Nachdem ein Shuttle mit Tuvok und Paris verschwindet, scannt Kim erfolglos nach diesem. Während Janeway, Chakotay und Torres eine Anomalie untersuchen, die für das Verschwinden des Shuttles verantwortlich zu sein scheint, erfasst sie ein fremdes Schiff mit einem Traktorstrahl. Kim fordert dessen Captain auf den Strahl zu lösen. Yost erklärt Janeway darauf, dass in dieser Anomalie verschiedene Schiffe verschwunden sind und diese nun verschlossen wird. Bevor die Anomalie verschlossen wird gelingt es Tuvok, der Doktor und Paris sowie [[Noss]], welche die beiden unterstützt hat, zu retten. ({{VOY|Schwere}})

Bald darauf entdeckt Kim mit Tuvok ein Wurmloch, dass scheinbar in den Alpha-Quadranten führt. Dieses Wurmloch ist jedoch nur eine Illusion, die von der [[Telepathische Werferpflanze|telepathischen Werferpflanze]] erzeugt wird. Deren Telepathie unterbindet seine anfänglichen Zweifel und lässt ihn an eine Rückkehr in den Alpha-Quadranten glauben. Die Einwände von Seven ignoriert Kim daher. Nachdem das Schiff die Lebensform erreicht, fällt Kim mit dem Rest der Besatzung, mit Ausnahme von Seven und Naomi Wildman, in eine Bewusstlosigkeit. Nachdem Seven und der Doktor mithilfe von [[Qatai]] das Schiff aus dem bioplasmischen Organismus befreit haben, kommt Kim wieder zu sich. ({{VOY|Euphorie}})

Wenig später gelingt es der ''Voyager'' eine [[Borg-Sonde]] zu vernichtet. Kim gelingt es einen Photonentorpedo an Bord zu beamen und kann so die Sonde vernichten. Aufgrund der geborgenen Komponenten und Daten entdeckt Janeway eine beschädigte [[Borg-Sphäre]] und diese beschließt von dort eine [[Transwarpspule]] zu stehlen, damit die ''Voyager'' mit dieser Technologie schneller zurück in den Alpha-Quadranten reisen kann. Kim gehört zum Außenteam und sprengt mit Tuvok den Schildgenerator der Borg. Doch bei dem Diebstahl der Transwarpspule bleibt Seven auf dem Borgschiff und kehrt zum [[Borg-Kollektiv]] zurück. Janeway gelingt es darauf bei einer Rettungsmission Seven zurück zu holen. Mit der Transwarpspule gelingt es der ''Voyager'' 20.000 Lichtjahre näher an den Alpha-Quadranten hin zu gelangen. ({{VOY|Das ungewisse Dunkel, Teil I|Das ungewisse Dunkel, Teil II}})

Kurz darauf hilft die Crew der ''Voyager'' bei der Reparatur des [[Varro-Generationenschiff]]s. Obwohl die Crew den Kontakt mit den Varro gering halten soll, verliebt sich Kim in die [[Varro]] [[Derran Tal]]. Obwohl es verboten ist, verbringt Kim viel Zeit mit Tal. An Bord der ''Voyager'' ist Kims Verschwinden zunächst nur Paris aufgefallen, der es für sich behalten will. Dieser verhindert auch Kims Entdeckung, als Tuvok auf Kims heimliche Kommunikation aufmerksam wird. Am nächsten Tag arbeitet Kim mit Seven an einer Diagnose des Varroschiffes in der Astrometrie. Dabei zeigt Kim jedoch Krankheitssymptome und Seven erkennt, dass seine Körpertemperatur erhöht ist. Nachdem seine [[Haut]] luminisziert, bringt sie ihn auf die Krankenstation, wo er vom Doktor untersucht wird. Als dieser Bioalarm auslösen will, gesteht Kim, dass er sich mit einer Varrofrau getroffen hat und intimen Kontakt gehabt hat. Auch muss der Doktor den Captain informieren, der Kim daraufhin zu sich zitiert. Janeway ist enttäuscht von Kims Verhalten und befiehlt ihm diese Beziehung zu beenden. Kim bekommt sogar von ihr einen Verweis in seiner Dienstakte. Über diese Entscheidung, informiert Kim Tal. Jedoch will er sie nicht verlassen und küsst sie. Wenig später beamt er sie auf ein Shuttle und macht mit ihr einen Ausflug. Während beide einen Nebel beobachten, kommen sie sich näher. Beide werden jedoch vom ''Delta-Flyer'' abgefangen. Allerdings wird nicht Kim gesucht, sondern Tal. Sie steht unter Verdacht das Varro-Generationenschiff mit Parasiten zu sabotieren und gesteht, dass sie es getan hat, da sich viele Varro eingeängt fühlen und das Generationenschiff verlassen wollen. Mit den parasiten will sie die Abtrennung der einzelnen Module erreichen, damit jeder für sich allein fliegen kann. Tal wird darauf auf das Generationenschiff gebracht. Nach der Besprechung, spricht Janeway mit Kim. Da er laut den Bioscans des Doktors eine biochemische Verbindung mit Tal eingegangen ist, wird sie ihn nicht vors Kriegsgericht stellen und sich auf der Krankenstation melden. Dies lehnt Kim jedoch ab. In einem persönlichen Gespräch, stellt er klar, dass er Tal liebt. Beide werden jedoch unterbrochen, als es auf dem Varroschiff zu Dekompressionen gibt. Kim schlägt vor, dass Integritätsfeld auf das Varroschiff auszudehnen, um die Trennung des Schiffs zu verlangsamen. Durch dieses Manöver, kann die Trennung so lange verlangsamt werden, dass alle Varro aus den geföhrdeten Bereichen evakuiert werden können. Nachdem sich die Kapseln getrennt haben, verabschiedet Kim sich von Tal, die mit den Dissidenten zum [[Natori-System]] fliegt. Daraufhin entschließt Kim sich, die Auswirkungen der [[Hormon]]e zu ertragen, anstatt ein Medikament zu nehmen. Im Kasino fragt ihn Seven, weshalb Kim eine Behandlung ablehnt. Sie meint, dass Liebe auch eine Quelle für Stärke sein kann und er bald wieder gesund werden soll. ({{VOY|Das Generationenschiff}})

