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Nachdem auf dem Schiff zwei [[Voth]]-Wissenschaftler entdeckt werden, die sich getarnt auf dem Schiff eingeschleust haben, lässt sie diese mit einem Kraftfeld einschließen und befragt sie. Daraufhin beamt sich Forra Gegen mit Chakotay weg. Janeway befragt den anderen und dieser versetzt sich in einen [[WInterschlaf]]. Wenig später informiert der Doktor den Captain, dass die DNA des Fremden, mit der von Spezies von der Erde identisch ist. Die ''Voyager'' wird von den Voth geentert und unter Kontrolle gebracht. Während sie von einem Voth befragt wird, sabotiert Paris das Schiff. Unterdessen werden Chakotay und Forra Gegen verhört. Als Gegen seinen Lehren unter Drohungen abschwört, wird die ''Voyager'' freigelassen und darf ihre Reise fortsetzen. ({{VOY|Herkunft aus der Ferne}})
Kurze Zeit später, erscheint ein [[Nyrianer]] auf der ''Voyager'', der zunächst angibt, nicht zu wissen, wie er an Bord gelangte. Janeway befragt ihn und will ihm helfen in seine Heimat zurückzukehren. Man erkennt, dass er gegen Kes ausgetauscht wurde. Immer mehr Besatzungsmitglieder verschwinden. Janeway lässt die Nyrianer in den Frachträumen und Shuttlerampen internieren. Nachdem sie selbst transportiert wird, erkennt sie, dass die Nyrianer die ''Voyager'' übernehmen wollen. Im Internierungslager bespricht sie die Lage mit Tuvok. Als ein anderer Gefangener Jarlath aus einem anderen Habitat erscheint, verhandelt sie mit ihm. Sie suchen nach weiteren Portalen zu anderen Habitaten. Zusammen mit Torres und Paris gelangt er so in einen Kontrollraum, welcher Portale zu verschiedenen Habitaten enthält. Mithilfe des Übersetzungsalgorithmus der ''Voyager'' kann Janeway auf die Informationen zugreifen. Als sie einen Plan des Komplexes sucht, stößt sie auf SIcherheitscodes, die Tuvok überwinden kann. Sie erkennen, dass sie auf einem Schiff sind. Beim Versuch auf die Daten zuzugreifen, lösen sie einen Alarm aus. Sie gelangen in einen Tunnel und findden das Computersystem. Janeway versucht darauf zuzugreifen. Nachdem es ihnen gelingt, entdecken sie Paris und Torres im [[Argala]]-Habitat. Sie erkennen, dass die dortige Umgebung langfristig tödlich für Paris und Torres ist. Sie kann sie zurück ins Habitat der Föderation beamen und so retten. Anschließend beamt sie die Nyrianer in das Argala-Habitat und verlangt ihre Kapitulation. Angesichts der Umweltbedingungen kapitulieren die Nyrianer und die ehemaligen Gefangenen werden von ihren Völkern nach Hause geholt. ({{VOY|Translokalisation}})
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