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Kurz darauf wird der bajoranische Terrorist [[Tahna Los]] von den Cardassianern verfolgt und bittet [[Asyl]] auf Deep Space 9. Kira setzt sofort bei Sisko ein, dass dieser Asyl bekommt, obwohl dieser zur Kohn-Ma gehört. Obwohl die Cardassianer sich zurück gezogen haben, bekämpfen die Kohn-Ma noch immer die Cardassianer und alle die nicht auf der Seite der Kohn-Ma sind. Als Sisko seine Zweifel gegenüber Tahna äußert wendet sich Kira heimlich an [[Admiral]] [[Rollman]] und äußert ihre Bitte um Asyl. Der Admiral gewährt Kira diese Bitte und gibt Sisko den Befehl Tahna Asyl zu gewähren. Sisko ist verärger, dass sich Kira über seinen willen hinweg gesetzt hat. Inzwischen kümmert sich Kira um Tahna, doch dieser ist enttäuscht, dass sie nun für die Regierung arbeitet, statt für Bajors Freiheit zu kämpfen. Nach Tahnas Meinung schadet der Kontakt zur Föderation Bajor und er will auch einen Kampf gegen die neue bajoranische Regierung führen, da diese nicht den Willen der Kohn-Ma vertritt. Kira erklärt, dass sie noch immer sich um ihre Heimat kümmert aber nun auf einer anderen Art. Kira beginnt mit der Zeit an Tahna zu zweifeln und sie ist sich ihrer Loyalität nicht sicher. Erst nach einem Gespräch mit Odo weiß sie wem ihre Loyalität gehört. Kira teilt darauf Sisko mit, dass sie einen Verdacht gegen Tahna hegt. Inzwischen bereitet Tahna einen weiteren Anschlag vor, er will das Wurmloch zerstören, damit die die Föderation von Bajor zurück zieht. Kira begleitet darauf Tahna auf die [[USS Yangtzee Kiang|USS ''Yangtzee Kiang'']] und zusammen begeben sie sich zu abtrünnigen [[Klingone]]n-Schwestern [[Lursa]] und [[B'Etor]] aus dem [[Haus des Duras]]. Tahna bekommt in der Nähe von [[Bajor VIII]] von den beiden Klingoninnen [[Bilitrium]], welches er für eine [[Bombe]] verwenden will. Mit dieser Bombe will Tahna das Wurmloch vernichten, damit sich die Föderation so von Bajor zurück zieht. Bevor Tahna seinen Plan ausführen kann, wird dieser von Kira überwältigt und verhaftet. ({{DS9|Die Kohn-Ma}})
Wenig später wird der Bajoraner [[Ibudan]] ermordet und kira wird in die Ermittlungen mit einbezogen. Doch kurz darauf fällt der Verdacht auf Odo, dass dieser für den Mord verantwortlich ist und Sisko ist gezwungen ihn vom dienst zu suspendieren. Doch Kira glaubt an Odos Unschuld und sie setzt die Ermittlungen fort. Inzwischen findet Bashir heraus, dass nicht Ibudan, sondern in Wirklichkeit ein [[Ibudan (Klon 1)|Klon von Ibudan]] ermordet worden ist. Später kann Odo den echten Ibudan für den Mord an seinem [[Klon]] verhaften. Ibudan wollte den Mord an sich Odo in die Schuhe schieben, um sich zu rächen, da Odo ihn vor Jahren verhaften ließ. ({{DS9|Unter Verdacht}})
Da noch immer viele Systeme nicht funktionieren, muss sich O'Brien um die ganzen Reperaturen kümmern. Kira bemerkt die Erschöpfung von O'Brien, doch der Chief muss sich weiter um seine Arbeit kümmern. Wenig später beginnt O'Brien einige der [[Replikator]]en zu reparieren, allerdings aktiviert er versehentlich eine vom bajoranischen Widerstand versteckte Vorrichtung aus der cardasianischen Zeit, der einen [[Aphasie|Aphasie-Virus]] auf der Station verbreitet. [[Quark]] nutzt heimlich diesen Replikator, um wieder [[Speise]]n und [[Getränk]]e für seine Bar zu servieren und unbewusst sorgt Quark so für die Verbreitung des [[Virus]]. Durch den Virus werden die neuralen und visuellen Reize vom [[Gehirn]] falsch verarbeitet und immer mehr Personen infizieren sich mit den Virus. Bei Nachforschungen findet Kira das Gerät, welches den Virus im Replikatorsystem verbreitet. Bashir findet heraus, dass die Bajoraner das Gerät entwickelt haben. Kira findet heraus, dass [[Dekon Elig]] diesen Virus entwickelt hat. Doch da dieser bereits tot ist wendet sich Kira an seinen Assistenten [[Surmak Ren]]. Doch dieser weigert sich Kira zu helfen. Kira begibt sich nach Bajor und beamt Surmak an Bord des [[Runabout]]s. Doch dieser weigert sich noch immer Kira zu helfen. Allerdings gibt Kira ihn zu verstehen, dass er sich auch mit dem Erreger infiziert hat und nun keine Wahl mehr hat. Schließlich bricht auch bei Kira der Virus aus. Mit den Forschungen von Bashir findet Surmal ein Heilmittel und kann so den Virus behandeln. ({{DS9|Babel}})
Einige Zeit später besucht ein [[Tosk]] aus dem [[Gamma-Quadrant]] Deep Space 9. Dort versucht er allerdings einige Waffen zu stehlen. Doch dabei wird der [[~/Person/DS9/1x06/1|Tosk]] von Odo erwischt und in eine [[Arrestzelle]] gesperrt. Wenig später dringen die [[Tosk-Jäger]] gewaltsam in die Stadtion ein und Kira hilft bei der Verteidigung der Station. Doch die Tosk-Jäger dürfen mit Siskos Erlaubnis den Tosk mitzunehmen. Aber mit O'Briens Hilfe kann der Tosk in den Gamma-Quadrant fliehen. ({{DS9|Tosk, der Gejagte}})
Nach einer [[Expedition]] in den Gamma-Quadranten, wird eine junge Frau namens [[Vash]] mit nach Deep Space 9 gebracht. Die Offiziere an Bord der Station können sich nicht erklären, wie sie ohne das Wissen über das Wurmloch in den Gamma-Quadrant gekommen ist. Es stellt sich heraus, dass Vash mit [[Q]] zusammen im Gamma-Quadrant gewesen ist, allerdings will Vash nichts mehr mit Q zu tun haben. Als Kira von Q erfährt fragt sie Sisko was ein Q ist und Sisko erfährt, dass die Sternenflotte häufig Probleme mit Q gehabt hat. Vash will inzwischen [[Profit]] mit den [[Artefakt]]en, welche sie mitgebracht hat, machen und Quark bietet ihr an eine [[Auktion]] im [[Quark's]] durchzuführen. Plötzlich wird die Station zum Wurmloch gezogen und droht darin zerstört zu werden. Es stellt sich heraus, dass eines von Vashs Objekten für diese Ausfälle verantwortlich ist. Sisko lässt dieses sofort von Bord beamen und das Objekt entpuppt sich als [[Embryonische Lebensform]], welche in das Wurmloch fliegt. Als die Lebensform die Station verlassen hat, ist diese wieder außer Gefahr. ({{DS9|"Q" – Unerwünscht}})
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