Wenig später erhält die ''Voyager'' den Notruf von einem fremden Schiff. Paris steuert die ''Voyager'' dorthin, aber Kim kann nur noch Trümmer orten und es werden auch keine Überlebenden gefunden. Niemand an Bord der ''Voyager'' ahnt, dass es sich bei den Trümmern um eine [[USS Voyager (Silberblut)|duplizierte ''Voyager'']] aus Silberblut gehandelt hat und deren Crew erfolglos ums Überleben gekämpft hat. ({{VOY|Endstation – Vergessenheit}})

Kurz darauf löst Paris eine [[Jo-jo]] Manie aus und nach dieser beschäftigt sich die Crew mit einem weiteren Spielzeug von Paris. Kim glaubt das Spiel gelöst zu haben, aber er scheitert. Kurz darauf wird die ''Voyager'' von den [[Hazari]] verfolgt und diese kann nicht entkommen. Plötzlich erscheint [[Kurros]] von der [[Denkfabrik]] und bietet seine Hilfe bei diesem Problem an. Doch die Denkfabrik fordert als Preis Seven im Austausch für die Rettung der ''Voyager''. Allerdings findet die Crew heraus, dass die Denkfabrik die Hazari angeheuert hat, um die ''Voyager'' zu verfolgen. Schließlich gelingt es Janeway sich mit den Hazari zu verbünden, um die Denkfabrik aufzuspüren. ({{VOY|Die Denkfabrik}})

Einige Zeit später entdeckt die ''Voyager'' einen Malon-Frachter, der kurz vor der Explosion steht. Es werden Überlebende an Bord gebeamt und Controller [[Fesek]] informiert Janeway, dass der Frachter jeden Moment explodieren kann. Als Janeway den Befehl gibt den Abstand zu vergrößern, kollabiert das Warpfeld und Kim erkennt, dass die enorme Thetastrahlung den Subraum zerstört. Ein Außenteam beamt auf den Frachter, um dort die Explosion zu verhindern, damit die sonst dabei austretende Thetastrahlung nicht den ganzen Sektor verstrahlt. Während ein Außenteam versucht den Frachter zu stabilisieren, wird [[Pelk]] angegriffen und schwer verletzt. Daraufhin versucht Kim ihn mit dem Transporter zu erfassen, was jedoch nicht gelingt. Pelk erliegt wenig später seinen Verletzungen. Schließlich wird der Frachter in einen Stern der [[Spektralklasse O]], der die Thetastrahlung adsorbiert, gebracht und der Frachter explodiert dort. ({{VOY|Verheerende Gewalt}})

Wenig später beginnt Seven Interesse an romantischen Beziehungen zu zeigen. Als der Doktor dies bemerkt, beginnt dieser Seven alles über Romantik zu lehren. Seven wählt darauf eine Liste von Männern aus, mit welchen sie sich treffen will. Als Kim dies bemerkt, macht er sich sofort Hoffnung, doch Seven gibt ihm zu verstehen, dass sie kein Intresse an ihm hat. ({{VOY|Liebe inmitten der Sterne}})

Als sich die Führungsoffiziere über ihre Vorfahren unterhalten, berichtet Kim von seinem Urgroßonkel [[Jack (23. Jahrhundert)|Jack]], der mit einer Tiefenraummission zum [[Beta Capricus]] flog. Später nimmt Kim mit den anderen Führungsoffizieren an einer Feier zu Ehren ihrer Vorfahren im Kasino teil. ({{VOY|23 Uhr 59}})

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Während ein Außenteam einen Planeten untersucht, arbeitet Kim auf der Brücke und überwacht die Mission. Gleichzeitig hat der Doktor seinem Programm die Fähigkeit zu Tagträumen hinzugefügt. Jedoch haben die Algorithmen Fehlfunktionen. So versucht der Doktor den Warpkern auszustoßen, kann aber von Kim, Torres und Seven of Nine in letzter Sekunde davon abgehalten werden. Als der Doktor wenig später auf die Brücke kommt und behauptet ein Fremder hätte ihn in einem Tagtraum vor einem Angriff gewarnt, glaubt ihm zunächst niemand. Als Kim jedoch die Sensoren rekonfiguriert, entdeckt er drei getarnte Schiffe. Anschließend hilft er dem Doktor bei seiner Vorbereitung auf die Kommandoübernahme. Nachdem man Kontakt mit der Hierarchie aufnimmt, kommt es zum Gefecht und Kim meldet die Schäden am fremden Schiff. Dank eines Bluffs des Doktors, zieht sich das Schiff zurück und dem Arzt wird dafür ein Orden verliehen. Bei der Verleihungszeremonie ist Kim im Kasino anwesend und beruhigt den Doktor, dass er nicht träumen würde. ({{VOY|Dame, Doktor, As, Spion}})