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Nach der Ankunft bei der [[Heimatwelt der Kohl|Kohl-Heimatwelt]], ruft sie alle Führungsoffiziere auf die Brücke. Sie lässt den Planeten scannen. Kurz darauf empfängt man eine automatische Nachricht, in der sie der [[Kohl]] [[Viorsa]] informiert, dass es Überlebende in Stasiskapseln gibt, die nicht gestört werden wollen. Da die Aufwachzeit bereits überschritten ist, beschließt Captain Janeway die Kapseln an Bord zu beamen und näher zu untersuchen. Gemeinsam mit Kim und Kes untersucht sie die Stasiskapseln. Sie erkennen, dass die Stasiskapseln mit einem Computerprogramm verbunden sind, dass den Verstand der Insassen wach und aktiv hält. Man beschließt die Insassen aufzuwecken, indem mithilfe der beiden leeren Kapseln zwei Offiziere in die Simulation hineingehen und dort das kapselinterne Abbruchprogramm initiieren. Dies scheitert jedoch und Janeway versucht mit ihren Leuten herauszufinden, weshalb das so ist. Der Versuch sie zu befreien, scheitert, da der Rückrufbefehl von innen aufgehoben wird. Einige Zeit später, erwacht Torres und überbringt dem Captain die Forderungen des [[Der Clown|Clowns]], der die Kontrolle über die Simulation übernommen hat. Janeway bespricht daraufhin die Situation mit den Führungsoffizieren. Man entschließt sich die Geiseln zu befreien. Dazu muss jedoch der Clown abgelenkt werden, weshalb Janeway die Frage stellt, wie man mit einer Emotion verhandelt. Sie meint, man müsse einen Schwachpunkt finden, um die Angst zu überlisten. Der Doktor überbringt dem Clown den Vorschlag, ein simuliertes Gehirn zu erhalten. Die ablehnende Reaktion des Clowns überbringt der Doktor dem Captain. Jedoch überbringt er auch Viosas versteckten Hinweis, wie man den Clown besiegen kann. Dieser Versuch scheitert jedoch und Viosa wird vom Clown hingerichtet. Sie bespricht die Situation mit dem Doktor. Sie fragt, was für die Angst der Höhepunkt sein könnte. Daraufhin bietet sie sich selbst als Geisel an. Sie wird im Austausch für die anderen in die Simulation gebracht. Jedoch wird nur ein Bild des Captains projiziert, was sie ihm nach der Befreiung der Geiseln offenbart. Sie offenbart ihm, dass er besiegt wurde. ({{VOY|Das Ultimatum}})
Nachdem Tuvok und Neelix bei einem Transporterunfall vereinigt werden, spricht sie mit der neuen Lebensform, die sich [[Tuvix]] nennt. Er möchte den Dienst schnellstmöglich wieder aufnehmen. Da der Doktor keine Einwände hat, lässt sie ihn am Briefing der Führungsoffiziere teilnehmen. Bei dieser Besprechung, kann zumindest geklärt werden, wie Tuvix entstehen konnte. Später sucht Kes das Gespräch mit ihr. Sie meint, dass sie nicht bereit ist Neelix aufzugeben. Nachdem es dem Doktor und Harry nach mehreren Wochen gelingt, ein Verfahren zu entwickeln, um die DNA-Stränge der beiden Lebensformen zu trennen, spricht sie mit Tuvix. Sie will ihn wieder trennen. Da Tuvix dies ablehnt, diskutiert sie mit ihm. Er spricht auch mit Kes, aber sie kann sich beim Captain nicht für ihn einsetzen, auch wenn Tuvix es nicht verdient hat zu sterben. Letztlich entscheidet sie sich, die beiden wieder zu trennen. Sie selbst bedient die Transporterkontrollen bei diesem Vorgang, da der Doktor es nicht mit seinen ethischen Subroutinen vereinbaren kann. ({{VOY|Tuvix}})
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