei Signal}})
* Scott gehört 2270 zum Außenteam, welches sich auf den Planeten [[Delta Theta III]] beamt. Als Kirk und Spock von den Einwohnern des Planeten gefangen genommen wird, beamt Scott zurück auf die ''Enterprise'' und übernimmt das Kommando. ({{TAS|Gefährliche Prüfung}})
