Schon auf der [[Sternenflottenakademie]] genießt Bashir einen ausgezeichneten Ruf, weshalb viele überrascht sind, dass er hinter Dr. [[Elizabeth Lense]] nur als zweiter des Jahrgangs [[2367]] abschließt. Er ist Klassenbester in [[Kinderheilkunde]]. ({{DS9|Die Abtrünnigen}})

Bei seiner Abschlußprüfung hat Bashir einige Probleme. Er braucht sehr lange um seine Augaben zu lösen und gehört mit zu den letzten, welche die Prüfung abschließen. Aber trotz dieser Mühen besteht Bashir die Abschlußprüfung erfolgreich. ({{DS9|Q - Unerwünscht}})

Kurz darauf wird Deep Space Nine aufgrund eines [[Plasmasturm]]s vollständig evakuiert. Nur eine Notbesatzung, darunter auch Bashir bleibt zurück. Auch Quark bleibt wegem seinem Latinum auf der Station zurück. Quark versucht weiter Geschäfte zu machen und hat mit einem Söldner namens [[Yeto]] Kontakt. Quark manipuliert für ihn die [[Andockrampe]]n. Kurz darauf erhält die Station einen Notruf von einem Schiff und Sisko läßt es an die Station andocken. Aufgrund von Quarks manipulation können die Söldner, welche von dem Trill [[Verad]] angeführt werden, bewaffnet auf die Station eindringen. Bashir wird gezwungen Odo in einem Behälter zu sperren und in die [[Stasiskammer]] einzuschließen. Später wird Bashir gezwungen den [[Trill-Symbiont|Symbiont]] von Jadzia zu entfernen und in Verad reinzusetzen. Die Operation verläuft zwar erfolgreich, aber aufgrund des Verlustes des Symbionten liegt Jadzia im sterben. Bashir tut alles um sie am Leben zu erhalten. Quark, der wie die anderen Offiziere gefangen gehalten wird erkennt seinen Fehler und das er für den Tod von Jadzia verantwortlich sein wird. Er greift den Klingonen [[T'Kar]] an und wird beim Angriff leicht verletzt. Auf der Krankenstation tut Quark, als ob er schwer verletzt ist und so gelingt es ihm und Bashir den Klingonen Yeto zu überwältigen und Odo zu befreihen. Odo und Sisko gelingt es schließlich Verad und seine Söldner aufzuhalten. Im letzten Moment kann Bashir Jadzia ihren Symbiont zurückgeben und sie wird gerettet. ({{DS9|Der Symbiont}})

Als sich Bashir und Garak im Replimat treffen wird Garak von einem cardassianische Jungen [[Rugal]] angegriffen. Der Junge ist eine Cardassianische Kriegswaise, welche auf Bajor zurückgeblieben ist. Plötzlich meldet sich [[Gul]] [[Dukat]] und zeigt große Intresse an den Jungen. Garak vermutet, dass da etwas mit Rugal nicht stimmt. Bashir und Garak forschen wegen den Kriegswaisen auf Bajor nach. In der zwischenzeit stellt sich herraus, dass Rugal der Sohn von [[Kotan Pa'Dar]] ist. Garak und Bashir finden herraus, dass Dukat hinter einer Konspiration steckt, welche Kotan Pa'Dar entmachten soll. Rugal ist das Opfer dieser Konspiration und verschwindet während der [[Cardassianische Besetzung von Bajor|Cardassianischen Besetzung von Bajor]] und wird für tot erklärt. Später soll er nach Dukat als Kriegswaise auftauchen und Kotan Pa'Dar als verantwortungslosen Vater darstellen. Damit hätte Kotan Pa'Dar seine Position in der Regierung verloren. Als Bashir Dukat dieses alles vorwürft, verläßt Dukat den Raum und gibt somit indirekt seine Schuld zu. Rugal kehrt zu seinem Vater nach Cardassia zurück. ({{DS9|Die Konspiration}})

Bashir und O'Brien arbeiten lange zusammen um alles für [[Melora Pazlar]], welche von einem Planeten mit niedriger [[Schwerkraft]] stammt, auf Deep Space Nine vorzubereiten. Melora Pazlar will aufgrund ihr Behinderung in normaler Schwerkraft keine Hilfe von Fremden. Da Bashir ihr Helfen will, ist sie auch zu ihm anfangs feindseelig. Bashir findet kurz darauf eine Methode, wie sie sich auch bei normaler Schwerkraft bewegen kann. Sie stimmt dieser Behandlung zu. Melora Pazlar macht fortschritte und kann sich mit der Zeit normal bewegen. In der Zeit wo Bashir Melora Pazlar behandelt, kommen sich die beiden näher. Die beiden verabreden sich im [[Klingonisches Restaurant|klingonischen Restaurant]]. Später küssen sich die beiden in dem [[Quartier]] von Melora. Melora Pazlar entscheidet sich später die Behandlung abzubrechen, da sie so nicht mehr auf ihrer [[Heimatwelt]] leben kann. Kurz darauf verläßt Melora Pazlar wieder die Station. ({{DS9|Das Melora-Problem}})

Bashir behandelt Quark, nachdem dieser umgefallen ist als er erfahren hat, dass Pel eine Ferengifrau ist. ({{DS9|Profit oder Partner}})

Kurz darauf wird Bashir mit den Führungsoffizieren von Deep Space Nine von [[Professor]] [[Gideon Seyetik]] auf die [[USS Prometheus (NCC-71201)|USS ''Prometheus'']] zum Essen eingeladen. ({{DS9|Rätselhafte Fenna}})

Um sich mit O'Brien besser anzufreunden lädt Bashir ihn zu einem Racquetballmatch ein. O'Brien nimmt an, aber verliert gegen den überlegenen Bashir. O'Brien fühlt sich in seiner [[Ehre]] verletzt und fordert Bashir einige weitere Male herraus. Obwohl O'Brien weiterhin verliert versucht er weiter gegen den Arzt zu spielen. Bashir macht sich inzwischen Sorgen um den Chief, da er nicht mehr der jüngste ist. Um O'Brien nicht zu überfordern gelingt es Bashir mit einigen Tricks die Spiele vorzeitig abzubrechen. Zu der Zeit befindet sich der [[El-Aurianer]] [[Martus Mazur]] an Bord der Station. Dieser besitz ein außerirdischen [[Glücksspiel]]gerät. Zu der Zeit weiß niemand, dass seine Spielgeräte das Glück jeder Person auf der Station beeinflusst. Mazur eröffnet ein eigenes Lokal und beginnt einen direkter Konkurenz mit Quark. Um sein Geschäft wieder aufzuleben läßt Quark ein Racquetballmatch zwischen Bashir und O'Brien veranstalten. Quark nimmt die Wetteinsätze auf den Sieger entgegen, um aber selbst zu gewinnen versucht Quark Bashir mit einem Trank außer Gefecht zu setzen. Bashir durschaut aber Quark und Spiel zwischen O'Brien und Bashir findet ohne Quarks manipulation statt. Obwohl Bashir wieder überlegen ist, scheint Bashir in diesem Spiel nur Pech zu haben, während O'Brien jeden Ball trifft. Anhand dieses Spiels finden die Führungsoffiziere herraus, dass die Glücksspielgeräte von Mazur für den ganzen Zustand verantwortlich ist. ({{DS9|Rivalen}})

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