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Als Captain Janeway und Chakotay wegen einer Infektion auf einem Planeten zurückgelassen werden müssen, nimmt sie an einer Besprechung der Führungsoffiziere teil. Er ist über den Befehl die beiden zurückzulassen entsetzt und widerspricht entschieden. Jedoch führt Tuvok den Befehl aus. Deswegen spricht er mit einigen aus der Sternenflottencrew und mit B'Elanna. Er fragt sie, wieso sie nichts unternehmen. Er will es nicht einfach akzeptieren, dass die beiden zurückgelassen wurden. Als kurze Zeit später ein vidiianischer Konvoi in Sensorenreichweite kommt, will er mit diesem Kontakt aufnehmen. Da er Tuvoks Befehl einen Ausweichkurs zu fliegen, infrage stellt und die anderen Brückenoffiziere zu einer Meinungsäußerung auffordert, lässt Tuvok ihn von der Sicherheit in sein Quartier bringen. Später wird er im Kasino von Hogan und [[Swinn]] angebsprochenangesprochen, die ihn darüber informieren, dass viele Besatzungsmitglieder der Meinung sind, dass man die Vidiianer kontaktieren sollte. Er spricht mit Tuvok und bespricht mit ihm die Verhandlungssituation. Er überzeugt Tuvok, dass sie mit den Vidiianern verhandeln sollten. Bei der anschließenden Kontaktaufnahme, ruft er das vidiianische Schiff, welches jedoch nicht antwortet. Stattdessen greift es die ''Voyager'' an. Beim anschließenden Kampf feuert er die Waffen ab und meldet Tuvok die Schäden. Schließlich können sie die Vidiianer besiegen und entkommen. ({{VOY|Entscheidungen}}) Nachdem ein Notruf von Seska empfangen wird, startet man eine Rettungsaktion für Chakotays vermeintlichen Sohn. Dabei trifft man auf ein beschädigtes Kazon-Shuttle mit [[Tierna]] an Bord. Harry und B'Elanna untersuchen das Shuttle und kommen zu dem Schluss, dass seine Geschichte plausibel ist. Nachdem die ''Voyager'' wiederholt durch Kazon-Schiffe angegriffen wird, meldet er, dass Deck 12 verwüstet ist und die sekundären Kommandoprozessoren beschädigt wurden. Bei einem anschließenden Kampf mit den Kazon meldet er die Schäden, welche nach Tiernas Selbstmordanschlag so schwer sind, dass die ''Voyager ''die Schlacht verliert. Harry wird mit den anderen gefangen genommen und auf dem [[Hanon-Planet|Hanon-Planeten]] ausgesetzt. ({{VOY|Der Kampf ums Dasein, Teil I}})